Logiciel de protéomique pour l’analyse des données de spectrométrie de masse

Les spectromètres de masse rapides et puissants génèrent régulièrement de grands ensembles de données pour l’analyse protéomique. Notre logiciel de protéomique permet de simplifier l’analyse statistique des données de protéomique et d’ajouter une signification biologique, même dans les expériences portant sur les systèmes biologiques les plus complexes. Les analyses protéomiques impliquent non seulement l’identification du peptide ou de la protéine et de ses modifications post-traductionnelles, mais également plusieurs analyses statistiques qui permettent d’extrapoler la signification biologique des données de protéomique. Notre gamme de logiciels de protéomique est spécialement conçue pour exploiter les données complexes issues des MS Orbitrap à précision de masse et haute résolution (HRAM) et les convertir en résultats significatifs.

Identification, caractérisation et quantification complètes des protéines

Le logiciel Thermo Scientific Proteome Discoverer vous permet d’identifier et quantifier les protéines d’échantillons biologiques complexes.

Recommandé pour les flux de travail suivants :

• Stratégies de recherche itérative
• Comparaison de moteurs multi-recherche
• MS3 TMT SPS
• Identification et quantification de glycopeptides
• Identification et quantification de phosphopeptides
• Protéomique top-down
• Réticulation

Identification des protéoformes

Le logiciel Thermo Scientific ProsightPD a été amélioré afin de prendre en charge les expériences middle-down et bottom-up, ce qui en fait un outil global pour l’identification et la caractérisation des protéines intactes et peptides.

Recommandé pour les flux de travail suivants :

• Identification de protéines par MS/MS top-down
• Élucidation de PTM inconnues
• Édition de base de données de protéines

Quantification et validation de l’identité des peptides

Le logiciel Skyline  est largement adopté par la communauté protéomique comme plateforme de facto pour l’analyse des données de quantification ciblée. Les kits de dosage de spectrométrie de masse ciblée SureQuant sont fournis avec des modèles de traitement et d’analyse Skyline prêts à l’emploi pour permettre l’exécution de flux de travail de routine sans optimisation fastidieuse des paramètres et flux de données.