plant genotyping in cotton

El descubrimiento de nuevos polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) es fundamental para la identificación de genotipos de plantas a la hora de proporcionar muchos marcadores candidatos para los programas de selección asistida por marcadores en cultivos clave. Las recientes mejoras mediante PCR en tiempo real y secuenciación de última generación han simplificado el descubrimiento de SNP y lo han hecho mucho más rentable. Life Technologies ofrece una gama de soluciones para optimizar todas sus investigaciones de resecuenciación y ayudarle a alcanzar sus objetivos de producción y experimentales.

Lea la entrevista con Franziska Turck en MPI Cologne (Alemania) acerca de las ventajas del mapeo por secuenciación en su trabajo con el género Arabidopsis.

¿Por qué son importantes los SNP?

Los SNP son pequeñas variaciones en las secuencias de ADN que están asociadas con los rasgos deseados. Se utilizan junto con el mapeo de loci de rasgos cuantitativos (QTL, del inglés quantitative trait loci) para desarrollar ensayos para programas de selección asistida por marcadores concebidos para mejorar o potenciar determinadas características, tales como mayor rendimiento, mejor tolerancia al estrés o mejor resistencia a plagas.

Soluciones de resecuenciación dirigida de plantas y soluciones de análisis de SNP de Life Technologies

Descubra nuevos SNP en importantes variantes de cultivo mediante una estrategia de resecuenciación dirigida en el sistema Ion Personal Genome Machine™ (PGM™). A continuación, confirme sus descubrimientos con los ensayos TaqMan®, el estándar de oro para análisis SNP dirigidos o por secuenciación de Sanger en uno de los analizadores genéticos de la serie 3500 de Applied Biosystems®.

La siguiente tabla compara las mejores soluciones de nuestra cartera:

Necesidad de investigación Mejor enfoque experimental Plataformas Life Technologies ¿Por qué?
Comparar secuencias de diferentes variantes de mi cosecha a descubrir SNP funcionales Identificación de genotipos por secuenciación (GBS) Ion Torrent PGM™
  • Velocidad, precio, escalabilidad, simplicidad
  • PGM™ también admite aplicaciones de identificación de genotipos por secuenciación (GBS)
Asignar hasta 10 SNP en diferentes regiones del genoma Análisis de fragmentos

Identificación de genotipos de SNP mediante EC

Analizadores genéticos de la serie 3500

  • Capacidad de multiplexing: hasta 10 SNP por reacción
Asignar SNP en una pequeña región del genoma Secuenciación de Sanger

Secuenciación de Sanger mediante CE

Analizadores genéticos de la serie 3500

  • Nuevo referente para la secuenciación
  • Precisión, bajo coste
  • Flujo de trabajo sencillo
Confirmar mi supuesto SNP y desarrollar ensayos de SNP para trabajos posteriores Identificación de genotipos por PCR en tiempo real en plantas

Ensayos de identificación de genotipos de SNP TaqMan®

Mezclas maestras TaqMan®

Instrumentos de PCR en tiempo real

  • Flujo de trabajo fácil y rápido
  • Nuevo referente para análisis de SNP dirigidos
  • Alta tasa de llamadas y precisión
  • Diferentes formatos para diferentes tamaños de proyecto
    (n.º de SNP x n.º de muestras)

Análisis de variación del número de copias mediante ensayos TaqMan®

Los ensayos de números de copias TaqMan® se pueden utilizar para obtener unos resultados de números de copias específicos, reproducibles y fáciles de interpretar en muestras de plantas. Además, este método es rápido y sencillo, y el flujo de trabajo puede automatizarse para que varios cientos de miles de muestras se puedan procesar en un solo día. Pida los ensayos aquí.