Kit de purificación BigDye XTerminator™
Kit de purificación BigDye XTerminator™
Applied Biosystems™

Kit de purificación BigDye XTerminator™

El kit de purificación XTerminator™ BigDye es un método rápido y sencillo de purificación para reacciones de secuenciación de ADNMás información
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Número de catálogoCantidad
43764842 frascos
43764862 frascos
43764871000 preparaciones
43764852 frascos
Número de catálogo 4376484
Precio (USD)
5.457,00
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Cantidad:
2 frascos
Precio (USD)
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El kit de purificación XTerminator™ BigDye es un método rápido y sencillo de purificación para reacciones de secuenciación de ADN que elimina las sales y los terminadores BigDye™ no incorporados.Se acabaron las manchas de tinte.La limpieza se realiza en menos de 40 minutos y requiere menos de 10 minutos de trabajo.

•Elimine el trasvase de líquidos con una sola placa.
•Logre una eliminación completa de las manchas de colorante.
•Estabilice las muestras antes del análisis.
•Mejore el flujo de trabajo de secuenciación.
• Realice protocolos de forma manual o automatizada
• Obtenga resultados rápidos, fiables y reproducibles.

Proceso de purificación simple
Los métodos tradicionales de purificación, como la precipitación con etanol, requieren la adición de varios reactivos junto con los pasos de decantación y centrifugación.El kit de purificación XTerminator™ BigDye requiere la adición de tan solo dos reactivos que pueden añadirse de forma secuencial o mediante premezcla:

• Solución XTerminator™: elimina las sales libres y los terminadores de tinte no incorporados de la reacción posterior a la secuenciación.
• Solución SAM™: mejora el rendimiento de la solución XTerminator™ y estabiliza las reacciones posteriores a la purificación.

El protocolo es muy sencillo (consulte la figura 1):
1.Realice la secuenciación de ciclos con terminadores BigDye™.
2.Después de la secuenciación de ciclos, centrifugue brevemente la placa de reacción y, a continuación, pipetee el volumen correcto de solución SAM™ en cada pocillo de la placa.
3.Pipetee el volumen correcto de solución XTerminator™ en cada uno de los pocillos:
4.Mezcle brevemente el contenedor de la solución XTerminator™ con una mezcladora vorticial.
5.Mediante la punta de una pipeta de gran calibre (se recomiendan puntas de gran calibre), pipetee el volumen correcto de líquido en cada pocillo de la placa.
6.Cierre la placa mediante un sellado térmico o una película adhesiva transparente (n. º⁄de ref. 4306311).Mezcle durante 30 minutos con una mezcladora vorticial (se recomiendan mezcladoras vorticiales para microplacas de 96 pocillos y para microplacas de 384 pocillos) y centrifugue la placa de reacción brevemente.
7.Coloque la placa de reacción en el analizador de ADN Applied Biosystems.Seleccione el módulo y la placa de ejecución.

Excelente recuperación de fragmentos largos
No tendrá que sacrificar la longitud de la secuencia cuando utilice el kit de purificación BigDye XTerminator™.La figura 2 muestra los datos de la unidad de tecnología ADN del instituto Plant Biotechnology Institute (CNR-PBI) en Saskatoon (Canadá).La lectura de la base de Q20=1044 bp.

Recuperación de fragmentos cortos mejorada
Utilice el kit de purificación BigDye XTerminator™ para obtener datos de mayor calidad.La figura 3 muestra una comparación entre el kit de purificación XTerminator™ BigDye y la purificación basada en la precipitación con etanol realizada en la unidad de tecnología del ADN del instituto Plant Biotechnology Institute (CNR-PBI) en Saskatoon (Canadá).El kit de purificación XTerminator™ BigDye ofrece una recuperación de fragmentos cortos de categoría superior.La purificación del etanol produce datos de secuencia dañados por manchas de tinte.

Mayor estabilidad
Las placas de reacción selladas son estables durante 48 horas a temperatura ambiente o durante 10 días a 4 °C. Puede volver a ejecutar la misma muestra en caso de interrupción de la alimentación, fallo de equipo, etc. sin tener que repetir el experimento.Esto aumenta su flexibilidad al cargar una placa de reacción en un instrumento CE.

Módulos de ejecución disponibles
Applied Biosystems proporciona módulos de ejecución descargables para su uso con el kit de purificación BigDye XTerminator™ y el software de recopilación de datos.Estos módulos están concebidos para los analizadores 3100, 3100-Avant (con Data Collection v2.0 o superior), 3130⁄3130xl y 3730⁄3730xl.Los módulos de software para el kit de purificación BigDye XTerminator™ son compatibles con los sistemas operativos Windows™ 2000 y Windows™ XP y están disponibles en nuestra página de descarga de software:

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Para uso exclusivo en investigación.No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Especificaciones
Tipo de producto finalADN
Para utilizar con (aplicación)Secuenciación
Incluye2 frascos
N.º de reacciones2500
Línea de productosBigDye XTerminator, BigDye
Tipo de productoKit de purificación
Cantidad2 frascos
Tipo de muestraProductos de secuenciación
Cantidad de material de partida10 μl
ObjetivoReacciones de secuenciación
Tiempo de prueba40 min
FormatoKit
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
50 mL de solución XTerminator™ (almacenar a 4°C), 225 mL de solución SAM™ (almacenar a temperatura ambiente o a 4 °C)

Preguntas frecuentes

Can I store samples in BigDye Xterminator solution? If so, what is the optimal temperature, and for how long can I store it?

Yes, after cleaning the sequencing product using the BigDye XTerminator Purification Kit, the end product can be stored up to 10 days at either 4°C or –20°C.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

What is a dye blob?

After the cycle sequencing reaction is complete, unincorporated ddNTPs can form complexes that migrate more slowly than individual ddNTPs would. These complexes can interfere with electrokinetic injection, electrophoretic separation, and data analysis. In the electropherogram these can be observed as a region containing multicolored peaks of varying sizes or blobs, depending on the efficiency of the cleanup. In BigDyeTerminator v3.1 reactions, these blobs may appear around 70–80 bp and, in severe cases, 110–120 bp. For BigDye Terminator v1.1, the blobs will either migrate ahead of the data collection time (so they will not be visible) or they may be visible at the very beginning of the run.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

What are the different ways to clean up my sequencing reactions?

While there are many kits and methods available to clean up the extension products from a sequencing reaction, the ones that Thermo Fisher Scientific has formally tested and recommends are:

•BigDye XTerminator Purification Kit
•Ethanol precipitation
•Spin column/plate purification (e.g. Centri-Sep columns, DTR Kits from Edge Biosystems)

A list of alternative methods for purification is available in the DNA Sequencing by Capillary Electrophoresis: Applied Biosystems Chemistry Guide: Second Edition (Cat. No. 4305080, Rev. C, page 119). The guide can be found by searching the Thermo Fisher Scientific website with the Cat. No. 4305080.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

Does the BigDye XTerminator (including SAM Solution) contain any aerosols?

The BigDye Xterminator Solution and SAM Solution do not contain aerosols.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Nucleic Acid Purification and Analysis Support Center.

What kit do you recommend for cleanup of the cycle sequencing reaction?

For the purification of the sequencing reaction, we recommend the BigDye Xterminator Purification Kit. For reference, the following is the link to the BigDye Xterminator Purification Kit User Guide.

Additionally, our Sanger Sequencing Guide has additional recommendations starting on page 68 for purifying the sequencing reaction.