全转录组分析在了解基因变异体的异常表达如何影响复杂的植物表型中非常重要。赛默飞为基因表达分析提供了全面的产品组合,从转录组测序和 TaqMan®实时 PCR 解决方案到表观遗传学研究产品,—旨在以快速、可靠和准确的方法推进基因表达分析。

基因表达分析有哪些不同方法?

植物研究人员利用了多种方法来了解基因表达。在某些例子中,优先选择全转录组谱图而非靶向 RNA 测序,这通常涉及面板。为了研究植物功能基因组,研究人员同样利用表观遗传学工具以及植物 miRNA、小 RNA 和 RNAi 研究来破译感兴趣表型背后的根本原因。无论您的研究涉及哪方面内容,赛默飞均能为您的基因表达研究提供领先的仪器、试剂和解决方案产品组合。

转录组测序

与传统微阵列技术相比(仅能用于已知转录组序列物种的基因表达谱图),新一代测序技术允许植物研究人员在任何植物中实施这些研究,并能以更低成本实施具有更高动态范围的测定。如果您的目标是勾勒整个植物转录组谱图或要使用 RNA 测序来减少较大的、复杂和多倍体基因组的复杂性,采用 Ion Personal Genome Machine™ 或者 Ion Proton™ 系统能够使转录组测序变得简单

Ion PGM™ 系统由于其可扩展性、简单性和速度,已经成为绝大部分植物转录组(最多 1 Gb)的最佳解决方案:

The Ion Torrent machine
  • 最快运行时间:在 Ion 314™ 芯片上对 100 个碱基测序需 90 分钟
  • 最实惠的价格
  • 高准确性
  • 200 bp 读取长度,最高读取长度可达 400 bp
  • 在 Ion 318™ 芯片上,1100 万孔,最多 1Gb 通量
  • 一台仪器,多种应用:de novo 测序(从头测序)、转录组测序、通过测序的基因分型、重测序等

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靶向基因表达分析

如果您的实验方法仅限于几个基因或者转录组的某些区域,采用 TaqMan®探针来进行实时 PCR 测定可能是您的最佳方法。采用值得信赖的 Applied Biosystems®仪器和软件,TaqMan® 基因表达测定和主要反应混合物均为成功量身定制。了解更多:

TaqMan Accesories
从少数样品和目标到
高通量应用,提供了多种规格的 TaqMan®测定试剂盒来满足您的需求。
 

植物中的表观遗传学、miRNA 和非编码 RNA

Epigenetics miRNA

植物中的基因调控通过表观遗传改变进行,如 DNA 甲基化、染色质结构和非编码 RNA (ncRNA) 的改变。这些过程是复杂调控回路的一部分,需要可靠的研究工具。赛默飞已经开发出强大的技术来进行表观遗传研究,囊括了样品制备、测序、定量 PCR、功能分析测定以及生物信息学分析工具。

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