Zero Blunt&trade; TOPO&trade; PCR Cloning Kit for Sequencing, with One Shot&trade; TOP10 Chemically Competent <i>E. coli</i>
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Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning Kit for Sequencing, with One Shot™ TOP10 Chemically Competent E. coli

Les kits de séquençage Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning offrent une stratégie de clonage en une seule étape, en 5Afficher plus
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Référence K287520
Prix (EUR)
934,00
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Quantité:
25 réactions
Prix (EUR)
934,00
Each
Les kits de séquençage Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning offrent une stratégie de clonage en une seule étape, en 5 minutes et très efficace pour l’insertion directe de produits PCR à extrémités franches, amplifiés par polymérase de relecture dans un vecteur plasmidique à des fins de séquençage. Chaque kit utilise le vecteur TOPO™ pCR™4Blunt (voir figure) avec des sites d’amorce de séquençage spécifiquement conçus, qui permettent, pour chaque réaction, d’augmenter la séquence d’insert et de réduire celle du vecteur. Ces kits incluent tout ce dont vous avez besoin pour cloner et sélectionner les vecteurs recombinants contenant le fragment de PCR de votre choix.

Vecteur TOPO™ PCR™4Bluntoptimisé pour le séquençage
Nous avons éliminé la majeure partie du site de clonage multiple du vecteur TOPO™ pCR™4Blunt pour raccourcir la distance entre les sites d’amorce de séquençage et le site d’insertion à une valeur aussi faible que 33 bp. Résultat : les réactions de séquençage diminuent la séquence de vecteur et augmentent celle de l’insertion. Le vecteur TOPO™ pCR4Blunt comprend des sites pour 4 amorces de séquençage communes : M13 direct, M13 inverse, T7 et T3. Les kits incluent une aliquote de chaque.
Sélection et manipulation de clones TOPO™ pCR™4Blunt
Le vecteur TOPO™ pCR™4Blunt contient à la fois des marqueurs de résistance à l’ampicilline et à la kanamycine et une fusion de gènes LacZα-ccdB pour une sélection positive. Le site de clonage multiple minimisé du vecteur inclut toujours des sites EcoRI de flanquement pour l’excision simplifiée des produits de PCR clonés et un site Sse8387I unique pour la génération des suppressions imbriquées avant le séquençage. Les promoteurs T7 et T3 sont également présents pour la transcription in vitro.

Clonage simplifié basé sur TOPO™
Grâce à la technologie de clonage TOPO™, il n’est pas nécessaire d’utiliser des amorces pour PCR contenant des séquences spécifiques ou des procédures post-PCR, de préparer les vecteurs ni d’effectuer d’autres étapes de manipulation longues d’ADN. Il suffit d’ajouter votre réaction PCR directement dans le vecteur chargé en topoisomérase, d’incuber pendant 5 minutes et de la transformer les cellules compétentes E. coli fournies.

Clonage efficace
Avec jusqu’à 95 % de clones porteurs de l’insert désiré, vous n’avez plus besoin d’analyser autant de clones, ce qui vous permet de gagner du temps et de l’argent. Le vecteur TOPO™ pCR™4Blunt utilisé dans ce kit est livré sans saillies pour une ligature efficace des produits PCR créés par relecture, des polymérases thermostables qui laissent des produits PCR avec des extrémités franches.

La norme en matière de clonage
En matière de clonage, la technologie de clonage TOPO™ est un partenaire fiable pour des milliers de scientifiques depuis plus de dix ans. Rapide, simple d’utilisation et efficace, le clonage TOPO™ a été appliqué à de nombreux vecteurs différents pour un large éventail d’applications.

Kit de clonage par PCR Zero Blunt™ TOPO™ pour séquençage—formats de kit
Le kit de clonage par PCR Zero Blunt™ TOPO™ pour séquençage peut être acheté avec une variété de cellules compétentes offrant différents avantages en fonction de vos besoins :

• Clonage général : Cellules TOP10 (No de catalogue K2875-J10, K2875-20, K2875-40)
• Clonage à haute efficacité : Cellules ™ TOP10 Electrocomp (No de catalogue K2880-20, K2880-40)
• Clonage général, résistance aux bactériophages T1 : DH5α-T1R (No de catalogue K2895-20)
• Croissance rapide : Mach1™-T1R chimiquement compétente E. Coli (No de catalogue K2835-20)

Liens connexes

Services de construction et de clonage de vecteurs personnalisés
Guide de sélection de kit de purification d’ADN plasmidique
Réactifs, instruments et fournitures pour PCR
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
Souche bactérienne ou de levuresTOP10
Type de celluleChimiquement compétent
Méthode de clonageBlunt TOPO™
À utiliser avec (application)Biologie de la chromatine
Gamme de produitsOne Shot
Type de produitKits de clonage PCR
AccélérateurT7, T3
Quantité25 réactions
VecteurVecteurs de clonage d’ADN Blunt
FormatKit
Unit SizeEach
Contenu et stockage
Boîte 1 :
• Vecteur PCR™ 4Blunt-TOPO™ activé par topoisomérase I
• Solution saline
• dNTPs
• Modèle de contrôle
• Amorce directes T3, T7, M13 et inverses M13
• Amorces de contrôle PCR
• Eau stérile

Stockez entre -5 et -30°C.
Tous les réactifs sont stables pendant 6 mois lorsqu’ils sont correctement stockés.

