Secuenciación de ARN

Un conocimiento detallado del contenido del ARN (codificante y no codificante) de una célula o una muestra de células determinadas es fundamental para comprender la expresión diferencial de los procesos normales y patológicos. La investigación mediante técnicas de secuenciación de ARN permite evitar algunos de los inconvenientes asociados al uso de micromatrices para la determinación de perfiles de ARN. Esto permite además una mejor determinación cuantitativa de la población de ARN de una célula (debido a un nivel de sensibilidad superior y a un intervalo analítico más amplio) y el uso de un método independiente de la hipótesis. Descifre el transcriptoma completo de una célula, el contenido del ARN pequeño o el perfil de expresión génica con la solución de secuenciación de ARN idónea.

Comparación de plataformas

Productos de secuenciación destacados
Solución de análisis de transcriptomas AmpliSeq™

Secuenciación de ARN de última generación (NGS) con la tecnología Ion Torrent™

Desde el análisis de la expresión génica dirigida hasta la secuenciación del transcriptoma completo, los productos Ion Torrent™ combinan un método de preparación de muestras sencillo y un análisis de datos intuitivo para ofrecer una solución de secuenciación de ARN integral.

From gene expression of known targets to whole transcriptome sequencing for discovery

Secuenciación de ARN dirigida

Perfiles de expresión génica de una serie de transcritos conocidos, incluidas la detección de la fusión génica y la cuantificación

Secuenciación de ARN pequeño

Análisis de transcritos de ARN pequeño conocidos y nuevos (incluido el miARN)

Secuenciación de transcriptomas dirigida

Expresión génica de transcritos de secuencias de referencia a partir de tan solo 10 ng de ARN y preparación de muestras compatible con la fijación en formol y la inclusión en parafina

Secuenciación de transcriptomas completos

Identificación y cuantificación de transcritos conocidos y nuevos, incluidas las fusiones génicas y las variantes de empalme

El análisis de transcriptomas completos específico de la cadena e independiente de la hipótesis permite la identificación y la cuantificación de transcritos conocidos y nuevos con un intervalo analítico cuantitativo superior en comparación con la tecnología de micromatrices. El sistema Ion Proton™, en combinación con la tecnología de purificación de ARN Ambion® y los kits de creación de genotecas Ion Torrent™, permite un flujo de trabajo de secuenciación fiable que combina un método de preparación de muestras sencillo y un análisis de datos intuitivo para la secuenciación de transcriptomas completos.

La secuenciación de transcriptomas completos es ideal para el descubrimiento, pero no necesariamente para el análisis de la expresión génica convencional. Aproveche la velocidad y la sensibilidad superior de la secuenciación de última generación (NGS) además de simplificar la preparación de muestras y el análisis de datos con la solución para transcriptomas Ion AmpliSeq™.  Procese > 20.000 transcritos de secuencias de referencia con tan solo 10 ng de ARN mediante flujos de trabajo de preparación de muestras rápida y compatible con la fijación en formol y la inclusión en parafina (FFPE), secuenciación y análisis de datos para garantizar el análisis sencillo de la expresión génica.

Los sistemas Ion PGM™ e Ion Proton™ permiten el análisis basado en la secuenciación de todos los transcritos de ARN pequeño conocidos y nuevos, como el microARN (miARN), el ARN interferente pequeño (ARNip) y el ARN de interacción con Piwi (ARNpi), de forma específica de la cadena e independiente de la hipótesis.

Los investigadores usan la secuenciación dirigida como una alternativa rápida y rentable a la secuenciación de genomas o transcriptomas completos mediante el análisis específico de conjuntos seleccionados de genes o regiones genómicas. La secuenciación de ARN dirigida mediante la tecnología AmpliSeq™ es un método de determinación de perfiles de la expresión génica basado en la secuenciación que permite la cuantificación de los niveles de ARN mensajero (ARNm) o ARN no codificante (ARNnc) dirigido con cantidades mínimas de ARN total: 500 pg de ARN no fijado o 5 ng de ARN aislado a partir de muestras fijadas en formol e incluidas en parafina.