カスタムIon AmpliSeqターゲットNGSパネル

What is Ion AmpliSeq technology?

 

Ion AmpliSeqは、サーモフィッシャーサイエンティフィックが開発したターゲット次世代シーケンス（NGS）テクノロジーです。特定の標的ゲノム領域の増幅により、NGSワークフローを簡素化および合理化するように設計されています。Ion AmpliSeqは、Ultrahigh-multiplexPCRを基盤とした独自のターゲット選択テクノロジーにより、特定の遺伝子パネルやカスタムターゲット領域を高効率で高感度にシーケンスすることができます。この技術は、がん研究、遺伝性疾患研究、感染症研究、薬理ゲノミクス研究など、さまざまなトランスレーショナルリサーチおよび臨床研究アプリケーションで広く採用されています。

カスタムNGSパネルの設計

Ion AmpliSeq Designerは無料のオンラインツールで、お客さまの研究用途に適したNGS解析に合わせてカスタマイズされたIon AmpliSeqパネルを簡単に設計できます。

Ion AmpliSeqパネルフライヤー

NGSを用いた特定の臨床研究やアンプリコンベースのターゲットNGS解析用のカスタムIon AmpliSeqパネルの詳細をご覧ください。

What are the advantages of Ion Ampliseq technology?

Ion AmpliSeqテクノロジーは、ターゲットNGS解析の信頼できるアンプリコンベースのエンリッチ法として広く認められています。 高速、簡単、拡張性の高いNGSソリューションは、多くの研究者がIon AmpliSeqテクノロジーを選択しています。

 

Ion AmpliSeqテクノロジーには、 トランスレーショナル研究および臨床研究アプリケーションなど広くお使いいただく、いくつかの利点があります。

 選択的かつ特異的な増幅 

Ion AmpliSeqテクノロジーにより、標的とする特定のゲノム領域を選択的に増幅し、ターゲット遺伝子パネル領域またはカスタムターゲット領域を集中的なシーケンスを行うことができます。このターゲット増幅は、シーケンシングライブラリの複雑さを軽減し、カバレッジの深さを改善し、標的領域の変異を検出する感度を高めます。

High multiplexing capability

Ion AmpliSeq PCR反応は、1回の反応で数百から数千のターゲットを増幅できるため、複数のサンプルを同時に効率的かつ費用対効果の高いシーケンスにすることができます。この高いマルチプレックス機能により、必要なインプットDNAの量が最小限に抑えられ、シーケンシングスループットが最大化することができます。

  簡単で合理化されたワークフロー

Ion AmpliSeqワークフローは、最適化されたプライマーカスタムデザインと標準化されたライブラリ調製プロトコルにより、シンプルで使いやすいように設計されています。この合理化されたワークフローにより、ハンズオン時間が短縮され、エラーの可能性が低減され、さまざまなレベルの専門知識を持つユーザーがアクセスできます。

カスタマイズ性

Ion AmpliSeq技術では、カスタム遺伝子パネルまたはターゲットの設計が可能で、研究者は臨床研究ニーズに関連する特定の関心領域に集中することができます。このカスタマイズ可能性により、がん研究、 遺伝性疾患研究、感染症研究などのさまざまな分野でターゲットシーケンスが容易になります。

  データ解析と解釈

サーモフィッシャーサイエンティフィックは、Ion AmpliSeqシーケンシング結果のデータ解析と解釈をサポートする包括的なバイオインフォマティクスツールとリソースを提供しています。これらのツールは、変異解析、アノテーション、およびダウンストリーム解析に役立ち、シーケンシングデータから有意義な知見を得るのに役立ちます。

オンデマンド遺伝子パネルは、いつ、どのように必要となるのでしょうか

Ion AmpliSeq On-Demandパネルは、より小さなパックサイズで、遺伝性疾患研究に関連することが知られている遺伝子の最適化されたカタログから、実用的かつ簡単にカスタマイズできるパネルです。

Ion AmpliSeqテクノロジーのアプリケーション

複雑な遺伝性疾患を調べるときには、目的の遺伝子の変異を分析する柔軟かつ迅速な発見と検証ツールが必要です。Ion AmpliSeqテクノロジーはそれを実現します。

 

Ion AmpliSeqテクノロジーは、トランスレーショナル研究や臨床研究での幅広いアプリケーションに使用できます。主なアプリケーションには、次のようなものがあります。

  がん研究

Ion AmpliSeqテクノロジーは、がん関連遺伝子およびバイオマーカーのターゲットシーケンスを可能にし、体細胞変異、コピー数多型、および遺伝子融合の特定を可能にします。腫瘍の不均一性の研究、臨床研究環境で潜在的な関連ターゲットの特定、 および研究サンプルの遺伝子検査に使用できます。

 遺伝性疾患研究

Ion AmpliSeqテクノロジーは、遺伝性疾患に関連する遺伝的変異の同定を容易にします。遺伝子パネルシーケンシングに使用することで、遺伝性疾患のバイオマーカーの検査、キャリア状態の評価、着床前の遺伝子検査の実施に使用できます。

  感染症研究

Ion AmpliSeq技術は、特定の病原体またはそのゲノムの関心領域を標的にすることにより、感染症の研究に使用できます。これにより、微生物株の同定と特性評価、発生状況の追跡、薬剤耐性機構の研究が可能になります。

