Single Cell-to-CT™ qRT-PCR Kit
Single Cell-to-CT™ qRT-PCR Kit
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Single Cell-to-CT™ qRT-PCR Kit

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El kit Ambion™ Single Cell-to-CT™ contiene un flujo de trabajo validado completo para el análisis de expresión génica para muestrasMás información
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Número de catálogoN.º de reacciones
4458236400 reacciones
445823750 reacciones
Número de catálogo 4458236
Precio (USD)
16.799,40
Each
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N.º de reacciones:
400 reacciones
Precio (USD)
16.799,40
Each
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El kit Ambion™ Single Cell-to-CT™ contiene un flujo de trabajo validado completo para el análisis de expresión génica para muestras que contienen 1–10 células. Cada kit contiene reactivos para la preparación de muestras, la transcripción inversa, la preamplificación y la qPCR que se han optimizado conjuntamente en un flujo de trabajo sencillo que se puede completar en solo cinco pasos (consulte la figura).

Características clave del producto:

• Flujo de trabajo preoptimizado para RT-PCR en tiempo real a partir de células individuales
• Sensibilidad máxima para el análisis de células individuales
• Rendimiento y reproducibilidad superiores en comparación con métodos alternativos
• Kit completo práctico y protocolo fácil de seguir

El protocolo preoptimizado garantiza el éxito y ahorra tiempo
Cada flujo de trabajo comienza con una sencilla preparación de muestras de siete minutos, en la que las células se lisan de forma eficaz y reproducible con un procesamiento mínimo en una solución compatible con RT-PCR posterior, sin necesidad de purificación. A esto le sigue el uso de Superscript RT™ para la transcripción inversa, la mezcla maestra TaqMan Preamp™ para amplificar el ADNc, y la mezcla maestra TaqMan™ Gene Expression para qPCR. Estos cuatro pasos se han desarrollado para proporcionar la máxima sensibilidad. Toda la muestra celular se mantiene en el mismo pocillo durante todo el procedimiento, por lo que no hay pérdida de muestra ni dilución del preciado material limitado, lo que podría afectar a la sensibilidad.

Sensibilidad de células individuales
La sensibilidad de los resultados de PCR en tiempo real puede verse afectada por la eficacia de la preparación de muestras, la transcripción inversa o la amplificación. El kit Single Cell-to-CT™ ha abordado cada una de estas áreas problemáticas potenciales para crear una solución que permita un análisis fiable y robusto de la expresión génica a partir de células únicas con máxima sensibilidad. La detección de equivalentes monocelulares mediante el kit Single Cell-to-CT™ demuestra la linealidad y sensibilidad adecuadas de los resultados de qPCR en comparación con un control de muestras de 100 células con una excelente reproducibilidad técnica (véase la figura). Tal como se esperaba, las células individuales presentan una mayor variabilidad debido a la heterogeneidad biológica inherente. Además, mediante la inclusión de un paso de preamplificación de ADNc, los objetivos de interés se amplifican con precisión antes de la PCR en tiempo real. Este paso crítico aumenta la señal de manera imparcial, ampliando el potencial de análisis de muestras limitadas. Se muestra la precisión y la mejora de la señal de un panel de 96 genes mediante preamplificación (consulte la figura).

Rendimiento y reproducibilidad superiores en comparación con los métodos alternativos
Los métodos tradicionales de preparación de muestras que utilizan disolventes orgánicos, filtros de fibra de vidrio o gránulos magnéticos no son adecuados para el análisis de una sola célula debido a la pérdida de la muestra a través de la precipitación incompleta del ARN, la unión y la elución. Además, la mayoría de los métodos caseros monocelulares que implican la simple ebullición para lisar células carecen de la capacidad de inactivar las RNasas endógenas para estabilizar los perfiles de expresión génica y pueden dar lugar a la división química del ARN y el arrastre de inhibidores, incluida la contaminación por ADNg, lo que puede afectar a todas las aplicaciones de qRT-PCR. Por el contrario, el kit Single Cell-to-CT™ muestra una sensibilidad y reproducibilidad superiores para el análisis de células individuales en comparación con los métodos tradicionales de purificación o los métodos de hervido casero (véase la figura).
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Para utilizar con (equipo)7000 System, 7300 System, 7500 System, 7900HT Fast System, 7900HT System, GeneAmp 9700, GeneAmp™ 2400, StepOne™, modo rápido, StepOne™, modo estándar, StepOnePlus™, modo rápido, StepOnePlus™, modo estándar, termociclador Veriti
Características ecológicasMenos recursos utilizados y menos residuos, menos peligroso
N.º de reacciones400 reacciones
Línea de productosAmbion, Cells-to-CT
Tiempo de purificación7 min
Cantidad400 reacciones
Tipo de muestraCélulas
Condiciones de envíoHielo seco
Material de partida1-10 células
Método de detecciónSonda de cebado
Para utilizar con (aplicación)RT-PCR
Método de PCR2-step RT-qPCR
Velocidad de reacciónrápida o estándar
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
• 400 µl de ADNasa I de una sola célula
• 4,0 ml de solución de lisis de una sola célula (almacenar a 4 °C)
• 400 µl de solución de parada de una sola célula
• 600 µl de SuperScript™ RTde una sola célula
• 50 ml de mezcla maestra de expresión génica TaqMan™ (almacenar a 4 °C)
• 2,1 ml de mezcla de preamplificador de una sola célula
• 1,2 ml mezcla VILO™ RT de una sola célula

