パワフルなデータの可視化と知見をもたらす生物学的画像解析

Thermo Scientific Amiraソフトウエアは、高度な2D~5D生物学的特性評価用の包括的なツールボックスを提供します。 ライフサイエンス研究における画像データ解析のための自動ツールにより、時間効率、信頼性、再現性が向上します。


画像データのシームレスなインポート

Amiraソフトウエアにインポートされたスライドのスタック。
  • 光学顕微鏡、電子顕微鏡、CT、MRIなど、さまざまな画像モダリティからの画像を、メタデータを含めてシームレスに自動インポートします。
  • マルチデータ/マルチビュー、マルチチャネル、時系列、超大規模データセットの取り扱い。
  • ほぼすべての一般的なファイルタイプをフルサポート(BioFormatsとの互換性あり)。

フィルタリングおよび前処理

  • AIベースおよび従来の画像品質向上には、以下が含まれます。 
    • 画像強調、フィルタリング、および畳み込み(フーリエ周波数変換)
    • ノイズとアーチファクトの低減、バックグラウンド補正
    • 画像スタックアライメント、算術演算、相関、統合
  • 高度な2D/3Dマルチモーダル画像レジストレーション
  • 有限要素法および幾何モデル、CADとの統合
Amiraソフトウエアによるノイズ低減。

画像データの可視化と探索

  • インタラクティブな高品質かつ高精度の可視化 
  • 定量的情報の可視化への組み込み
  • データの理解を深めるための同時マルチウィンドウの可視化
  • ベクトルおよびテンソルの可視化 
  • 分子の可視化

AI対応のセグメンテーションツール

Amiraソフトウエアは高度なAI駆動のセグメンテーションツールを備えており、データ解析において卓越した精度と効率性を保証します。Amiraソフトウエアのセグメンテーションに特化したワークルームは、革新的な人工知能とユーザーフレンドリーなアノテーションツールを組み合わせており、グラウンドトゥルースデータの作成を合理化します。

 

Amiraソフトウエアは柔軟なAIセグメンテーションモデルを提供します。単純なタスクを迅速に処理するためのシャローモデルと、複雑な画像を高精度で分析するためのディープモデルを用意しています。トレーニングは、データのニーズに合わせて2Dまたは3Dで実施できます。 直感的なインターフェース、優れた精度、効率的なパフォー
マンスを備えたAmiraソフトウエアは、研究と産業の両方の専門家に理想的なソリューションです。

Amiraソフトウエアによる、クラミドモナス標本データセットのAIアシスト・セグメンテーション。

200以上のビルトイン測定機能

Amiraソフトウエアで作成した粒子密度カラーマップによる牛痘ウイルス感染細胞。 提供: Robert Koch Institute、Berlin、ドイツ

画像データの解析と定量情報の取得:

  • 直感的なレシピ作成、カスタマイズ、自動リプレイ
  • カウント、容積、面積、周囲長、アスペクト比、方向など、200以上の測定機能を搭載
  • ユーザー定義の測定機能
  • スプレッドシートツールおよび図表による結果表示
  • 各特性の自動測定、3D位置決定、スプレッドシートの選択
  • 自動統計、分布図
  • 任意の測定基準を使用した特性フィルタリング
  • データレジストレーション、変形、比較、測定

プレゼンテーションとアニメーション

分析および可視化の成果をエクスポートしてシームレスに公開および発表:

  • アニメーションおよび動画の作成
  • 高度なキーフレームおよびオブジェクトアニメーション
  • 画像、幾何モデル、測定、シミュレーションの統合
  • アノテーション、測定の凡例、ヒストグラム、曲線プロット
  • スプレッドシート、3Dモデル、高画質画像をエクスポート
  • 能動的および受動的3Dステレオビジョン
  • 単一またはタイルドスクリーンディスプレイ
  • 没入型環境

 


スクリプト作成とカスタマイズ

Amiraソフトウエアのスクリプト作成とカスタマイズ。

Amiraソフトウエアをユーザーの特定のニーズに容易かつ迅速に適応:

  • カスタムC++ モジュール開発
  • MATLABブリッジ
  • PythonスクリプトAPI

自動化されたワークフロー

自動化された画像処理ワークフローは、効率的で再現性のある科学研究や産業用途に不可欠です。

 

Amiraソフトウエアは、画像処理や解析のレシピを直感的な方法で作成する機能を備えており、プログラミングスキル不要で、AIベースを含むワークフローの作成、カスタマイズ、自動化を可能にします。

 

レシピの保存と再利用により一貫性を確保し、大規模データセットを効率的に処理できます。既存のレシピを新しいレシピと統合することで、生産性の向上と画像解析の簡素化を実現できます。

 

Amiraソフトウエアのイメージレシピデザイナーは、正確性、信頼性、生産性を向上させ、研究をサポートします。

Amiraソフトウエアのイメージレシピデザイナーワークルーム。データ提供:Srigokul Upadhyayula氏、Howard Hughes Medical Institute(HHMI)およびHarvard Medical School。

デジタルボリューム相関

Amiraソフトウエアはデジタルボリューム相関法(DVC)にも対応しており、研究者はさまざまな条件下の生体組織やインプラント内の3D体積変位およびひずみデータを非接触で測定することができます。この能力は、骨やその他の構造の機械的特性を研究するうえで重要であり、ひずみ伝達や破壊メカニズムをより深く理解することができます。


AIを活用したデータ解析

Amiraソフトウエアは高度なAI駆動のセグメンテーションツールを提供し、正確かつ効率的なデータ解析を実現します。そのセグメンテーションワークルームには革新的なAIが組み込まれており、直感的なアノテーションツールによりグラウンドトゥルースデータの作成を簡素化します。

 

Amiraソフトウエアは多様なAIモデルを提供します。単純なタスクでの高速化を実現するシャローモデルと、複雑な画像解析での高精度を実現するディープモデル。トレーニングは、データのニーズに基づいて2Dまたは3Dで実施できます。

 

ユーザーフレンドリーなインターフェース、高い精度、効率的な処理を備えたAmiraソフトウエアは、研究や業界の専門家に最適な製品であり、画像を定量可能な知見に変換します。

AIを活用したAmiraソフトウエア。

シミュレーションとモデリング

Amiraソフトウエアによる脳表面編集。

Amiraソフトウエアには、3Dラベル付き画像からシミュレーション入力を作成するための堅牢なメッシュエンジンが搭載されています。大規模な多素材セグメント化画像から、境界が滑らかな高品質なメッ
シュを生成し、細かな構造やトポロジーを保持します。要素サイズ分布を細かく制御できます。メッシュは境界条件とともに一般的なソルバーフォーマットにエクスポートでき、Amiraソフトウエアは高度な後処理と可視化のためにソルバー出力のインポートをサポートしています。


Amiraソフトウエアをお試しください

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.