GeneChip™ Human Transcriptome Assay 2.0

Der GeneChip™ Human Transkriptom Assay 2.0 wurde für Expressionsprofilierungsstudien der nächsten Generation entwickelt und ermöglicht Expressionsprofilierungen über die Genebene hinaus. Er bietet die Abdeckung und Genauigkeit, die für den zuverlässigen Nachweis aller bekannten Transkriptisoformen eines Gens erforderlich sind.

Weitere Informationen zum Inhalt und zur Abdeckung des HTA 2.0 finden Sie im Datenblatt.

Eingehende Erforschung des Transkriptoms
Untersuchungen haben gezeigt, dass die Zehntausende menschlicher Gene Hunderttausende Exons enthalten, die Hunderttausende verschiedener Transkriptisoformen produzieren. Diese Transkriptisoformen werden erzeugt, wenn die Exons eines Gens in die endgültige, verarbeitete Boten-RNA aufgenommen oder von ihr ausgeschlossen werden können, die aus diesem Gen produziert wurde. Bisher war die Messung und Analyse dieser Transkriptisoformen aufgrund technischer Einschränkungen, Anforderungen an die Probeneingabe und fehlender Analysefunktionen/Hilfsmittel nahezu unmöglich.

Eine umfassende Transkriptomanalyse erfordert die Kombination der Transkriptvielfalt aus mehreren Datenquellen
Die meisten Gene produzieren mehrere Transkriptisoformen, und die Messung von Veränderungen in der relativen Fülle jeder Isoform liefert neue Einblicke in Krankheiten und Biologie. HTA 2.0 nutzt mehrere Datenquellen, damit Sie eine der umfangreichsten verfügbaren Sammlungen von Transkriptisoformen eigenständig analysieren können.

Datenquellen, die für die Entwicklung und Kommentierung des Assays verwendet wurfen
RefSeq                                    Vertebrate Genome Annotation (Vega) database
Ensembl                                   MGC Mammalian Gene Collection (v10)
UCSC Known Genes               swww.noncode.org
UCSC LincRNA Transkripte        Katalog des lncRNA db
Broad Institute, Human Body Map lincRNAs und TUCP (Transkripte mit unsicherem Codierungspotenzial)

Bessere Daten als 2 vollständige Spuren der Sequenzierung
Weitere Informationen finden Sie im HTA 2.0-Flyer im Abschnitt „Dokumente“ weiter unten. HTA 2.0 bietet höchste Sorgfältigkeit und Präzision in Verbindung mit der umfassendsten Ansicht des Transkriptoms.

In das Array-Design integrierte Bioinformatik; kein Zusammenbau erforderlich
HTA 2.0 maximiert die mögliche Menge an einzigartigen und wertvollen Informationen, indem die konservierte Sequenz, die auf dem Array synthetisiert wird, minimiert wird. Dieses hochauflösende Array-Design enthält eine beispiellose Anzahl von >6 Millionen Sonden, die Codiertranskripte und nicht-codierende Transkripte abdecken. 70 % der Sonden auf diesem Array decken Exons für die Codierung von Transkripten ab, und die restlichen 30 % der Sonden auf dem Array decken Exon-Exon-Spleißverbindungen und nicht-codierende Transkripte ab. Die unvergleichliche Abdeckung dieses Arrays bietet einen tiefen Einblick in alle verfügbaren codierenden und nicht-codierenden Transkripte.

Einfache, schnelle und kostenlose Analyselösung
Zum ersten Mal bietet HTA 2.0 in Verbindung mit der Expression Console™ Software und TAC Software Forschern eine Komplettlösung – von der Datenerfassung bis hin zur Entscheidungsfindung in wenigen Minuten. Diese Komplettlösung für die Analyse wird allen Forschern, die unsere Expression-Arrays verwenden, ohne zusätzliche Kosten zur Verfügung gestellt. Darüber hinaus wird die HTA 2.0-Datenanalyse von denselben Analyselösungen und Dienstleistern unterstützt, die auch andere Expressionsarray-Daten unterstützen.

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