Le kit PGS ReproSeq pour le système Ion S5 fournit tous les réactifs et matériaux nécessaires à un flux de travail de séquençage de nouvelle génération (NGS) rapide, économique et complet pour l’analyse de l’aneuploïdie. Lorsqu’il est utilisé avec un système de séquençage Ion S5 et un système Ion Chef pour la préparation automatisée des modèles, le kit permet un flux de travail simple et de bout en bout pour la détection des aneuploïdies sur les 24 chromosomes (22 autosomes et les chromosomes X et Y) pour les laboratoires de recherche intéressés par l’évaluation fiable des échantillons de biopsie d’embryons pré-implantés.

En utilisant seulement 6 pg d’ADN d’une seule cellule, ou une entrée provenant de plusieurs cellules, le kit PGS ReproSeq pour le système Ion S5 permet une détection précise des événements liés au nombre de copies de chromosomes entiers et de bras de chromosomes (jusqu’à 17 événements de nombre de copies Mbp*) en 10 heures maximum**. Trois configurations de kit offrent une flexibilité complète de débit d’échantillons permettant une analyse rentable de 16, 24 ou 96 échantillons par cycle. Lorsqu’elle est associée à l’analyse réalisée grâce à Ion Reporter v5.4 ou ultérieure, l’interprétation des données est améliorée grâce à de nouvelles fonctionnalités telles que la détection du mosaïcisme, le masquage des sexes et l’amélioration du transfert des données.

Flux de travail NGS rentable avec flexibilité du débit d’échantillons
Le kit PGS ReproSeq pour le système Ion S5 offre évolutivité et flexibilité grâce à trois puces de séquençage — la puce Ion 510, la puce Ion 520 et la puce Ion 530 — pour prendre en charge différents niveaux de débit d’échantillons. Choisissez le kit adapté à vos besoins de débit pour traiter 16, 24 et jusqu’à 96 échantillons afin d’obtenir une flexibilité de débit qui s’adapte à vos coûts et qui permet à votre laboratoire de répondre aux fluctuations des échantillons et aux augmentations de volume d’échantillons.

Délai d’exécution rapide pour les échantillons sensibles au facteur temps
Optimisant la vitesse de séquençage des semi-conducteurs et la préparation automatisée des modèles par amplification isotherme sur le système Ion Chef, le kit PGS ReproSeq pour le système Ion S5 offre un flux de travail NGS de paillasse rapide pour les analyses de l’aneuploïdie. Passez d’une cellule unique ou de plusieurs cellules isolées d’un embryon pré-implantatoire à des données analysées généralement en moins de 10 heures lors du traitement de 16 échantillons maximum, 10 heures pour 24 échantillons ou 13 heures pour 96 échantillons maximum. Ce délai d’exécution rapide permet une identification fiable des embryons normaux chromosomiques pour la recherche génétique urgente.

Le kit PGS ReproSeq avec puces Ion 520 (24 échantillons/cycle) comprend tous les réactifs pour le traitement d’un total de 96 échantillons grâce à un flux de travail comprenant une amplification du génome entier, la construction de bibliothèques, la préparation de modèles et le chargement de puces sur l’instrument Ion Chef, et le séquençage à l’aide d’un système Ion S5.

Le kit contient :
• Kit Ion SingleSeq 96 (Réf. cat. N° A34763) — comprend des réactifs pour extraire, amplifier et marquer par code-barres l’ADN génomique pour la préparation de bibliothèques à partir d’échantillons de biopsie d’embryons pré-implantés, un processus pouvant être complété en moins de 4 heures (comprend le temps de manipulation)
• Ion S5 ExT Chef Supplies, Ion S5 Chef Solutions et Ion S5 ExT Chef PGS Reagents — contient des cartouches à usage unique préemballées pour la préparation automatisée des modèles et le chargement des puces (5 heures, comprend le temps de manipulation) par lesquelles l’ADN de la bibliothèque est amplifié de façon clonale sur une surface de microbille grâce à une réaction d’amplification isotherme basée sur une émulsion
• Ion S5 ExT Sequencing Solutions, Ion S5 ExT Sequencing Reagents — simplifie le séquençage avec des cartouches de réactifs jetables prêtes à l’emploi pour une configuration simple et rapide de l’instrument, en moins de 15 minutes de manipulation, pour une chimie de séquençage prenant en charge la précision et la qualité avancées des données
• Kit de puces Ion 520 (Réf. cat. N° A27761) — contient 4 puces à code-barres par kit pour le suivi des échantillons et les cycles de séquençage à l’aide du système Ion S5 ’

Remarques
• Ce kit est uniquement compatible avec les systèmes Ion Chef et Ion S5. Le système Ion S5 XL est recommandé pour un délai d’exécution rapide entre les cycles de séquençage. L’utilisation des kits avec le système Ion S5 nécessite beaucoup plus de temps d’analyse entre les cycles.
• Le kit PGS ReproSeq est compatible avec le logiciel Torrent Suite 5.4 et versions ultérieures. Mettez à jour votre serveur Torrent avec la dernière version disponible du logiciel Torrent Suite avant d’utiliser ces kits. Pour l’analyse des données, le logiciel Ion Reporter 5.4 ou versions ultérieures est recommandé.

*La détection d’événements liés au numéro de copies < 48 Mbp à l’aide du kit ReproSeq™ PGS avec puces Ion 530™ (96 échantillons/cycle) nécessite l’exécution de ≤24 échantillons sur une puce Ion 530
**Le délai d’exécution entre l’échantillon et les résultats analysés pour le kit ReproSeq PGS avec les puces Ion 510 (16 échantillons/cycle) est de 9,6 heures.