Séquençage de l’ARN
Dans le domaine de l’expression génétique, l’explication des changements est essentielle pour comprendre la réponse cellulaire aux légions génétiques internes, aux stimuli externes et à l’évolution des conditions environnementales. Les modèles d’expression de l’ARN offrent donc une source de biomarqueurs unique pour la prévision et la classification des maladies chez l’homme. Les ARN codants de protéines (ou ARN poly-A+) ont jusque-là été au centre de toutes les attentions, mais l’importance des séquences d’ARN non codant est malgré tout bien documentée. Le séquençage d’ARN de nouvelle génération propose une plateforme particulièrement puissante pour la recherche sur l’ARN, qui offre un certain nombre d’avantages :
- ‘Comptage numérique’ des molécules d’ARN pour des mesures quantitatives de grande précision
- Plage dynamique pour capturer la totalité des changements biologiques pertinents
- Découverte des ARN inconnus (nouveaux transcripts, variantes d’épissage et fusions de gènes)
- Capture de tous les types d’ARN (poly-A+, ARN long non codant, petit ARN et fusions de gènes) dans un seul et même dosage
- Possibilité d’obtenir, à partir de l’analyse complète d’un transcriptome entier, une présélection pratique de séquences d’ARN, afin d’équilibrer le coût des expériences et la facilité d’analyse avec le potentiel des recherches
Séquençage de l’ARN avec technologie NGS Ion Torrent
De l’analyse d’expression génétique ciblée au séquençage de transcriptome entier, les produits Ion Torrent™ associent la préparation simple des échantillons et l’analyse intuitive des données pour fournir une solution complète de séquençage de l’ARN.
Sélectionnez l’un des panels de gènes préconçus ou concevez le vôtre. C’est la solution idéale pour suivre l’analyse du transcriptome ou se concentrer sur le contenu génétique spécifique à une voie ou à une maladie
Séquençage de transcriptome ciblé
Une approche du séquençage ciblé mettant en avant > 20 000 gènes connus, compromis idéal au séquençage du transcriptome entier grâce à une analyse considérablement simplifiée
Séquençage de petits ARN
Combine la technologie de pointe Invitrogen™ dédiée à l’ARN et les approches de séquençage du transcriptome entier afin de se concentrer sur les petits ARN de la cellule
Séquençage de transcriptome entier
Également connue sous le nom de RNAseq, cette approche présente le plus grand potentiel de découverte, mais également les plus grands défis bio-informatiques
L’analyse de transcriptome entier, spécifique au brin et sans hypothèse, permet l’identification et l’évaluation quantitative de transcripts à la fois connus et nouveaux. Le système Ion S5™, associé au kit de purification d’ARN Invitrogen et au kit de construction de bibliothèques Ion Torrent, offre un flux de travaux de séquençage fiable qui associe la préparation simple d’échantillons et l’analyse intuitive des données pour votre séquençage de transcriptome entier.
Le séquençage de transcriptome entier est parfait pour les découvertes, mais excessivement complexe pour les études traditionnelles d’expression génétique. Grâce à une échelle dynamique linéaire quantitative plus grande qu’avec une technologie de biopuces, profitez de la vitesse et de la sensibilité accrue du séquençage de nouvelle génération (NGS) tout en bénéficiant d’une préparation des échantillons et d’une analyse des données simples avec le kit d’expression des gènes humains du transcriptome Ion AmpliSeq™. Ciblez > 20 000 transcripts RefSeq en utilisant à peine 10 ng d’ARN en entrée, avec une préparation rapide des échantillons enrobés de paraffine, fixés avec de la formaline et compatibles FFPE, un séquençage et des flux de travaux d’analyse de données pour une simple analyse d’expression au niveau des gènes.
Les systèmes Ion PGM et Ion S5 fournissent une analyse basée sur le séquençage de tous les transcripts connus et nouveaux de petits ARN, tels que les micro-ARN (miARN), les ARN interférents courts (siARN) et les ARN interagissant avec Piwi (piARN), selon une approche spécifique au brin et sans hypothèse.
Le séquençage d’ARN ciblé offre une solution très abordable pour suivre les études sur le transcriptome. Vous pouvez aussi l’utiliser pour cibler rapidement le contenu génétique en relation avec une voie ou une maladie. Avec de très faibles quantités d’ARN total en entrée (seulement 500 pg d’ARN non fixé ou 5 ng d’ARN isolé d’échantillons FFPE), il est possible de doser l’expression de quelques ARN cibles, voire de centaines ou de milliers dans un simple flux de travaux basé sur le NGS qui permet de surveiller l’ARN messager (mRNA), l’ARN non codant (ncRNA), les petits ARN et les fusions de gènes.
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.