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PRRS 病毒监测: PCR 病毒测序和病毒检测的作用

PRRSV 具有高度变异性,因此我们需要持续监测 PRRSV 菌株才能确保提供最新的 PCR 解决方案,使我们的客户能够自信地操作并检测所有有关的菌株。 使用测序技术监测流行的欧洲 PRRSV 菌株可对从现场样本直接分离的 RNA 进行测序。 测序方法可识别新的 PRRSV 菌株,提高诊断工具进行 PRRSV 检测的性能。 正在开发的 Applied Biosystems VetMAX PRRSV EU & NA 检测旨在增强现场 PRRSV 监测计划的功效,它可检测 PRRSV 欧洲基因型的四个亚型,诊断灵敏度为 99%。 Thermo Fisher Scientific 提供一系列经过调整的工作流程,其范围涵盖从采样、萃取方法到测序解决方案。

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VetMAX PEDV/TGEV/SDCoV 试剂盒评估,一种用于检测猪冠状病毒的多重实时 RT-PCR 方法

Applied Biosystems VetMAX PEDV/TGEV/SDCoV 试剂盒开发时使用了从现场获得的各种类型和环境样本和相关样本,具有高特异性和灵敏度。 为检查该试剂盒相对于竞争对手的解决方案的性能,我们将其与市场上大量使用的两种具有可比性的试剂盒进行比较。 感染 PEDV (N=15)、TGEV (N=10) 和 SDCoV(N=14) 的环境、口腔液和粪便样本从现场获得,测试包含阴性、阳性和无模板对照。 根据制造商的建议,在 Applied Biosystems 7500 快速实时 PCR 系统上运行这三家制造商的试剂盒的 RT-qPCR。 VetMAX PEDV/TGEV/SDCoV 试剂盒一致显示与其他测试的试剂盒同等或更好的结果,具有比其中一种试剂盒一致更低的 CT,具有比另一种试剂盒更高的信号与基线噪声比。

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新型肺结核的发展和验证实时 PCR 试剂盒

牛肺结核 (TB) 是影响牛和野生动物的一种慢性疾病,主要由牛结核分枝杆菌引起。 Applied Biosystems™ VetMAX™ M. 结核菌群试剂盒 (MTBC) 是一种新型分子工具,可以同时检查属于结核菌群 (MTBC) 和内部对照的分枝杆菌。 为证明该试剂盒的性能,对牛和多种野生动物进行了验证研究。

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VetMAX™-Gold MAP 检测试剂盒的开发和验证

USDA 授权的 VetMAX™-Gold MAP 检测试剂盒是对牛粪提纯 MAP DNA 进行快速体外检测的实时 PCR 检测技术。 该检测以 MAP 基因组中独特的序列元素为目标,可以提供高度灵敏且具体的结果。 此研究的目的是确定 VetMAX™-Gold MAP 检测试剂盒检测个体和混合牛粪样本中提取的核酸 MAP DNA 的性能特征。

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利用 Xeno 内部阳性对照首次即获得正确结果

用于诊断性 qPCR 测试的动物样本基质可能含有各种 PCR 抑制剂,可能导致假阳性结果。 为了提供一种解决方案以帮助更准确地诊断农场动物的健康,我们开发了一种内部阳性对照,可以方便地与现有 TaqMan™ 工作流程整合以测试是否存在 PCR 抑制剂,从而降低假阴性结果的风险。

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利用测序技术监控欧洲 PRRSV 菌株

PRRS 是单股正链 RNA 包膜病毒造成的,该病毒突变率高,使菌株间核苷酸序列有更大的异质性。 高度的基因病毒多样性增加了实时 RT PCR 诊断工具灵敏度降低的风险。 本研究的目的是利用毛细 ORF7 测序和 NGS 技术监控欧洲流行的 PRRSV 菌株。

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墨西哥奇瓦瓦州肉牛胎儿三毛滴虫患病率,使用 MagMAX™ 样品制备系统和 VetMAX™-Gold 滴虫病检测试剂盒进行测试

墨西哥特别是奇瓦瓦州牛滴虫病的患病率尚未知,因为尚未进行广泛的诊断性测试。 因此,本研究的目的就是利用以实时 PCR(获得美国农业部 [USDA] 许可的 VetMAX™-Gold 滴虫病检测试剂盒)为基础的分子诊断测试估计奇瓦瓦州肉公牛滴虫病的患病率。

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SIV 检测的完整工作流程解决方案的开发和验证

我们已经验证了一个 SIV 测试工作流程,包含猪鼻拭样本的高吞吐量核酸纯化、SIV 检测和 SIV 子类型化。 SIV 可使用 USDA 许可的 VetMAX™-Gold SIV 检测试剂盒进行检测,这是单管、一步式实时 RT-PCR 试剂盒,用于快速而准确地筛查甲型流感。该测试以 SIV 基因组的三个独立区域为目标,可以大幅降低因病毒基因组变异造成的假阴性次数。

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PRRSV 畜群管理的更早期、更简易的诊断工具: 现场条件下采样和患病率的对比

