Tm calculatorの使い方
Tm calculatorはプライマーのTm値、アニーリング温度を提供するだけでなく、入力したプライマーの長さとGC含量から、分子量および吸光係数を提示します。
アプリケーションは、 2つの異なる方法に従ってTm値を計算するように設計されています。PhusionおよびPhire DNAポリメラーゼを用いる場合、、修正Breslauerの熱力学(1)をベースとした方法によってTm値を求めるのが推奨です。その他のTaqベースのDNAポリメラーゼを用いた場合は、異なる算出法を用いてTm値とアニーリング温度を提示します。
Tm calculatorの使用には、まず使用するDNAポリメラーゼを選択します。次にプライマー配列を入力またはコピー/ペーストします。最後に、プライマーの最終濃度を入力します。Tm値、アニール温度、および他のデータが自動的に表示されます。
1. Breslauer et al., (1986) Predicting DNA duplex stability from the base sequence. Proc. Nat. Acad. Sci. 83, 3746-50.