Mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC
Mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC
Invitrogen™

Mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC

La variación de datos en la expresión de ARN se puede atribuir a una serie de factores, incluida la calidadMás información
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Número de catálogoCantidad
44567401 Kit
Número de catálogo 4456740
Precio (MXN)
-
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1 Kit
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La variación de datos en la expresión de ARN se puede atribuir a una serie de factores, incluida la calidad del material de partida, el nivel de celularidad y producción de ARN, la plataforma empleada y la persona que realiza en experimento. Para controlar estas fuentes de variabilidad, una serie de controles externos de ARN han sido desarrollados por el Consorcio de Control Externo de ARN (ERCC), un grupo ad hoc de organizaciones públicas, privadas y académicas dirigido por el National Institute of Standards and Technology (NIST, Instituto estadounidense de normas y tecnología), ha desarrollado un conjunto común de controles externos de ARN. Los controles constan de un conjunto de transcritos poliadenilados y sin marcar diseñados para añadir a los experimentos de análisis de ARN tras el aislamiento de la muestra para compararlas con un conjunto de criterios de rendimiento. Antes del diseño de estos controles universalmente aceptados resultaba difícil ejecutar una investigación exhaustiva de métricas fundamentales de rendimiento analítico. La marca de confianza en reactivos de ARN de calidad ha llevado al mercado las mezclas de control de sustancias añadidas de ERCC de Ambion™. Constan de mezclas preformuladas de 92 transcritos derivados y trazables de plásmidos de ADN certificados con la certificación NIST. Las transcripciones están diseñadas para ser de 250 a 2000 nt de longitud, que imitan los ARNm eucarióticos naturales.

Características clave del producto:

Lograr una medida estándar para la comparación de datos a través de experimentos de expresión génica
• Medir la sensibilidad (límite inferior de detección) y el rango dinámico de un experimento
•Cuantificar la expresión génica diferencial

Saque el máximo partido a los análisis de ARN
El análisis de ARN, incluidos los perfiles de expresión génica y el estudio del transcriptoma completo, puede llevar a una mejor comprensión de los patrones de expresión en estados de enfermedad. Además, proporciona una información más completa sobre las vías biológicas y los mecanismos moleculares que regulan el desarrollo y el destino celular y la evolución de la enfermedad. Los métodos tradicionales para el análisis de ARN, como la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) y los microarreglos, tienen una eficacia demostrada. En la actualidad, los sustituye la secuenciación de última generación, una alternativa digital de gran rendimiento. Debido a que cada método utiliza múltiples plataformas, y con la necesidad de comparar varias muestras a través de plataformas en todo el mundo, una medida estándar para la comparación de datos es necesaria. A medida que las capacidades del análisis de ARN se expandan, la necesidad de crear una visión estandarizada de los datos será aún más importante.

Lograr y comparar resultados con precisión confirmada
Las mezclas de sustancias añadidas de ARN ERCC Ambion™ se utilizan para crear una medición de referencia estándar de ARN tanto dentro de un experimento como a través de múltiples experimentos realizados utilizando varias muestras y plataformas. Gracias a las dos formulaciones de mezcla de sustancia añadida (figura 1), se pueden examinar varias mediciones, como la sensibilidad y el rango dinámico, para evaluar los distintos parámetros en un experimento o varios (figura 2). Además, las relaciones de cambio de expresión entre dos muestras se pueden calcular con un alto grado de confianza mediante la relación altamente concordante entre la sustancia añadida de ARN ExFold 1 y la sustancia añadida de ARN ExFold 2 (figura 3). Las mediciones se determinaron a través de concentraciones molares conocidas para cada transcripción dentro de spike-in mix y a través de asociación de las dos mezclas utilizando una combinación de relaciones a través de 4 subgrupos diferentes de los 92 transcritos. Los controles son ideales para experimentos de secuenciación de próxima generación, como en SOLiD™ System, y plataformas de microarreglos compatibles, como el Illumina™ Sentrix™ BeadChip.

