定制基因合成功能是指无需传统的克隆质粒即可设计DNA。 对研究人员而言同样重要的是,利用合成基因获得高产量的mRNA并最终生成蛋白质。 我们开发出了GeneOptimizer®软件,可实现所有常用表达系统中合成基因表达的最大化。

配置你的项目

这是一款采用复杂算法的专利软件,该算法考虑到了单次操作的所有转录和翻译相关优化参数,并提供了符合您规格的DNA序列,可在您的系统中实现最高的性能 (图1)。 Years of research have gone into the algorithms that drive GeneOptimizer® software, and we continue to update its features based on new developments in biological research.

采用GeneOptimizer®软件流程进行序列优化是所有GeneArt®基因合成服务提供的可选步骤。 To take advantage, select your expression host when setting up a request using our online customer portal. 在线软件随后将指导您完成项目设置过程,包括在线序列优化。 您还可以采用相同的在线客户门户申请GeneOptimizer®序列分析。

图1 — GeneOptimizer®软件工具优化序列,可最大程度实现转录/翻译。

它如何工作

Using our online customer portal, design your synthetic gene by uploading your sequence, selecting your expression system, and specifying your cloning vector and sequence details, such as start/stop codons, 3’/5’ untranslated regions, and inclusion/exclusion of restriction enzymes sites and immunomodulatory CpG motifs. 在您提交申请后,GeneOptimizer®软件通过同时处理多个最重要的序列参数,以渐进方法生成多达500,000个不同的目的序列。 然后选择优化的DNA序列,以与您的研究要求最匹配。

GeneOptimizer® 测序处理含以下内容:

  • 确认混合您要求的序列成分的最好方法
  • 去除潜在剪接位点和RNA去稳定序列元件,提高RNA稳定性
  • 添加RNA稳定序列元件
  • 用于您的表达系统的密码子优化和G/C核苷酸编校
  • 内含子去除
  • 避免稳定的RNA二级结构

结果为表达增加时高达100倍

GeneOptimizer®过程有助于大幅提高蛋白质产量;在各种因素的综合作用下,可稳定mRNA并最大程度提高翻译效率 (图2)。 一些客户报道称,其表达产量较未经优化的基因序列提高达100倍。

图 2—采用GeneArt® GeneOptimizer®过程进行序列优化大大提高了表达量。 参考文献: Graf M. et al (2000), 病毒学杂志 2000 11月; 74(22): 10822–10826