TaqMan hPSC Scorecard Assay

Analyse quantitative du potentiel de différenciation de trois lignées

Le panel Applied Biosystems™ TaqMan® hPSC Scorecard™ évalue la pluripotence et le potentiel de différenciation de trois lignées à l’aide de dosages de qPCR en temps réel et d’un logiciel d’analyse de données intuitif.

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Quantifiez le potentiel de différenciation de trois lignées de vos CSP

Le dosage de CSPh Scorecard a été développé en collaboration avec Alex Meissner et s’inspire de sa publication de référence (Cell 2011 144:439–452). Le logiciel d’analyse qui l’accompagne donne aux chercheurs du monde entier la capacité de comparer les profils d’expression génétique de leurs lignées cellulaires avec un ensemble de référence commun.

Exigences en termes d’instruments

Instrument requirements

Découvrez les instruments compatibles avec le panel de CSPh TaqMan Scorecard et comment les configurer.

Analyse de données

Data analysis

Le panel de CSPh TaqMan Scorecard comprend l’accès au logiciel d’analyse Web intuitif et gratuit qui permet aux chercheurs de comparer quantitativement le profil d’expression génétique de leur échantillon à celui d’un ensemble de référence.

Services CellModel

CellModel Services

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De quoi s’agit-il ?

The TaqMan hPSC Scorecard Panels quantitatively confirms pluripotency (trilineage differentiation potential)
for both embryonic and induced pluripotent stem cell lines. The hPSC Scorecard Panel (available in 96 and 384-well format) contains 94 predefined TaqMan Gene Expression assays (including endogenous controls) dried-down in assay plate wells. The panel of genes was developed in collaboration with Alex Meissner, and based on his landmark publication (Cell 144:439-452 (2011)).


The TaqMan hPSC Scorecard Panel provides:

  • A quantitative assay for confirming pluripotency and trilineage differentiation potential
  • Comparison of expression profiles to a reference standard
  • An easy to use platform with pre-plated assays and dedicated, intuitive analysis software


Overview of protocol:

  1. Test undifferentiated, spontantious differentiation (EB) or directed (monolayer) differentiation samples
  2. Extract and purify RNA
  3. Generate cDNA
  4. Run gene expression panel on a compatible qRT-PCR instrument 
  5. Upload .eds files to the hPSC Scorecard Analysis Software
  6. Analyze data and export results from the convenient cloud-based analysis application
     

Comment exécuter le dosage de CSPh Scorecard

CSE/CSPI non différenciées

CSE/CSPI différenciées : Corps embryoïdes (semaine 1) – ou – cellules différenciées directement.

Exigences relatives aux échantillons : >1 x 106 cellules/échantillon

Undifferentiated ESC/iPSC

Feeder-dependent culture

Feeder-free culture

Differentiated ESC/iPSC (EBs)

RNA Isolation

Formulas

TRIzol organic phase extraction

Sample requirements: 1 mL TRIzol reagent per 6 cm culture dish

[RNA] (mg/mL) = A260 * 40

Recommended A260/A280 ratio = 1.6 – 1.8

Analysez des données issues du panel de CSPh TaqMan® Scorecard™ à l’aide du logiciel d’analyse intuitif

Se connecter au logiciel d’analyse de CSPh Scorecard™

Step 1 : Culture cellulaire

CSE/CSPI non différenciées

CSE/CSPI différenciées : Corps embryoïdes (semaine 1) – ou – cellules différenciées directement.

Exigences relatives aux échantillons : >1 x 106 cellules/échantillon

Undifferentiated ESC/iPSC

Feeder-dependent culture

Feeder-free culture

Differentiated ESC/iPSC (EBs)

Step 2 : Préparation d’ARN

RNA Isolation

Formulas

TRIzol organic phase extraction

Sample requirements: 1 mL TRIzol reagent per 6 cm culture dish

[RNA] (mg/mL) = A260 * 40

Recommended A260/A280 ratio = 1.6 – 1.8

Step 3 : Préparation d’ADNc

8 réactions de transcription inverse (RT) par échantillon d’ARN

Préparation d’ADNc

Step 4 : qRT-PCR

Télécharger le modèle d’exécution

Type d’expérience : Courbe standard

Configuration à 384 puits

Configuration à 96 puits

Step 5 : Analyse de données

Analysez des données issues du panel de CSPh TaqMan® Scorecard™ à l’aide du logiciel d’analyse intuitif

Se connecter au logiciel d’analyse de CSPh Scorecard™

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.