Encadré 2 :
• Cellules d’E. coli chimiquement compétentes One Shot™ ou Electrocomp™
• Milieu S.O.C.
• Plasmide de contrôle pUC19 superenroulé

Stockez entre -68 et -85°C.

Foire aux questions (FAQ)

What is the best molar ratio of PCR product:vector to use for TOPO TA cloning? Is there an equation to calculate the quantity to use?

We suggest starting with a molar ratio of 1:1 (insert:vector), with a range of 0.5:1 to 2:1. The quantity used in a TOPO cloning reaction is typically 5-10 ng of a 2 kb PCR product.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 (insert:vector ratio)

What is the best ratio of insert:vector to use for cloning? Is there an equation to calculate this?

The optimal ratio is 1:1 insert to vector. Optimization can be done using a ratio of 0.5-2 molecules of insert for every molecule of the vector.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 insert:vector ratio

I'm seeing a lot of vector-only colonies when I try to perform a negative control reaction using vector only (no insert) for a TOPO reaction. Is my TOPO vector re-ligating?

Using the vector only for transformation is not a recommended negative control. The process of TOPO-adaptation is not a 100% process, therefore, there will be “vector only” present in your mix, and colonies will be obtained.

I'm trying to clone in my phosphorylated PCR product into a TOPO vector, and I'm getting no colonies. However, when I clone the same product into a TA vector, everything works perfectly. Why is this?

Phosphorylated products can be TA cloned but not TOPO cloned. This is because the necessary phosphate group is contained within the topoisomerase-DNA intermediate complex of the vector. TOPO vectors have a 3' phosphate to which topoisomerase is covalently bound and a 5' phosphate. Non-TOPO linear vectors (TA and Blunt) have a 3' OH and a 5' phosphate. Phosphorylated products should be phosphatased (CIP) before TOPO cloning.

I'm able to get a lot of colonies, however, none contain my insert of interest. What should I do?

You may be cloning in an artifact. TA and TOPO Cloning are very efficient for small fragments (< 100 bp) present in certain PCR reactions. Gel-purify your PCR product using either a silica-based DNA purification system or electroelution. Be sure that all solutions are free of nucleases (avoid communal ethidium bromide baths, for example.)

Citations et références (7)

Citations et références
Abstract
Expression of human NAA11 (ARD1B) gene is tissue-specific and is regulated by DNA methylation.
Authors:Pang AL, Clark J, Chan WY, Rennert OM
Journal:Epigenetics
PubMed ID:22048246
'NAA10 gene encodes the catalytic subunit of N(alpha)-acetyltransferase NatA that catalyzes the acetylation of the N-termini of many eukaryotic proteins. A homologous gene called NAA11 is also present in mammalian cells. hNaa10p and hNaa11p are reported to be co-expressed in human cell cultures. In mouse tissues, however, Naa11 transcripts can ... More
The plant biotin synthase reaction. Identification and characterization of essential mitochondrial accessory protein components.
Authors:Picciocchi A, Douce R, Alban C,
Journal:J Biol Chem
PubMed ID:12714594
In plants, the last step of the biotin biosynthetic pathway is localized in mitochondria. This chemically complex reaction is catalyzed by the biotin synthase protein, encoded by the bio2 gene in Arabidopsis thaliana. Unidentified mitochondrial proteins in addition to the bio2 gene product are obligatory for the reaction to occur. ... More
Construction and testing of engineered zinc-finger proteins for sequence-specific modification of mtDNA.
Authors:Minczuk M, Kolasinska-Zwierz P, Murphy MP, Papworth MA
Journal:Nat Protoc
PubMed ID:20134433
Engineered zinc-finger proteins (ZFPs) are hybrid proteins developed to direct various effector domains (EDs) of choice to predetermined DNA sequences. They are used to alter gene expression and to modify DNA in a sequence-specific manner in vivo and in vitro. Until now, ZFPs have mostly been used to target DNA ... More
Quantification of adenosine-to-inosine editing of microRNAs using a conventional method.
Authors:Kawahara Y
Journal:Nat Protoc
PubMed ID:22743833
In this protocol, I describe a method for measuring the frequency of adenosine-to-inosine RNA editing of primary, precursor and mature forms of specific microRNAs (miRNAs) derived from the same source. The procedure involves reverse transcription (RT)-PCR amplification of regions containing the editing sites followed by subcloning of the PCR products ... More
Assembling the glycopeptide antibiotic scaffold: The biosynthesis of A47934 from Streptomyces toyocaensis NRRL15009.
Authors: Pootoolal Jeff; Thomas Michael G; Marshall C Gary; Neu John M; Hubbard Brian K; Walsh Christopher T; Wright Gerard D;
Journal:Proc Natl Acad Sci U S A
PubMed ID:12060705
The glycopeptide antibiotics vancomycin and teicoplanin are vital components of modern anti-infective chemotherapy exhibiting outstanding activity against Gram-positive pathogens including members of the genera Streptococcus, Staphylococcus, and Enterococcus. These antibiotics also provide fascinating examples of the chemical and associated biosynthetic complexity exploitable in the synthesis of natural products by actinomycetes ... More