Comprenez la pureté et la concentration de votre échantillon
Pour les scientifiques travaillant sur l’ADN, l’ARN ou les protéines, la qualité des échantillons joue souvent un rôle essentiel dans la détermination du succès ou de l’échec d’une expérience.
Lorsque le spectrophotomètre UV-visible Thermo Scientific™ NanoDrop™ One et le fluoromètre Invitrogen™ Qubit™ 3 sont utilisés ensemble, ils offrent la capacité d’obtenir les informations les plus complètes sur la concentration et la qualité de votre échantillon d’ADN, d’ARN ou de protéine. La connaissance de la concentration et de la pureté précises de votre échantillon vous permet d’éviter un dépannage et un retraitement onéreux en aval.
Bénéficiez d’une intelligence d’échantillons complète en quelques secondes.
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Quantification : comparaison du fluoromètre Qubit au dispositif d’absorbance UV / visible Nanodrop One
Combiner les meilleurs aspects des deux mondes : combinez le spectrophotomètre UV-visible NanoDrop One au fluoromètre Qubit 3 pour quantifier les biomolécules avec précision, rapidité et facilité.
De quel instrument ai-je besoin ?
Pour les flux de travaux qui impliquent des acides nucléiques, la détermination de la concentration (quantité) et de la pureté (qualité) de l’échantillon est souvent une étape nécessaire. En fin de compte, plus vous en savez sur votre échantillon d’emblée, moins vous courez le risque potentiel de subir un échec expérimental plus tard.
Tandis que le spectrophotomètre NanoDrop One et le fluoromètre Qubit 3 offrent tous deux une mesure précise des échantillons d’ADN, d’ARN et de protéines, chacun d’entre eux dispose d’avantages uniques.
Cités dans plus de 30 000 publications, les spectrophotomètres UV-visible à microvolume NanoDrop ont radicalement changé la manière dont les scientifiques évaluent les échantillons d’acides nucléiques et de protéines en éliminant le besoin de grands volumes d’échantillons.
Le spectrophotomètre à microvolume NanoDrop One de nouvelle génération utilise la technologie d’intelligence des échantillons Thermo Scientific™ Acclaro™ qui identifie les contaminants, fournit des valeurs de concentration corrigées et vous aide à évaluer la qualité de votre échantillon avant que vous l’utilisiez dans des applications en aval.
Le fluoromètre Qubit 3 est un dispositif de paillasse de pointe qui mesure précisément l’ADN, l’ARN et les protéines à l’aide de dosages d’analyse quantitative Invitrogen™ Qubit™ hautement sensibles.
Conjointement avec des algorithmes de pointe très optimisés et une interface utilisateur transparente, le fluoromètre Qubit 3 utilise des colorants fluorescents qui produisent uniquement un signal lorsqu’ils sont liés à la cible d’intérêt, réduisant ainsi les effets des contaminants (y compris l’ADN ou l’ARN dégradé) sur vos résultats.
