寡核苷酸(oligos)是由合成DNA或RNA组成的短单链分子,它们是许多分子生物学和合成生物学应用的起点!从基因检测到法医学研究,再到下一代测序,一条寡核苷酸(oligo)很可能就是实验的起点。

寡核苷酸是如何制造的?
定制DNA寡核苷酸是通过一种叫做合成,或者更具体地说,是固相化学合成的方法制备的。在这种方法中,四种核酸A、T、C和G被逐一添加,以形成不断增长的核苷酸链。它们是在一种称为磷酰胺基寡核苷酸构建块上组装起来的。在每一次将一个新的碱基添加到另一个碱基上的循环过程中,链以3’到5’方向增长。合成结束时,也就是所有循环都完成后,就得到了一条全长寡核苷酸。完成后,通常会进行脱盐处理,有时甚至会进一步纯化。脱盐可以去除在合成过程中使用的盐分。经过这一步后,寡核苷酸就可以用于PCR等应用了。
然而,在合成过程中也会产生较短的链或失败序列。这是因为没有任何化学反应能达到100%的效率,每次添加碱基时,都有可能未能成功连接,从而形成较小的侧链。这些较小的侧链或失败序列在某些后续应用中可能与全长序列竞争,并可能影响实验结果。如果下游应用只需要全长序列,那么还有其他几种纯化方式,可以通过去除这些失败序列来获得更纯净的寡核苷酸。这些方法包括HPLC、柱式纯化或PAGE。像NGS(下一代测序)或诱变这样的应用需要非常纯净的寡核苷酸。
寡核苷酸用于什么用途?
寡核苷酸最常见的应用例子是PCR,即聚合酶链式反应。PCR是一种将DNA片段或链复制成许多拷贝的技术,从而生成数千或数百万个更多的拷贝,用于后续如克隆或测序等应用。研究人员使用长度在20-35个碱基之间的寡核苷酸,称为引物,来启动复制或扩增。这种DNA引物通常是根据目标DNA序列定制设计,以便进行复制。研究人员能够为实验设计自己的定制DNA寡核苷酸,这一能力为分子生物学和合成生物学等领域开启了新的大门。这些进步有助于推动开创性的研究,使我们的世界更加健康、清洁和安全。
仅供科研使用。不用于诊断程序。





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