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TaqMan™ Assays zur SNP-Genotypisierung, menschlich
Zitierungen und Referenzen (1421)
Applied Biosystems™

TaqMan™ Assays zur SNP-Genotypisierung, menschlich

5'-Nuklease-Assay zur Unterscheidung zweier Allele eines spezifischen SNP für die Verwendung in Genotypisierungsstudien
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KatalognummerMengeSpezies
4351376M (1000 Reaktionen), auf Bestellung gefertigtHuman
4351379S (300 Reaktionen), auf Bestellung gefertigtHuman
4351374L (2400 Reaktionen), auf Bestellung gefertigtHuman
Katalognummer 4351376
Preis (EUR)
928,65
Exklusiv online
1.092,00
Ersparnis 163,35 (15%)
Each
Menge:
M (1000 Reaktionen), auf Bestellung gefertigt
Spezies:
Human
  • Unsere große Auswahl an SNP-Assays verbessert Ihre Validierungs- und Screening-Untersuchungen zu Anwendungen für Krankheitsassoziationen und Populationsstratifizierung
  • Anwenderfreundliches Einzelröhrchenformat
  • Das stabile Assay-Design liefert hochgenaue, reproduzierbare und zuverlässige Ergebnisse
  • Ein einfacher Arbeitsablauf liefert schnelle Ergebnisse
Applied Biosystems TaqMan SNP-Genotypisierungs-Assays verwenden die TaqMan 5´-Nuklease-Assaychemie, um spezifische Polymorphismen in gereinigten Proben genomischer DNA zu amplifizieren und nachzuweisen.Jeder Assay ermöglicht die Genotypisierung von Individuen durch einen einzelnen Nukleotid-Polymorphismus (SNP) und besteht aus zwei sequenzspezifischen Primern und zwei TaqMan-MGB-Sonden mit nicht-fluoreszierenden Quenchern (NFQ).Eine Sonde ist mit VIC-Farbstoff markiert, um die Allel-1-Sequenz nachzuweisen; die zweite Sonde ist mit FAM-Farbstoff markiert, um die Allel-2-Sequenz nachzuweisen.

Unsere vorentwickelten TaqMan SNP Genotyping Human Assays sind eine genomweite Sammlung von Millionen menschlicher Assays, einschließlich gemeinsamer 1.000 Genome SNPs, HapMap SNPs und Coding SNPs.

Vorteile:
•Bewährt — TaqMan-Chemie nach Goldstandard und robuste Assay-Designs liefern genaue, reproduzierbare und zuverlässige Ergebnisse
•Einfach — bequemes Einzelröhrchen-Format und einfacher Arbeitsablauf ermöglichen einen einfachen Weg zu zuverlässigen Ergebnissen; keine Optimierung erforderlich
•Relevant — umfangreiche Sammlung vorentwickelter menschlicher Assays bietet direkten Zugriff auf Inhalte, die für Ihre Forschung relevant sind
•Getestet — Alle humanen SNP-Genotypisierungsassays werden funktionell getestet, um allelische Diskriminierung zu gewährleisten

Ungefähre Lieferzeit
4–6 Tage in Nordamerika und 6–10 Tage in Europa

TaqMan SNP Genotypisierungsassays benötigen für die PCR nur drei Reaktionskomponenten: Gereinigte genomische DNA (1–20 ng), die Assay-Lösung und TaqMan Genotyping Mastermix (oder ein anderer kompatibler Mastermix, je separat erhältlich).

Alle Assay-Designs sind das Produkt unserer Bioinformatik-Pipeline, die im Laufe von mehr als einem Jahrzehnt durch die Nutzung von Produktions- und Assay-Performance-Daten optimiert wurde.TaqMan Assays wurden in über 40.000 Publikationen zitiert und werden durch mehr als 350 Patente unterstützt.

Alle unsere vorgefertigten TaqMan Assays sind durch die TaqMan Assays qPCR-Garantie abgedeckt.*

Empfohlener Mastermix (separat erhältlich):TaqMan Genotyping Mastermix

*Es gelten die allgemeinen Geschäftsbedingungen.Ausführliche Informationen finden Sie unter www.thermofisher.com/taqmanguarantee.

Nur für Forschungszwecke. Darf nicht für diagnostische Verfahren eingesetzt werden.
Specifications
3'-Primer-ModifizierungKeine
5'-Primer-ModifizierungKeine
BeschreibungVIC™ – MGB-Sonde erkennt Allel 1, FAM – MGB-Sonde erkennt Allel 2
Zur Verwendung mit (Geräte)7500 System, 7500 Fast System, 7900HT System, StepOne™ , StepOnePlus™ , ViiA™ 7-System, QuantStudio™ Absolute Q Digital PCR System, QuantStudio™ 3, QuantStudio™ 5, QuantStudio™ 6 Flex, QuantStudio™ 7 Flex, QuantStudio 6 Pro, QuantStudio 7 Pro, QuantStudio™ 12k Flex ProFlex PCR-System* VeritiPro* SimpliAmp* , MiniAmp* Automatisierter Thermocycler** Wird für die PCR-Amplifikation ein Thermocycler verwendet, müssen die optionalen Vor- und Nachlesevorgänge auf einem Echtzeit-PCR-System separat durchgeführt werden, um Fluoreszenzsignale zu erkennen und aufzuzeichnen.
Interne SondenmodifikationVIC™ (5'), FAM (5'), MGB („Minor Groove Binder“, bindet an die kleine Furche der DNA) (3')
Anzahl Reaktionen5000 Reaktionen
ProduktlinieTaqMan
ReinigungsverfahrenFestphasenextraktion (SPE)
Reinheits- oder QualitätsgradRNase-frei, DNase-frei
MengeM (1000 Reaktionen), auf Bestellung gefertigt
VersandbedingungRaumtemperatur
SpeziesHuman
ZielÜber 4,5 Millionen genomweite menschliche Assays verfügbar
Konzentration40X
Zur Verwendung mit (Anwendung)Genotypisierung
FormGefroren
Marker oder FarbstoffFAM, VIC
Unit SizeEach
Inhalt und Lagerung
1 Röhrchen mit 40x (Größen S und M) oder 80x (Größe L) Mischung aus vorformuliertem Assay (2 Sonden und 2 Primer).

