GeneChip™ Human Transcriptome Assay 2.0

Diseñado para potenciar los estudios de perfiles de expresión de última generación, el ensayo de transcriptoma humano 2.0 GeneChip™ permite ir más allá de la creación de perfiles de expresión a nivel de gen al proporcionar la cobertura y precisión necesarias para detectar con precisión todas las isoformas de transcripción conocidas producidas por un gen.

Consulte la hoja de datos para obtener más información sobre el contenido y la cobertura de HTA 2.0.

Exploración exhaustiva del transcriptoma
Las investigaciones científicas han demostrado que decenas de miles de genes humanos contienen cientos de miles de exones, que producen cientos de miles de isoformas de transcripción diferentes. Estas isoformas de transcripción se producen cuando los exones de un gen se pueden incluir dentro del ARN mensajero final procesado producido a partir de ese gen, o bien excluirlo de este. Hasta ahora, la medición y el análisis de estas isoformas de transcripción ha sido casi imposible debido a las limitaciones tecnológicas, los requisitos de entrada de muestras y la falta de capacidades/herramientas de análisis.

El análisis completo del transcriptoma requiere combinar la diversidad de transcripciones de varias fuentes de datos
La mayoría de los genes producen varias isoformas de transcripción y la medición de los cambios en la abundancia relativa de cada isoforma ofrece nuevos datos sobre la enfermedad y la biología. El ensayo HTA 2.0 ha combinado varias fuentes de datos para garantizar que pueda analizar de forma independiente la más amplia colección de isoformas de transcripción disponibles.

Fuentes de datos utilizadas para diseñar y anotar el ensayo
RefSeq                                    Vertebrate Genome Annotation (Vega) database
Ensembl                                   MGC Mammalian Gene Collection (v10)
UCSC Known Genes               www.noncode.org
UCSC lincRNA transcripts        lncRNA db
Broad Institute, Human Body Map lincRNAs y Catálogo TUCP (transcripciones de potencial de codificación incierta)

Mejores datos que 2 carriles completos de secuenciación
Consulte el folleto de HTA 2.0 en la sección Documentos que aparece a continuación para obtener información adicional. El ensayo HTA 2.0 proporciona una precisión y exactitud superiores junto con la visión más completa del transcriptoma.

Bioinformática integrada en el diseño de matrices; sin necesidad de montaje
El ensayo HTA 2.0 maximiza la cantidad de información única y valiosa posible minimizando la secuencia conservada sintetizada en la matriz. Este diseño de matriz de alta resolución contiene un número sin precedentes de > 6,0 millones de sondas que cubren transcripciones codificantes y transcripciones no codificantes. El 70 % de las sondas de esta matriz cubren exones para transcripciones de codificación y el 30 % restante de las sondas de la matriz cubren las uniones de empalme exon-exon y las transcripciones no codificantes. La cobertura incomparable de esta matriz proporciona la visión más profunda de todas las transcripciones codificantes y no codificantes disponibles.

Solución de análisis sencilla, rápida y gratuita
Por primera vez, el ensayo HTA 2.0, junto con el software Expression Console™ y el software TAC, brinda a los investigadores una solución completa, desde la toma de datos hasta la toma de decisiones, en cuestión de minutos. Esta solución de análisis completa se proporciona a todos los investigadores que utilizan nuestras matrices de expresión sin ningún coste adicional. Además, el análisis de datos HTA 2.0 es compatible con las mismas soluciones de análisis y proveedores de servicios que se utilizan para otros datos de matrices de expresiones.

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