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信息学有助于指导完成癌症研究决策

新一代测序 (NGS) 生成的变异数据数量庞大,如何管理并最终解读,存在着巨大的挑战。特别是在肿瘤学应用中,由于肿瘤样本之中存在大量的变异,高效、精确、透彻地分析癌症相关数据颇费周折。

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Oncomine 信息学产品可帮助您:

  • 对变异进行优先次序排序,找到相关的新变异
  • 检出变异,确定并注释癌症驱动变异
  • 快速生成自定义的实验室报告


Oncomine 信息学产品

Oncomine Knowledgebase Reporter

无论您所在的是大规模实验室,还是高度协作的多站点机构,均可通过从本地服务器版Oncomine Knowledgebase Reporter,到 Thermo Fisher Cloud 支持的 Thermo Fisher Connect 提供的最新网页版选项,满足您的需求。

网页版 Oncomine Knowlegebase Reporter 由 Thermo Fisher Connect 提供,可通过按需付费结构实现安全、可扩展的分析平台。

  • 精选的相关证据将基因变异与相关的标签、指导原则和全球临床实验关联在一起
  • 易用的界面,方便用户通过几个简单的步骤生成报告:上传,过滤和报告
  • 提供十种语言的自定义报告模板

Oncomine Knowledgebase Reporter 可帮助您在一份报告中找到相关的介个癌症驱动变异,让您可以针对样本特定变异进行情境调查,了解如何结合相关的标签、指导原则和全球临床实验使用。此基因组分析工具专门针对 NGS 数据的进一步检查而开发,可通过以下三个简单步骤,流水线化获取最终的报告:上传癌症研究变异,采用 精选内容比对您的来源数据进行过滤,为您的实验室创建定制报告(图1)。

Ion Reporter 软件和 Oncomine Variant Annotator 插件

采用 Ion Reporter 软件简化您的生物信息学发现路径。此软件可帮助您清除 NGS 数据分析过程中的障碍,使您可以集中精力探索自己的数据的生物学意义。

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  • 插件可帮助您根据 Oncomine Knowledgebase 中的信息,找到相关的新 癌症驱动变异。
  • 插件 可根据 Oncomine Knowledgebase 之中的 48 种癌症类型的>5,300 对肿瘤和正常外显子组的分析结果,对各个变异进行功能获得或功能缺失归类。
  • 插件 可实现仅适用于肿瘤的工作流程
  • Ion Reporter 软件为各类研究应用提供了轻松的数据分析方法
  • Ion Reporter 软件采用优化的工作流程和用户工具,可以快速获得结果

关于 Oncomine Knowledgebase

采集、评估、标准化、分析、获得信息、重复验证
要获取相关信息并推动药物发现和伴随诊断开发项目,必须对 NGS 研究产生的大量基因组学数据集进行分析、标注,并最终由经验丰富的生物信息学专家进行解读。

Oncomine Knowledgebase Reporter 是由来自于全球临床实验、美国和欧洲的标签和指导原则的数据组成的精选数据集,可实现自定义的样本专用报告功能。

  • 可以将变异与各种标签、指导原则和全球临床实验关联起来
  • 告知 Oncomine 检测的设计信息 
  • 逐季度更新

Oncomine Platform 软件

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Oncomine Platform 软件包含一套计算基因表达签名、群集和基因组模块的强大分析功能,可从相关数据自动提取生物学解读视角。

  • 支持发现新型癌症的信息
  • 有助于更快获得发表成果的解读视角

 

*A single page report depends on the number of variants in the sample.