Bei -15 bis -25 °C lagern.

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

What is the maximum size of insertion/deletion that can be detected by a TaqMan SNP Genotyping Assay?

Assays can detect an insertion/deletion of up to 6 bases. If you desire an assay to detect a larger insertion or deletion you may want to consider our Custom Design Service (https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/custom-services-reagents-real-time-pcr-qpcr/custom-services-real-time-pcr-assays.html).

What can I do if there are no predesigned assays to my SNP?

You can use our Custom Assay Design Tool (https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/real-time-pcr-assays/snp-genotyping-taqman-assays/custom-snp-assays.html?ICID=ta-lm-custom%20taqman%20snp%20assay-Single%20Tube%20Custom%20TaqMan%C2%AE%20SNP%20Genotyping%20Assays) to submit your SNP sequence for an assay design. Alternatively, you can also use Primer Express Software to design an assay.

How do I find an assay to my SNP?

You can easily find predesigned TaqMan SNP Genotyping Assays with our user-friendly search tool at https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/real-time-pcr-assays/snp-genotyping-taqman-assays.html. Simply search by:

-Target (assay ID, rs number, gene symbol)
-Specific location on a chromosome

You can also watch this short video (https://www.youtube.com/watch?feature=player_embedded&v=qA4VWe8Jyrs) on how to search for assays.

Can the TaqMan SNP Genotyping Assays be used for allele quantification?

No. TaqMan SNP assays contain competitive probe sequences with a 1 bp mismatch where the SNP is located. The other probe will still bind at a lower efficiency, producing some signal for the other fluorophore. Therefore, these are not quantitative.

In my TaqMan SNP Genotyping Assay, which base is labeled with FAM or VIC dye?

The probe labels are provided in the assay documentation and also online. Simply look up the assay by typing the assay ID into the search bar on thermofisher.com. Click on the “View Details” button, and under the Product Details look for the Context Sequence. The assays are always in a [VIC/FAM dye] order. From the context sequence, you can see which base is first (thus labeled with VIC dye), and which is second (thus labeled with FAM dye).

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Zitierungen und Referenzen (1421)

Zitierungen und Referenzen
Abstract
Determination, mechanism and monitoring of knockdown resistance in permethrin-resistant human head lice, Pediculus humanus capitis
Authors:Clark, JM
Journal:JOURNAL OF ASIA-PACIFIC ENTOMOLOGY
PubMed ID:
Permethrin resistance has been reported worldwide and clinical failures to commercial pediculicides containing permethrin have likewise occurred. Permethrin resistance in head lice populations from the U.S. is widespread but is not yet uniform and the level of resistance is relatively low (∼4-8 fold). Permethrin-resistant lice are cross-resistant to pyrethrins, PBO-synergized ... More
Geographical mapping of a multifocal thyroid tumour using genetic alteration analysis & miRNA profiling
Authors:Aherne, ST; Smyth, PC; Flavin, RJ; Russell, SM; Denning, KM; Li, JH; Guenther, SM; O'Leary, JJ; Sheils, OM
Journal:Molecular Cancer
PubMed ID:
Background: Papillary thyroid carcinoma (PTC) frequently presents as multiple tumour-foci within a single thyroid gland or pluriform, with synchronous tumours comprising different histological variants, raising questions regarding its clonality. Among the genetic aberrations described in PTC, the BRAF V600E mutation and ret/PTC activation occur most commonly. Several studies have investigated ... More
Risk haplotype analysis for bovine paratuberculosis
Authors:Pinedo, PJ; Wang, CG; Li, Y; Rae, DO; Wu, RL
Journal:JOURNAL OF NEURAL TRANSMISSION
PubMed ID:
Paratuberculosis (Johne's disease), caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, is an important disease for bovines, although its genetic basis is poorly understood. In this study, three candidate genes were typed to study the associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and paratuberculosis susceptibility (measured in a 1 or 0 form) at ... More
Risk haplotype analysis for bovine paratuberculosis
Authors:Pinedo, PJ; Wang, CG; Li, Y; Rae, DO; Wu, RL
Journal:MAMMALIAN GENOME
PubMed ID:
Paratuberculosis (Johne's disease), caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, is an important disease for bovines, although its genetic basis is poorly understood. In this study, three candidate genes were typed to study the associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and paratuberculosis susceptibility (measured in a 1 or 0 form) at ... More
Association of Polymorphisms in Genes of the Homologous Recombination DNA Repair Pathway and Thyroid Cancer Risk
Authors:Bastos, HN; Antao, MR; Silva, SN; Azevedo, AP; Manita, I; Teixeira, V; Pina, JE; Gil, OM; Ferreira, TC; Limbert, E; Rueff, J; Gaspar, JF
Journal:THYROID
PubMed ID:
Background: Ionizing radiation exposure has been pointed out as a risk factor for thyroid cancer. The double-strand breaks induced by this carcinogen are usually repaired by homologous recombination repair pathway, a pathway that includes several polymorphic genes. Since there is a scarcity of data about the involvement of these gene ... More
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