Almacene los componentes del kit a - 20 °C, excepto la solución de parada de una sola célula y la mezcla maestra de expresión génica TaqMan™, que deben almacenarse a 4 °C.

Preguntas frecuentes

What can I do to improve the sensitivity of my qPCR assay?

If you are targeting a low-abundance gene, you may have trouble getting Ct values in a good, reliable range (Ct > 32). To increase the sensitivity of the assay, you may want to consider the following:

- Increase the amount of RNA input into your reverse transcription reaction, if possible
- Increase the amount of cDNA in your qPCR reaction (20% by volume max)
- Try a different reverse transcription kit, such as our SuperScript VILO Master Mix, for the highest cDNA yield possible
- Consider trying a one-step or Cells-to-CT type workflow (depending on your sample type)

Would the direct lysis approach to DNA/RNA analysis be a good alternative for very small samples?

With very small samples, it is always better to use a lysis-based solution so that you don't lose any of your sample. Cells-to-CT kits, for example, can accommodate as few as 10 cells. If your sample size is smaller than 10 cells, we recommend using the Single Cell-to-CT Kit.

Will the Cells-to-CT system work with my special cell line?

There is no reason why the Cells-to-CT system shouldn’t work with any cell line. However, due to differences in cell size and composition, the maximum number of cells per lysis reaction may be slightly different for different cell lines. We recommend testing for inhibition and optimal cell input by using the TaqMan Cells-to-CT and SYBR Green Cells-to-CT Control kits.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Real-Time PCR and Digital PCR Applications Support Center.

With the Single Cell-to-CT Kit, do samples need to be frozen immediately?

Samples can be placed at room temperature for up to 30 minutes following lysis, and for up to 2 hours after adding Stop Solution. Cell lysates, cDNA, and preamplification samples can all be frozen for future processing.

For single-cell analysis using the Single Cell-to-CT Kit, do I need to normalize my data?

We do not recommend normalizing to an endogenous control due to the biological variation and transcriptional noise exhibited by single cells. Because of this variation, normalization can actually increase the spread of calculated expression levels in single cells.

Citations & References (3)

Citations & References
Abstract
Single cell gene expression analysis of pluripotent stem cells.
Authors:Abruzzese RV, Fekete RA,
Journal:Methods Mol Biol
PubMed ID:23546759
Analyzing gene expression profiles from cells en masse provides an average profile for the population which may obscure differences in individual cells. Using an optimized workflow for qRT-PCR, gene expression profiles of undifferentiated pluripotent stem cells reveal distinct gene expression profiles for individual cells, and a large expression level range ... More
Toll-like receptor 4 engagement drives differentiation of human and murine dendritic cells from a pro- into an anti-inflammatory mode.
Authors:Luger R, Valookaran S, Knapp N, Vizzardelli C, Dohnal AM, Felzmann T,
Journal:PLoS One
PubMed ID:23408948
The dendritic cell (DC) coordinates innate and adaptive immunity to fight infections and cancer. Our observations reveal that DCs exposed to the microbial danger signal lipopolysaccharide (LPS) in the presence of interferon-? (IFN-?) acquire a continuously changing activation/maturation phenotype. The DCs' initial mode of action is pro-inflammatory via up-regulation among ... More
Interleukin-10 inhibits angiotensin II-induced decrease in neuronal potassium current.
Authors:Jiang N, Shi P, Desland F, Kitchen-Pareja MC, Sumners C,
Journal:Am J Physiol Cell Physiol
PubMed ID:23426971
Previously we demonstrated that viral-mediated increased expression of the anti-inflammatory cytokine interleukin-10 within the paraventricular nucleus of the hypothalamus significantly reduces blood pressure in normal rats made hypertensive by infusion of angiotensin II. However, the exact cellular locus of this interleukin-10 action within the paraventricular nucleus is unknown. In the ... More