Pour en savoir plus sur les dosages pour le fluoromètre Qubit 3
Comparaison des instruments
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Spectrophotomètre NanoDrop One |
Fluoromètre Qubit 3 |
| Présentation |
Rapide et simple : permet la mesure directe d’échantillons purifiés sans aucune dilution |
Sensible et spécifique : mesure précisément la concentration en acides nucléiques, qu’ils soient de l’ADN bicaténaire, de l’ADN monocaténaire, de l’ARN total ou du microARN, même en présence de contaminants |
| Technologie |
Absorption dans les UV |
Fluorescence |
| Flux de travaux |
Pipetez l’échantillon sur le socle ; mesurez. |
Mélangez l’échantillon avec des réactifs, incubez pendant 2 à 5 minutes, effectuez la lecture. |
| Applications |
Évaluation courante de la quantité et de la qualité (pureté) de l’ADN, de l’ARN et des protéines |
À utiliser avec des échantillons très dilués ou difficiles à traiter, lorsqu’une sensibilité supérieure est nécessaire ou lorsque des contaminants d’acides nucléiques sont suspectés (p. ex., de l’ADN dans l’ARN ; présence de dNTP) |
| Plage d’évaluation quantitative de l’ADN bicaténaire (ng/µl) |
0,2* à 27 500 |
0,01 à 1 000 |
| Évaluation de la qualité des échantillons (pureté) |
La technologie d’intelligence des échantillons Acclaro permet d’identifier la présence de contaminants tels qu’une protéine ou de la guanidine. Elle offre une valeur de concentration d’analytes corrigée.  Échantillon d’ADN bicaténaire contaminé par une protéine. La contribution de l’absorbance de la protéine (en orange) est soustraite du résultat d’origine (en bleu) afin d’obtenir la concentration d’ADN bicaténaire corrigée (en vert). |
Des colorants fluorescents uniques permettent la différenciation entre les types d’échantillons, y compris les acides nucléiques (p. ex., ADN vs. ARN) sans aucun prétraitement de l’échantillon.  Le dosage d’ADNdb HS Qubit est sélectif pour l’ADN bicaténaire, même en présence d’une masse égale d’ARN. |
* La plage d’analyse quantitative de l’ADN bicaténaire pour le NanoDrop One est de 0,2 ng/µl avec cuvette et de 2,0 ng/µl sans cuvette.
Pour les échantillons qui sont purs à 100 % et constitués d’un type d’acide nucléique unique (p. ex., ADN bicaténaire), on peut s’attendre à ce que les résultats obtenus sur le spectrophotomètre NanoDrop One et le fluoromètre Qubit 3 soient identiques pour les échantillons, au sein des échelles dynamiques des instruments. Cependant, peu d’échantillons sont purs à 100 %.
Pour la plupart des laboratoires travaillant avec des acides nucléiques, il est très avantageux de bénéficier de la vitesse et de la flexibilité du spectrophotomètre NanoDrop One ainsi que de la spécificité et de la sensibilité du fluoromètre Qubit 3. Ensemble, ces deux instruments élégamment conçus vous offrent une évaluation quantitative précise et une évaluation de la qualité intelligente de votre biomolécule d’intérêt et ils aident votre laboratoire à économiser beaucoup de temps et d’argent en contribuant à empêcher les échecs expérimentaux en aval.
Analyse quantitative des acides nucléiques : guide d’applications en aval
| Application |
Spectrophotomètre NanoDrop One |
Fluoromètre Qubit 3 |
| PCR générale |
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Les applications de PCR courantes sont devenues robustes au fil des ans. L’utilisation d’UV pour quantifier le modèle est suffisante. |
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Adapté aux échantillons courants, préféré si l’échantillon est sujet à des grandes quantités de contaminants qui absorbent à 260 nm (A260) (dNTP, oligos, ARN, etc.). |
| PCR quantitative |
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Les UV permettent au chercheur de déterminer la présence de contaminants qui peuvent affecter la réaction de polymérase (p. ex., phénol). |
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Les résultats fiables de qPCR nécessitent des concentrations de modèles très précises. La spécificité et la sensibilité des dosages Qubit sont bien adaptées à cette tâche. |
| Séquençage |
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L’utilisation d’UV pour quantifier le modèle est suffisante, sauf si l’échantillon est sujet à de grandes quantités de contaminants qui absorbent à 260 nm (A260) (p. ex., de l’ARN dans des échantillons d’ADN). |
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Si les échantillons sont sujets à de grandes quantités de contaminants qui absorbent à 260 nm (A260), la haute spécificité d’un dosage Qubit est avantageuse. |
