Ion ReproSeq PGS试剂盒

最快速台式测序解决方案,实现稳定可靠的
非整倍性筛查

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快速满足您的实验室非整倍性筛查需求

Ion ReproSeqTM PGS试剂盒和Ion PGMTM系统为您的胚胎植入前遗传学筛查 (PGS) 应用提供了完整解决方案,通过最快速和最经济的新一代测序流程,帮助您获得最可靠的体外受精胚胎染色体筛查结果。

得益于快速高效的半导体测序与等温扩增模板制备技术,这一工作流程只需8小时*即可完成:从单个细胞中提取6 pg胚胎DNA,进行完整染色体与染色体臂事件(>48Mb)检测。

Ion PGM系统具有丰富的芯片输出选项,可以精确匹配您的样品通量需求,为您的非整倍性检测应用提供高质量测序数据。这一灵活的通量与低廉的试剂价格相结合,能够最大程度降低对大批量胚胎样品的需求,实现较低的单样品检测成本,使当天胚胎移植的快速操作成为可能(无论技术上还是经济上),满足任意规模的实验室应用需求。

Ion ReproSeq PGS试剂盒具有以下优势:

  • 按需非整倍性筛查,无需等待批量样品 — 满足您的通量需求,同时价格也更加经济
  • 适用于PGS应用的最快速NGS工作流程,从获取DNA样品到生成非整倍性结果仅需8小时*
  • 提供完整工作流程:从单个细胞中制备样品到通过预配置的Ion ReporterTM非整倍性分析模块进行非整倍性检测,轻松实现自动化数据分析。

* 使用Ion 314TM芯片分析3份样品的周转时间为8小时,使用Ion 318TM芯片分析24份样品的周转时间为10小时

Ion ReproSeq PGS试剂盒工作流程:在一个试管中完成从单个细胞样品制备到获得数据的完整流程

1 抽提DNA,构建文库

Ion Torrent™ library kits

从第3天或第5天的胚胎活检样品中分离并扩增DNA

构建片段文库以制备测序样品

产品:

  • Ion ReproSeq PGS 试剂盒
  •  
    2 制备模板
    Ion Chef™ System

    在Ion PGM系统上,使用快速等温扩增技术制备模板




    产品:

  • Ion ReproSeq PGS 试剂盒
  • Ion OneTouch ES
  •  
    3 运行测序
    Proton System

    向芯片中载入模板,在Ion PGM设备上开始测序




    产品:

  • Ion ReproSeq PGS 试剂盒
  • Ion PGM 系统
  •  
    4 分析数据
    Ion Reporter Software

    进行非整倍性分析






    产品:

  • Torrent Suite 软件
  • Ion Reporter 软件
  • Ion ReproSeq PGS试剂盒套装与Ion PGM系统和Ion OneTouch ES联用,能够为用户提供从单个细胞开始到全基因组扩增和测序应用所需的全部试剂盒和试材:从第3天或第5天的胚胎中分离DNA,进行扩增,并使用Ion SingleSeqTM试剂盒在3.5小时之内完成标记;在文库构建完成后,在2个小时内使用Ion PGMTM Template IA 500试剂盒通过快速的等温扩增反应制备模板,并使用Ion OneTouchTM ES完成模板的富集工作;将制备好的模板载入芯片,在Ion PGM系统上执行测序 —Ion 314 v2芯片仅需2.5小时,Ion 318 v2芯片可在4.5小时之内完成;结果数据自动传输至Torrent Suite软件进行初始数据分析;通过Ion Reporter软件非整倍性分析流程确定样品的非整倍性状态。

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    Ion PGM 系统

    高品质,可(随时)访问的测序技术
    Ion PGM系统专为满足实验室PGS应用中的低成本、高品质新一代测序工作而设计,是一款整合了简单样品制备与数据分析方案的可靠测序平台,同时还以灵活的芯片输出为用户的研究项目提供了最出色的操作灵活性。

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    胚胎植入前遗传学筛查的数据分析方案

    Torrent Suite 软件 将靶向测序实验计划与所有必要的数据处理步骤完美结合在一起。新型产品模板能够帮助用户简单快速地规划靶向测序流程:在Ion PGM系统中对原始数据进行处理,然后输入PGMTM Torrent Server(服务器)进行碱基识别和变异识别,整个流程只需几个小时即可完成。进一步分析可通过Ion Reporter软件进行。

    Ion Reporter 软件 包含了一套生物信息学工具,能够大大简化半导体测序数据的分析工作。Ion PGM系统中生成的原始数据会自动从Torrent Browser(浏览器)上传至托管的Ion Reporter软件中,用于读序映射、注释、常规和罕见变异报告以及多样品分析 —所有这些操作都支持版本对照与审计追溯。

    CNV analysis for aneuploidy detection

    Ion Torrent™ semiconductor sequencing and Ion Reporter Software deliver the power to identify aneuploidies and subchromosomal events as small as 10 Mb across all 23 pairs of chromosomes via a simple, rapid, integrated workflow. Through the use of whole-genome amplification (WGA), gDNA from a small number of cells—even a single cell—can be used in the Ion PGM sequencing workflow to enable low-pass sequencing of the entire genome with sufficient coverage for the detection of gross chromosomal and subchromosomal aneuploidies. In the application note available below, we describe how researchers can leverage the Ion PGM System along with Ion Reporter Software to accurately identify aneuploidies in ≤10 hours from DNA sequence data generated from multiplexed analysis of ≥10 samples with low initial input DNA amounts.

    The aneuploidy detection solution described here leverages library construction and template preparation solutions that ensure a robust workflow with ease of use for routine applications. For example, the automatable enzymatic shearing protocol of the Ion Xpress™ Plus gDNA Fragment Library Kit removes the need for a physical shearing device, to save time and cost while delivering superior coverage uniformity for low-pass whole-genome sequencing data. Workflow simplicity and automated template preparation can be accomplished with either the Ion OneTouch™ 2 System or the Ion Chef™ System. The Ion Chef System incorporates automated chip loading to further reduce sources of variability and ensure reproducible sequencing results.

    Download the application note
    Watch the video on Ion PGM for PGS
    View and order products for this previous aneuploidy analysis workflow

    相关资源
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