El kit de ensayo APO-BrdU TUNEL proporciona los materiales necesarios para etiquetar las roturas de la cadena de ADN para la detección de células apoptóticas, así como muestras fijas de células de control positivas y negativas para evaluar el rendimiento del ensayo. También se incluyen protocolos completos para aplicaciones de citometría de flujo, aunque el kit también se puede adaptar para su uso con microscopía de fluorescencia. La detección final de la incorporación de BrdU en los sitios de rotura de ADN se consigue mediante un anticuerpo anti-BrdU etiquetado con colorante Alexa Fluor 488. El kit también incluye yoduro de propidio para determinar el contenido total de ADN celular.

El kit de ensayo APO-BrdU TUNEL detecta la fragmentación del ADN de las células apoptóticas mediante la explotación del hecho de que las roturas de ADN exponen una gran cantidad de extremos de 3´-hidroxilo. Estos grupos de hidroxilo pueden servir como puntos de partida para la desoxinucleotidil transferasa terminal (TdT), que añade desoxiribonucleótidos de una manera independiente de la plantilla. La adición del análogo de la deoxitimidina 5-bromo-2´-deoxiuridina 5´-trifosfato (BrdUTP) a la reacción de TdT sirve para etiquetar los sitios de rotura. Una vez incorporado al ADN, BrdU puede detectarse utilizando un anticuerpo anti-BrdU mediante técnicas inmunohistoquímicas estándar. Este método de etiquetado de roturas de ADN se conoce como etiquetado de final de corte de dUTP de terminal deoxinucleotidil transferasa o TUNEL.