| Séquençage de nouvelle génération |
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UV pour l’évaluation des échantillons lors du processus de construction de la banque. Permet au chercheur de déterminer la présence de contaminants qui peuvent affecter différentes étapes du flux de travaux. |
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Les résultats de NGS fiables nécessitent des concentrations de modèles très précises. La spécificité et la sensibilité des dosages Qubit sont bien adaptées à cette tâche. |
| RT-qPCR |
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Les extractions d’ARN standard sont moins sujettes à la contamination par l’ADN, donc la mesure des UV peut être utilisée pour normaliser la quantité d’ARN qui est utilisée pour la réaction. |
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La spécificité et la sensibilité des dosages Qubit sont adaptées aux échantillons courants et sont désirables si l’échantillon est sujet à la contamination par l’ADN ou par l’ARN dégradé (dNTP et NTP). |
| CQ de sondes de biopuces marquées avec un colorant |
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Permet la mesure simultanée de la quantité de colorant et de sonde. |
S/O |
N’est pas recommandé pour le CQ de sondes de biopuces marquées avec un colorant. Les dosages Qubit peuvent être utilisés pour mesurer précisément la concentration des sondes de biopuces. |
| Génotypage / détection des mutations |
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La mesure à A260 peut amplifier les concentrations en raison de contaminants mélangés. |
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Les échantillons contiennent souvent des contaminants qui absorbent à 260 nm (A260), ce qui rend désirable la spécificité du dosage Qubit. |
Analyse quantitative des protéines
| Spectrophotomètre NanoDrop One |
Fluoromètre Qubit 3 |
Sélection d’applications préprogrammées
- Analyse quantitative directe de A280 avec l’éditeur de protéines
- Absorbance de la liaison peptidique A205 pour les protéines ou les peptides qui ne contiennent pas de résidus de tryptophane et de tyrosine.
- Dosages colorimétriques des protéines : Bradford, BCA, Lowry et dosage Thermo Scientific™ Pierce™ à 660 nm
  Concentration protéique totale de trois échantillons illustrée sous forme de carrés rouges sur une courbe standard de dosage BCA (panneau supérieur) ; quatre différents échantillons protéiques purifiés mesurés à l’aide de l’application Protein A280 (panneau inférieur). |
Les dosages Qubit présentent une faible variabilité entre les protéines et sont résistantes à la plupart des contaminants, notamment les sels, les agents réducteurs (DTT et bêta-mercaptoéthanol), l’ADN et les acides aminés mais pas aux détergents.  Faible variabilité entre les protéines dans le dosage protéique Qubit. Les solutions des protéines suivantes ont été dosées : albumine sérique bovine (BSA), ovalbumine d’œuf de poulet, lysozyme d’œuf de poulet, β-caséine de lait bovin, myoglobine équine, α-caséine de lait bovin, pepsine porcine, immunoglobuline (IgG) de souris et histone de thymus de veau. |
Relevez vos défis analytiques grâce à notre gamme complète de spectrophotomètres ultraviolet-visible (UV-visible). Nos conceptions primées et notre logiciel convivial vous permettent de quantifier, d’évaluer la pureté et bien plus encore.
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Utilisez des fluoromètres pour quantifier, détecter et surveiller les analytes et leurs réactions en mesurant l’intensité du signal fluorescent provenant de colorants fixés sur des molécules biologiques ainsi que sur des molécules naturellement fluorescentes basées sur les ondes signatures d’excitation (Ex) et d’émission (Em).
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Spectrophotomètre NanoDrop One et fluoromètre Qubit 3
Pour les scientifiques travaillant sur l’ADN, l’ARN ou les protéines, la qualité des échantillons peut jouer un rôle essentiel dans la détermination du succès ou de l’échec d’une expérience. Ensemble, le spectrophotomètre UV-visible NanoDrop One et le fluoromètre Qubit 3 offrent à votre laboratoire la capacité d’obtenir les informations les plus complètes sur la concentration et la qualité de votre échantillon d’ADN, d’ARN ou de protéine.
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NDPP1,NDPP1C,PNTRLW400,CHEMPR1KIT,CHEMPV1
Q32851,Q32854,Q32850,Q32853,Q10212,Q32852,Q32855,Q10210,Q10211,Q32881,Q33211,Q33212,Q32856