几项研究的主要目的是比较口液和血液/血清与组织采样方法,并为现场条件下早期诊断 PRRSV 推荐一种更简单的口液采样方法。 Thermo Fisher Scientific 已让全球多家实验室和研究机构使用 800 多个不同基因型的现场样本对实时 PCR 工具进行了评估。 欧洲和北美的现场研究可对试剂盒的口腔液样本性能进行评估。

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现场条件下使用口腔液作为一个诊断步骤来检测和确定 PRRSV 发病率的新见解

根据欧洲和北美猪繁殖与呼吸综合征病毒 (PRRSV) 菌株的实验,口腔液 PRRSV 的检测几率与血清 PRRSV 患病率显著相关 (p<0.0001)。 如果血清发病率高于 50%,则在口液样本中检测此病毒的几率接近 1。 所以,口腔液采样是在畜群级别上检测 PRRSV 的优秀工具,但不适合检测此疾病的患病率。

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新型非洲猪瘟实时 PCR 试剂盒的开发和验证

非洲猪瘟病毒 (ASFV) 是一种必须注意的高传染性疾病,会造成严重经济损失。 因为目前尚没有可用的疫苗或治疗手段,所以通过诊断监测 ASFV 是唯一的控制方式,而且至关重要。 我们开发了新型双重实时 PCR 试剂盒,以 p72 基因和内部对照为目标,并对其诊断 ASFV 的性能进行了评估。

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为什么全国滴虫病监管和实验室检测方法的标准化对牛肉生产商有重要意义

Kathy Simmons 医生,首席兽医,美国牛肉协会,华盛顿特区。 对州际运输牛制定统一的州滴虫病规定有益于以商业速度运输牛。 相邻州间定义清晰、周全且双方都接受的滴虫病测试流程可以避免冗余的测试流程,减少因重复或不必要的测试对动物和操作者产生危险。*

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堪萨斯州如何从无滴虫病规定转向实施当前的滴虫病规定和接受的诊断测试方法

Bill Brown 医生,动物健康委员,堪萨斯农业部,堪萨斯州托皮卡。 堪萨斯为州际更改所有权和畜牛的州际移动与诊断制定更全面的新滴虫病规定概览。 Brown 医生指定了由四名兽医和四名牛肉制造商组成的滴虫病工作小组来带头评估堪萨斯州滴虫病管理的改进。*

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为什么州滴虫病规定和实验室测试流程的标准化都可以使兽医及其牛肉制造商客户受益

Jeremy VanBoening 医生 - 共和党山谷医疗中心,阿尔玛/霍尔布鲁克/富兰克林内布拉斯加。 VanBoening 发现州诊断实验室推荐的样本处理方案有很大差异。 实验室差异表现在样本是否需要培养,是否放到冰块里、样本运输方式以及实验室的首选收集介质。 样本收集和处理的标准化实验室建议有助于提高测试样本的质量。*

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使用 Ion PGM™ 测序仪开发甲型流感测序工作流程以改善监测

完整基因组测序是持续识别、监测和特征化甲型流感的关键。对病毒基因组测序时,在库制备过程中会同时处理背景宿主核酸,导致测序反应,其中大部分读数会被宿主基因组占有。 这个问题的解决方案之一就是预扩增

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IAV
接种猪口腔液和鼻拭子甲型流感病毒检测

使用鼻拭检测猪 IAV 非常耗人力,而且对于非发热猪相对不敏感 (1)。 口液样本作为替代方案已被证明对于多种猪呼吸道病毒 (2,3,4) 都是优异的监测样本。 本研究的目的就是对比 RT-PCR、病毒隔离 (VI) 和 VetScan (Abaxis Inc.) 对 IAV 的检测率。

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商用实时 PCR 检测和牛粪样本 MAP HEYM 培养的相关性

副结核分枝杆菌 (MAP) 疾病控制程序依赖于感染动物检测工具的精度和灵敏度。 培养式 MAP 检测需要数周时间,而 PCR 检测速度非常快。 有多种商用和多种用户设计的实时 PCR 检测可用于检测牛粪样本中的 MAP。

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为持续感染牛建立推测性诊断阈

牛病毒性腹泻病毒会感染牛,为牛肉和牛奶产业带来巨大的经济损失。 母体 BVDV 感染会降低免疫耐受性,导致奶牛一生被持续感染 (PI)。 持续感染的动物会持续传播病毒,是畜群中 BVDV 感染的主要来源。急性或暂时性感染的动物会传播疾病并表现为

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胎儿三毛滴虫培养样品混合,之后使用 MagMAX™ 样品制备系统并使用 Applied Biosystems qPCR 试剂扩增

此研究的目标是 1) 比较个别胎儿三毛滴虫测试时使用的多个样品制备工作流程(煮沸,QIAGEN,MagMAX™)和诊断测试实验室当前利用 MagMAX™ 和 Applied Biosystems VetMAX™试剂使用的实时 PCR 检测,和 (2) 评估可行性。

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多样品基质的标准化样品制备

处理不同的样本基体有许多不同的方法。 对于处理多样本类型的研究人员,这可能导致混淆和挫折。 本摘要说明了 MagMAX™ Pathogen RNA/DNA 试剂盒,它可以实现一个较标准化的解决方案,使实验室只需订购一个试剂盒即可用于多种样本基体以及各样本不同的输入体积。 这样实验室可以使用。

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