Elektronentransferdissoziation (Electron Transfer Dissociation, ETD)

Erzielen Sie mithilfe der optionalen Thermo Scientific™ Elektronentransferdissoziation (ETD) bessere Analysen von Proteinen und deren post-translationalen Modifikationen (PTMs). Im Gegensatz zur CID, die schwach gebundene Modifikationen von den Peptid-Kettenstrukturen abspaltet, induziert die ETD die Fragmentierung entlang der Peptid-Kettenstrukturen sequenzunabhängig, sodass labile Modifikationen zurückbleiben, die mit der Peptidkette verknüpft sind. Dadurch wird die Identifizierung der Modifikationsbereiche stark vereinfacht. ETD erzeugt hauptsächlich Fragment-Ionen des Typs C und Z, die die durch CID erzeugten Typ-B- und Y-Ionen ergänzen und so die Sequenzabdeckung und Proteinidentifikation erhöhen.

Die Elektronentransferdissoziation ist ein überaus nützliches Hilfsmittel für die Analyse post-translational modifizierter Proteine. Viele Thermo Scientific™ Ionenfallen- und Orbitrap™ Massenspektrometer können um die ETD-Funktion erweitert werden. Die Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ Software umfasst einzigartige Optionen, mit denen Anwender die durch ETD bereitgestellten Informationen voll ausschöpfen können.

• Die ETD erhält labile PTMs aufrecht, sodass eine einfache Identifizierung der Peptidsequenz und des Modifikationsbereiches möglich ist.
• Für die Top-Down-Analyse kann ETD mit der Protonentransferreaktion (PTR) kombiniert werden, wodurch Spektren intakter Proteine beträchtlich vereinfacht werden.
• Für Arbeitsabläufe mit isobaren Mass Tags geringer Masse kann die ETD mit der Pulsed Q-Dissoziation (PQD) kombiniert werden, wodurch der normale Cut-Off im unteren Massebereich eliminiert wird.
• Die meisten Thermo Scientific Ionenfallen der LTQ Serie und hybriden Orbitrap Ionenfallen-Massenspektrometer können um die ETD-Funktion erweitert werden.
• Die Proteome Discoverer Software enthält den firmeneigenen Z-Core-Datenbank-Suchalgorithmus, der speziell für ETD-Spektren optimiert wurde.
• Mit der Proteome Discoverer Software können sich ergänzende CID- und ETD-Ergebnisse zur Maximierung der Protein-Sequenzabdeckung leicht zusammengeführt werden.