El análisis del transcriptoma completo es muy importante a la hora de comprender cómo las expresiones de variantes genéticas alteradas afectan a los fenotipos de plantas complejos. Life Technologies ofrece una amplia cartera de productos para el análisis de expresión génica, desde la secuenciación de transcriptomas y soluciones de PCR en tiempo real TaqMan® hasta productos para la investigación epigenética todo esto concebido para facilitar el análisis de la expresión génica de una manera rápida, fiable y precisa.

¿Cuáles son los diferentes enfoques para el análisis de expresión génica?

Los biólogos utilizan una variedad de enfoques para comprender la expresión génica. En algunos casos, es preferible el establecimiento del perfil de todo el transcriptoma a la secuenciación de ARN dirigida, que generalmente implica el uso de los paneles. Para el estudio de la genómica funcional de plantas, los investigadores también utilizan herramientas epigenéticas, estudios de miARN, ARN pequeño y ARNi de plantas para descifrar la causa raíz tras los fenotipos de interés. No importa la naturaleza de su estudio, Life Technologies dispone de una importante cartera de instrumentos, reactivos y soluciones para todos sus estudios de expresión génica.

Secuenciación de transcriptomas

En comparación con la tradicional tecnología de micromatrices, que solo pueden utilizarse para de perfiles de expresión génica en especies con secuencias de transcriptomas conocidas, las tecnologías de secuenciación de última generación permiten que los biólogos lleven a cabo estos estudios en cualquier especie vegetal, al tiempo que los realizan con ensayos que ofrecen un mayor rango dinámico a un menor costo. Si su objetivo es obtener el perfil del transcriptoma de toda la planta o utilizar la secuenciación de ARN para reducir la complejidad de un genoma poliploide, complejo y de gran tamaño, la secuenciación del transcriptoma nunca ha sido más fácil que con el sistema Ion Personal Genome Machine™ o los sistemas Ion Proton™.

El sistema Ion PGM™ es la mejor solución para la inmensa mayoría de transcriptomas de plantas (hasta 1 Gb) debido a su escalabilidad, simplicidad y velocidad:

Máquina Ion Torrent
  • Tiempos de ejecución más rápidos: 90 minutos para una secuenciación de 100 bases en el chip Ion 314™
  • El precio más asequible
  • Alta precisión
  • Longitud de lectura de 200 pb, lecturas de hasta 400 pb de longitud
  • 11 millones de pocillos, hasta 1 Gb en el chip Ion 318™
  • Un instrumento, varias aplicaciones: Secuenciación de novo, secuenciación de transcriptomas, identificación de genotipos por secuenciación, resecuenciación, etc.

Más información

Análisis de expresiones génicas dirigidas

Si su enfoque experimental se limita a unos pocos genes o ciertas áreas del transcriptoma, los ensayos de PCR en tiempo real con las sondas TaqMan® son el mejor método para usted. Con los instrumentos y el software de Applied Biosystems® de confianza, las mezclas maestras y los ensayos de expresión génica TaqMan® están diseñados específicamente para lograr el éxito. Más información:

Accesorios TaqMan
Desde unas pocas muestras y objetivos a
aplicaciones de alto rendimiento, hay un formato de ensayo TaqMan® que se adapta a sus necesidades.
 

Investigación epigenética, de miARN y ARN no codificante en plantas

Epigenética miRNA

La regulación de los genes en plantas se produce mediante cambios epigenéticos como la metilación del ADN, la estructura de la cromatina y ARN no codificantes (ARNnc). Estos procesos forman parte de un complejo circuito regulador que requiere herramientas sólidas para su estudio. Life Technologies ha desarrollado tecnologías sólidas para la investigación epigenética que incluyen la preparación de muestras, la secuenciación, la PCR cuantitativa, ensayos de análisis funcional y herramientas bioinformáticas para su análisis.

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