marker-assisted selection in corn

标记辅助选育、基因分型、拷贝数分析或检测单核苷酸多态性 (SNP) 的高效、高通量方法能够提高我们对如何培育具有所需性状(如更高产率或更好的疾病抗性)作物的了解。我们提供各种技术促进您的培育和功能基因组学研究,将重要特征与基因变异型(包括 SNP 和 AFLP)联系在一起,构建数量性状基因座 (QTL) 谱图并确定遗传标记以开展标记辅助选育 (MAS) 项目。

QTL 谱图和标记辅助选育 (MAS) 是什么?

QTL(数量性状基因座)分析将具有 DNA 碱基变异的基因标记(如单核苷酸多态性 [SNP] 和微卫星或简单重复序列 [SSR])与感兴趣 的QTL 关联起来,以用于培育。随后将谱图与下游标记辅助选育程序相连接,以筛选具有感兴趣性状的单个植株。根据项目,这些性状可能是产量增加、抗病性或抗逆性增强、营养成分或油脂含量提高。

如果我正在使用 SNP 标记用于培育,最佳方法是什么?

根据您的具体需求,选择最佳实验方法和技术平台。您项目中要考虑的两个关键因素是样品数量和标记数量。下表显示了不同技术的高水平代表,我们可以向您提供这些技术,用于正确植物品系的选育、将转基因植物移至温室或田间、或者为您的出版物搜集关键数据。

通过测序的基因分型 (GBS)
IPGM™ 系统

  • 总项目成本低
  • 工作流程快捷
  • 灵活
  • 价格实惠

TaqMan® 测定或 HRM

  • 工作流程简单
  • 快速
  • 金标准 (TaqMan®)
  • 高检出率和准确性 (TaqMan®)
  • 极低成本 (HRM)

基因分析仪上的片段分析

  • 最大 384 个样品,10 个微卫星序列
  • 多通路能力

TaqMan® 测定 QuantStudio™ OpenArray® 系统/体系

  • 成本低
  • 经验证的 TaqMan®化学品
  • 简化的工作流程
  • 减少耗材
    和步骤

Douglas Array Tape™ 的 TaqMan® 测定

  • 高通量
  • 自动工作流程
  • 成本低
  • 经验证的 TaqMan®化学品

如何将不同的方法进行比较?

  片段分析 (SRR) Ion AmpliSeq™ 通过测序进行基因分型 TaqMan® 测定常规 qPCR 仪器 高分辨率
熔解曲线分析 (HRM)
TaqMan® 测定 QuantStudio™ OpenArray® Douglas Array Tape™ 的 TaqMan® 测定
样品通量1-5001-1,0001-5001-500500-4,000500–百万
标记通量1-100100-5,0001-1001–? 16-5121-100
每个数据点的成本低至中等非常低非常低
规格和灵活性多通路,最多 20 个 SSR/样品IAmpliSeq™ 定制板(引物池)可用于在单块 318™ 芯片上分析 16 个样品中最多 1,536 扩增子单管,48 孔,96/96 FAST 孔和 384 孔单管,48 孔,96/96 FAST 孔和 384 孔OpenArray® 板外加 4 个额外的区块以适合不同的样品/标记通量Array Tape™ 平台
要回答的 DNA4 小时1 天40 分钟(快速)
2 小时(标准)
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给 QTL 谱图和标记辅助选育带来哪些新的内容?