selección asistida por marcadores en el maíz

Los métodos de alto rendimiento eficaces para la selección asistida por marcadores, la identificación de genotipos, el análisis de número de copias o la detección de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) están mejorando nuestros conocimientos sobre el cultivo de cosechas con los rasgos deseados, tales como una mayor productividad o una mayor resistencia a enfermedades. Ofrecemos una amplia gama de tecnologías para facilitar los estudios de genómica funcional y su cultivo, asociar rasgos importantes con variantes genéticas (incluidos SNP y AFLP), construir mapas de loci de rasgos cuantitativos (QTL) e identificar marcadores genéticos para programas de selección asistida por marcadores (MAS).

¿Qué es el mapeo de QTL y la selección asistida por marcadores (MAS)?

El análisis de loci de rasgos cuantitativo (QTL) vincula marcadores genéticos con variaciones de bases del ADN, como polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y microsatélites o repeticiones de secuencias simples (SSR), con los QTL de interés para su cultivo. A continuación, estas se utilizan en un mapeo de vinculación y en programas de cultivo asistidos por marcadores posteriores para detectar plantas individuales que presenten los rasgos de interés. En función del programa, estos rasgos podrían aumentar el rendimiento, la resistencia a enfermedades o al estrés o mejorar los perfiles nutricionales o de aceite.

¿Cuál es el mejor método si estoy utilizando marcadores de SNP para cultivo?

La elección del mejor método experimental y plataforma tecnológica depende de sus necesidades específicas. Dos elementos clave a considerar son el número de muestras y el número de marcadores de su proyecto. El gráfico a continuación proporciona una representación de alto nivel de las distintas tecnologías que tenemos para ayudarle en la selección de estirpe de semilla de la planta adecuada, en el desplazamiento de una planta transgénica al invernadero o al campo o en la recopilación de datos críticos para su publicación.

Identificación de genotipos por secuenciación (GBS) del sistema
IPGM™

  • Bajo coste total de proyecto
  • Flujo de trabajo rápido y sencillo
  • Flexibilidad
  • Asequibilidad

Ensayos TaqMan® o HRM

  • Flujo de trabajo sencillo
  • Rapidez
  • Referente del sector (TaqMan®)
  • Alta tasa de llamadas y precisión (TaqMan®)
  • Muy bajo coste (HRM)

Análisis de fragmentos en un analizador genético

  • Hasta 384 muestras, 10 microsatélites
  • Capacidad de multiplexing

Ensayos TaqMan® en sistema QuantStudio™ OpenArray®

  • Bajo coste
  • Química probada de TaqMan®
  • Flujo de trabajo optimizado
  • Menos consumibles
    y pasos

Ensayos TaqMan® en Douglas Array Tape™

  • Gran capacidad de procesamiento
  • Flujo de trabajo automatizado
  • Bajo coste
  • Química probada de TaqMan®

¿En qué difieren estos métodos?

  Análisis de fragmentos (SRR) Identificación de genotipos por secuenciación Ion AmpliSeq™ Instrumento de qPCR para ensayos TaqMan® Análisis mediante fusión de alta resolución (HRM)
Ensayos TaqMan® QuantStudio™ OpenArray® Ensayos TaqMan® en Douglas Array Tape™
Procesamiento de muestras 1-5001-10001-500 1-500 500-4000 500 millones
Rendimiento del marcador 1-100100-50001-1001–? 16-5121-100
Coste por punto de datosMedioBajo-MedioMedioMuy bajoBajoMuy bajo
Formatos y flexibilidadMultiplex de hasta 20 SSR por muestraLos paneles personalizados IAmpliSeq™ (agrupación de cebadores) pueden utilizarse para analizar hasta 1536 amplicones en 16 muestras de un solo chip 318™Tubo único, 48 pocillos, 96/96 pocillos FAST y 384 pocillosTubo único, 48 pocillos, 96/96 pocillos FAST y 384 pocillosPlatinas OpenArray® junto con cuatro bloques adicionales para diferentes capacidades de muestras/marcadoresPlataforma Array Tape™
De ADN a resultados4 h1 día40 minutos (RÁPIDO)
2 h (estándar)
1 h4 hDe 3 h a 1 día
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¿Nuevo en el mapeo de QTL y en la selección asistida por marcadores?