TaqMan® Sample-to-SNP™ 试剂盒采用了简化的实验方案,可对任何样本进行基于TaqMan®分析的基因分型分析,无需纯化DNA。 这些试剂盒包括GTXpress™预混液,它已经过优化,可利用样本裂解粗产物获得稳定的SNP基因分型结果。

请注意: DNA提取全裂解液不单独销售。 只作为TaqMan® Sample-to-SNP™试剂盒的一部分提供。

概述

使用TaqMan® Sample-to-SNP™试剂盒,只需不到一小时即可从生物样本中获得结果,无需提取DNA。 试剂盒包括两个部分: DNA提取全裂解液和TaqMan® GTXpress™预混液。DNA提取全裂解液将进行实时荧光定量PCR反应所需的长时间DNA释放步骤缩减至5分钟。 它们可以处理血液、颊粘膜拭子及植物组织等各种样本。

采用TaqMan® GTXpress™预混液处理裂解物,只需不到50分钟即可实现稳定的PCR扩增。

目前市售的许多预混液产品可较好地处理高纯度DNA。 但这些预混液在处理从抑制性样本 (如血液或FFPE组织) 中提取的纯化DNA时仍面临诸多困难。 TaqMan® GTXpress™预混液适合处理诸如血液和棉花等各种样本,而这些样本中含有多种抑制剂。

  • 快速——只需不到1小时即可利用原始的生物学样本获得SNP基因分型结果
  • 简单——只需几次移液步骤的简短实验方案
  • 稳定——可利用任何样本获得高度准确的结果
  • 灵活——经验证可用于多种定制TaqMan® SNP基因分型分析

TaqMan® Sample-to-SNP™试剂盒工作流程

图1: DNA提取全裂解液只需5分钟即可将DNA释放至裂解液中,且可与TaqMan® GTXpress™预混液同时使用。采用TaqMan® GTXpress™预混液只需不到50分钟即可实现稳定的PCR扩增。

从多种类型的样本中获得清晰的结果

图2: 采用TaqMan® Sample-to-SNP™试剂盒对颊粘膜拭子 (A)、小鼠尾巴 (B)、玉米叶 (C) 和FFPE样本 (D) 进行处理,参照推荐的用户实验方案获取基因分型结果。 在Applied Biosystems® 7900HT快速实时荧光定量PCR系统上采用384孔板进行所有扩增和等位基因分型分析。

使用TaqMan® Sample-to-SNP™试剂盒制备的纯化DNA和裂解物可获得相当的基因分型结果

图3: 使用纯化DNA和细胞裂解物绘制的基因分型簇曲线的一致性 The TaqMan® Sample-to-SNP™ Kit streamlines the SNP genotyping workflow by eliminating genomic DNA isolation. 该试剂盒已经过多种测试:比较裂解DNA和纯化DNA的等位基因检出一致性。 如图所示,与纯化DNA相比,TaqMan® Sample-to-SNP™试剂盒裂解物具有极佳的簇分离效果。 实际分簇因分析的不同而异,我们开展了一项大范围的研究,比较46个经过EDTA处理的血液样本和两个“无模板”对照的纯化DNA和裂解DNA的基因分型检出一致性,结果显示它们具有极佳的一致性。 采用一块含有400个分析的检测板 (包括200个TaqMan®预设计SNP基因分型分析、100个TaqMan®药物代谢基因分型分析和100个定制TaqMan® SNP基因分型分析) 对上述46个样本进行基因分型分析。