 薬理ゲノミクス研究

Ion AmpliSeq技術は、薬物代謝酵素（DME）のゲノム変異が薬物の有効性と安全性にどのように影響するかを調べる臨床研究に最適です。

 法医学遺伝学

Ion AmpliSeq技術は、法医学研究に使用されており、個々の同定、血縁関係の決定、および生物学的証拠の分析のために特定の遺伝子マーカーを分析します。

One NGS test for CNV, SNP, indel, and fusion detection

 

high-multiplex PCR に基づいた簡単で汎用性の高い技術により、SNP、インデル、融合遺伝子、コピー数変異などの変異タイプ全体で何十から何百種類もの遺伝子をターゲットとすることができます。

Ion AmpliSeqパネルを使用してNGSで何ができるでしょうか？結果が得られます。

 

25,000を超えるカスタムデザインと多数の出版物により、カスタムIon AmpliSeqパネルは 卓越したカバレッジ均一性、再現性、 特異性を実現した実績があり、結果取得に役立ちます。

Ion AmpliSeq パネル

すぐに使用できるMade-to-Order Panels、On-Demand Panelsなど、Ion AmpliSeqパネルはオリゴヌクレオチドプライマーのペアのプールで構成されており、各ペアは特異ゲノム領域を増幅するよう設計されています。各パネルは遺伝子全体のすべての塩基を調べる、または、特異的変異ホットスポットにフォーカスするように設計できます。

On-Demandパネル

Ion AmpliSeq On-Demandパネルは、初期コストの障壁とリスクを軽減し実用的にカスタマイズすることができ、、正しく機能するよう事前にテストし、最適化された遺伝子からより小さなサイズでのカスタムパネルのデザインを可能にします。

 

Oncomine tumor-specific panels

Oncomine tumor-specific panelsは、がん研究に関連する事前テスト済み遺伝子のうち厳選して作成された、設計済みでありながらカスタマイズ可能な12のパネルです（15～30遺伝子）。

Community panels

Ion AmpliSeqコミュニティパネルは、最先端の疾患研究者からの情報を基に設計されており、がん、遺伝性疾患、微生物および感染症の研究のためのターゲットシーケンスを提供する性能が検証されています。ほとんどのコミュニティパネルは、お客様のニーズに適した領域や遺伝子を追加または削除するようにカスタマイズできます。

Made-to-order panels

Ion AmpliSeq Desighnerツールを使用し、オンラインで目的の遺伝子名を入力するだけでカスタム設計されたIon AmpliSeqパネルを、柔軟性高くデザインすることができます。多数のリファレンス遺伝子からお選びいただくか、独自のリファレンスシーケンスをアップロードしてください。

Ready-to-use panels

すぐに使える便利なデザインのIon AmpliSeqパネルにより、研究者は手間のかかるプライマー設計やターゲット選択のステップなしに、データの生成と解析に集中することができます。

Exome panel

Ion AmpliSeqエクソームRDY S5キットでは、DNAから変異型まで、たった2日間でゲノムの主要エキソン領域の迅速かつ正確なシーケンシングが可能です。

Transcriptome panels

Ion AmpliSeqトランスクリプトームヒト遺伝子発現キットは、RefSeqデータベースからの既知の転写産物の従来の遺伝子発現解析に理想的です。

RNA-seqパネル

20,000種を超える遺伝子から選択し、遺伝子発現変化をわずか500 pgのRNA、あるいは5 ngのFFPE RNAよりが解析できます。

さらなる高感度が必要ですか？

独自のパネルを設計し、非常に低い検出限界（0.1％まで）で変異を検出するには、Ion AmpliSeq HDテクノロジーをお試しください。この新しいライブラリ増幅技術により、研究者は、血中を循環する腫瘍DNAの低頻度アレルやわずかな病原微生物種の検出のように、超高感度検出が必要なときに答えを得ることができます。

「ヒトサンプルではないのだけれど…」No problem.

 

定義されている13種類のゲノム、またはリファレンスファイルをアップロードして独自のリファレンスゲノムからカスタムパネルを設計できます。

Ion Torrent次世代シーケンサシステム

Ion AmpliSeqパネルは、Ion GeneStudio S5システムおよびIon Torrent Genexusシステムの両方に対応しており、簡便な操作、自動化された機能、迅速なNGS解析結果をわずか24時間で提供します。（ご利用の装置やアッセイによっては24時間以上かかることがあります）。

Ion GeneStudio SSシステム

小規模プロジェクトも大規模プロジェクトもサポートできる拡張可能なターゲットNGS

Ion GeneStudio S5システムは、幅広いアプリケーションとスループット能力を持つターゲットNGSの主力機器です。

Ion Torrent Genexusシステム

検体からレポート取得まで1日で完了するエンドツーエンドの自動化ワークフロー

Genexusシステムは、試料からレポートまでのワークフローを自動化し、わずか24時間で結果を提供するオールインワンのNGSソリューションです。ユーザーの操作はわずか2回で済みます。

Ion AmpliSeq パネル

動画：Ion AmpliSeqテクノロジーはどのように役立つのでしょうか？

動画：サンガー法シーケンシングからの移行を検討していますか？簡単に始めることができます。

関連ページ

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.