Die vollständige Transkriptomanalyse ist unerlässlich, wenn man verstehen will, auf welche Weise die geänderte Expression genetischer Varianten zu den komplexen Pflanzen-Genotypen beiträgt. Life Technologies bietet ein umfangreiches Produktportfolio für die Genexpressionsanalyse, von Transkriptomsequenzierung und TaqMan® Echtzeit-PCR-Lösungen bis hin zu Produkten für die epigenetische Forschung—, die alle darauf ausgerichtet sind, eine schnelle, zuverlässige und exakte Genexpressionsanalyse zu ermöglichen.

Die verschiedenen Ansätze der Genexpressionsanalyse

In der Pflanzenforschung bedient man sich einer Reihe von Ansätzen, um der Genexpression auf den Grund zu gehen. In einigen Fällen bevorzugt man eine Gesamt-Transkriptomprofilierung gegenüber der gezielten RNA-Sequenzierung, für die im Allgemeinen Panels erforderlich sind. Zur Untersuchung der funktionalen Pflanzengenomik verwenden Forscher u. a. epigenetische Hilfsmittel sowie Studien der Pflanzen-miRNA, der kleinen RNA und RNAi, um so den Ursprung der relevanten Phänotypen zu entschlüsseln. Unabhängig vom Objekt Ihrer Untersuchungen bietet Life Technologies ein marktführendes Portfolio an Geräten, Reagenzien und Lösungen für alle Ihre Genexpressionsstudien.

Transkriptomsequenzierung

Im Vergleich zur herkömmlichen Mikroarray-Technologie, die nur bei Arten mit bekannten Transkriptomsequenzen zur Genexpressionsprofilierung eingesetzt werden kann, ermöglichen die Sequenzierungstechnologien der neuesten Generation den Forschern solche Studien an beliebigen Pflanzenarten. Dies geschieht mit Assays, die einen höheren Dynamikbereich bei geringeren Kosten aufweisen. Wenn es Ihr Ziel ist, das gesamte Pflanzentranskriptom zu profilieren oder mit RNA-Sequenzierung die Komplexität eines großen, komplexen polyploiden Genoms zu verringern, dann war die Transkriptomsequenzierung nie leichter als jetzt mit der Ion Personal Genome Machine™ oder den Ion Proton™ Systemen.

Das Ion PGM™ System ist die beste Lösung für die große Mehrzahl von Pflanzentranskriptomen (bis zu 1 GB), was auf seine Skalierbarkeit, Einfachheit und Geschwindigkeit zurückzuführen ist:

The Ion Torrent machine
  • Schnellste Reaktionszeiten: 90 Minuten für 100-Basen-Sequenzierung auf dem Ion 314™ Chip
  • Kostengünstigster Preis
  • Hohe Genauigkeit
  • 200 bp Leseweite, bis zu 400 bp Leseweite
  • 11 Millionen Wells, bis zu 1 GB Ausgabe mit Ion 318™ Chip
  • Ein Gerät, viele Anwendungen: de novo Sequenzierung, Trankriptomsequenzierung, Genotypbestimmung durch Sequenzierung, Resequenzierung usw…

Weitere Infos

Gezielte Genexpressionsanalyse

Wenn Ihr experimenteller Ansatz auf nur wenige Gene oder bestimmte Bereiche des Transkriptoms beschränkt ist, stellen die Echtzeit-PCR-Assays mit TaqMan® Sonden für Sie den besten Ansatz dar. Mit den erprobten Applied Biosystems® Geräten und der entsprechenden Software sind die TaqMan® Genexpressions-Assays und die Master Mixes maßgeschneidert für den Erfolg. Weitere Informationen:

TaqMan Accesories
Ob nur wenige Proben und Ziele oder Anwendungen
mit hohem Durchsatz – es gibt ein TaqMan® Assay-Format, das Ihrem Bedarf entspricht.
 

Epigenetische, miRNA- und nichtcodierende RNA-Forschung an Pflanzen

Epigenetics miRNA

Die Genregulation wird bei Pflanzen oft durch epigenetische Veränderungen wie DNA-Methylierung, Chromatinstruktur und nichtcodierende RNAs (ncRNAs) beeinflusst. Diese Prozesse sind Teil eines komplexen regulatorischen Kreislaufs, für den robuste Untersuchungsverfahren erforderlich sind. Die von Life Technologies entwickelten leistungsstarken Verfahren zum Studium epigenetischer Prozesse reichen von der Probenvorbereitung, Sequenzierung und quantitativen PCR bis hin zu funktionellen Assays und Analysewerkzeugen der Bioinformatik.

Überblick über alle unsere Lösungen