Elija entre las opciones flexibles para las configuraciones del kit ERCC
Ya sea para medir el rango dinámico o la expresión génica de cambio-plegado, las mezclas de control de sustancias añadidas Ambion™ ERCC están disponibles en dos configuraciones de kit para satisfacer sus necesidades experimentales. Utilice la mezcla de control de sustancia añadida de ERCC para determinar el rango dinámico y el límite inferior de detección de la plataforma. Utilice las mezclas de sustancias añadidas de ERCC ExFold para evaluar la precisión de las mediciones de expresión génica diferencial.
Mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC 1*Mezcla de sustancia añadida ExFold 1*Mezcla de sustancia añadida ExFold 2*Agua libre de nucleasas
Mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC (n.º de cat. 4456740).10 μl1,75 ml
Mezclas de sustancias añadidas de ARN de ERCC ExFold (n.º cat. 4456739)10 μl10 μl1,75 ml

* Aunque la mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC 1 y la mezcla de sustancia añadida ExFold 1 contienen la misma formulación de transcripciones de ERCC, no sustituya la mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC 1 por la mezcla de sustancia añadida ExFold 1 para la evaluación de cambio-plegado. Utilice solo las mezclas de sustancias añadidas ExFold 1 y 2 con el mismo número de lote de fabricación.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Especificaciones
Para utilizar con (aplicación)Secuenciación de última generación
IncluyePlantillas de control
Línea de productosAmbion
Tipo de productoMezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC
Cantidad1 Kit
Tipo de controlControl de ARN
FormatoTubo
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
Este kit contiene:
• 10 μl de mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC 1
• 1,75 ml de agua sin nucleasas

- No guarde las mezclas de sustancia añadida en un congelador sin escarcha.

- Almacene la mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC 1* a –20 °C
- Almacene agua sin nucleasas a cualquier temperatura

Preguntas frecuentes

How do I analyze data from the ERCC controls?

There is a specific ERCC_Analysis Plugin for Torrent Suite Software. Please see the ERCC_Analysis Plugin User Bulletin (Publ. No. 4479068) for detailed information.

Where can I find the ERCC concentrations?

Please go to the ERCC RNA Spike-In Mix (Cat. No. 4456740) or ERCC Ex-Fold Spike-In Mix (Cat. No. 4456739) product page on www.thermofisher.com. Downloadable files are under the manuals section heading, click on Manual: ERCC Controls Analysis: ERCC RNA Spike-In Control Mixes.

Is there an ERCC-like product for bacteria or small RNA (or other non-polyA RNA species)?

No.

What is the difference between the ERCC RNA Spike-In Mix (Cat. No. 4456740) and the ERCC Ex-Fold Spike-In Mix (Cat. No. 4456739)?

The ERCC RNA Spike-In Mix (Cat. No. 4456740) includes Spike-In Mix 1 alone; it can be used to assess platform dynamic range and lower limit of detection. The ERCC Ex-Fold Spike-In Mix (Cat. No. 4456739). includes both Spike-In Mix 1 and Spike-In Mix 2. In addition to the performance measurements described above for the ERCC RNA Spike-In Mix, this kit can be used to assess the accuracy of measurements of differential gene expression on your platform. Please see the ERCC RNA Spike-In Control Mixes User Guide (Pub. No. 4455352) for detailed information.

What are the ERCC RNA Spike-In Control mixes (Cat. No. 4456740 & 4456739)?

The ERRC RNA Spike-In Control mixes are a set of external RNA controls developed by the External RNA Controls Consortium (ERCC) and NIST (National Institute of Standards and Technology). The set is comprised of 92 synthetic, unlabeled polyadenylated transcripts of various lengths for determining the limit of detection (LOD) and the dynamic range for mRNA expression studies (in eukaryotes). The spike-in mix should be added to the RNA sample after isolation but before making the library. For more information, please refer to ERCC RNA Spike-In Control Mixes User Guide (Publ. No. 4455352) and ERCC_Analysis Plugin User Bulletin (Publ. No. 4479068).