El kit de metagenómica Ion 16S™ está diseñado para análisis rápidos, completos y con poblaciones microbianas mixtas muy variadas medianteMás información
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Número de catálogo
Cantidad
A26216
100 reacciones
Número de catálogo A26216
Precio (USD)
2.067,59
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El kit de metagenómica Ion 16S™ está diseñado para análisis rápidos, completos y con poblaciones microbianas mixtas muy variadas mediante el flujo de trabajo de secuenciación de semiconductores Ion Torrent™. El kit permite la amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de regiones hipervariables del gen ADNr 16S de bacterias. A continuación, los fragmentos amplificados se pueden secuenciar mediante el kit de secuenciación Ion PGM™ 400 en la plataforma Ion PGM™, además de analizarse mediante el módulo de análisis metagenómico de Ion 16S™ en el software Ion Reporter™.
Completo El kit incluye dos conjuntos de primers que se pueden utilizar para amplificar las correspondientes regiones hipervariables del gen ADNr 16S en bacterias: • Conjunto de primers V2-4-8 • Conjunto de primers V3-6, 7-9
Estos completos conjuntos de primers permiten una detección e identificación precisas de una amplia gama de bacterias hasta el nivel de género o especie. Los conjuntos de primers van acompañados de una mezcla maestra ambiental v2.0 que se ha optimizado para tolerar niveles elevados de inhibidores de PCR y para amplificar objetivos de muestras complejas, como muestras medioambientales, de alimentos, de tejido y otras muestras complejas. Además, el kit incluye un control positivo para la solución de problemas de experimentos.
Flexible Los conjuntos de primers se suministran como dos grupos. Cada grupo se puede utilizar individualmente o conjuntamente para permitir mayor flexibilidad en la configuración de experimentos. Cuando se combinan con los kits de adaptadores de códigos de barras Ion Xpress™, se pueden combinar muestras polimicrobianas múltiples en un único flujo de trabajo de secuenciación.
Flujo de trabajo completo Las secuencias generadas mediante el kit de metagenómica Ion 16S™ se pueden analizar directamente utilizando el módulo de análisis metagenómico Ion 16S™ en el software Ion Reporter™, lo que permite una evaluación rápida y semicuantitativa de muestras microbianas complejas.
Nota: este kit no es compatible con el kit de cuantificación de bibliotecas de iones (n.º de 4468802). Para la cuantificación precisa de amplicones generados con este kit, utilice el kit de cuantificación de bibliotecas universales de iones (n.º de cat. A26217).
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Método de detecciónIon Torrent Sequencing, Primer-Probe Detection
Para utilizar con (aplicación)Secuenciación
Para utilizar con (equipo)Ion GeneStudio™ S5 Series Sequencer
N.º de reacciones250 Reactions
PolimerasaTaq DNA Polymerase
Línea de productosIon Torrent
Cantidad100 reacciones
Tipo de muestraDNA
EspecieAll Species
Clase de organismo dianaAll Bacteria
Tiempo de pruebaFast
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
• DNA dilution buffer (7 mL) • 2 tubes 2X environmental master mix (0.8 mL per tube)
Store the above at 2-8°C.
• E. coli DNA control (40 μL) • Negative control water (1 mL) • 16S primer set V2-4-8 (300 μL) • 16S primer set V3-6,7-9 (300 μL)
Store the above at -5 to -30°C.
Preguntas frecuentes
What is the Ion 16S Metagenomics Kit designed for?
The Ion 16S Metagenomics Kit is designed for rapid analyses of polybacterial samples using Ion Torrent Sequencing technology. The kit includes two primer sets that selectively amplify the corresponding hypervariable regions of the 16S region in bacteria:
- Primer set V2-4-8
- Primer set V3-6, 7-9
Sequence the amplified fragments on the Ion PGM System and analyze the results with the Ion Reporter software Ion 16S Metagenomics Kit analyses module. The combination of the two primer pools allows for sequence-based identification of a broad range of bacteria within a mixed population.
I have run out of Environmental Master Mix v2.0 from the Ion 16S Metagenomics Kit (Cat. No. A26216). Do you offer this as a standalone item?
Yes. You can purchase the TaqMan Environmental Master Mix 2.0 (Cat. No. 4396838).
How many reactions can be performed with the Ion 16S Metagenomics Kit (Cat. No. A26216)?
For each sample, the protocol involves two PCR reactions, one with primer set V2-4-8 and one with primer set V3-6.7. However, the kit contains sufficient master mix for 100 reactions and each of the two primer pools has sufficient volume for 100 reactions. Thus, the kit contains sufficient reagents for 100 reactions/50 samples.
Note: 100 reactions is dependent upon on the master mix, which is the limiting reagent. As far as primers are concerned, there is sufficient volume to process another 50 samples.
How many PCR reactions can I perform using the 2X Environmental Master Mix within the Ion 16S Metagenomics Kit (Cat. No. A26216)?
It is sufficient for 100 PCR reactions.
Can I use the Ion 540 Kit - Chef to prepare samples from the Ion 16S Metagenomics Kit?
No, the Ion 16S Metagenomics Kit utilizes 400 bp reads, so it is incompatible with the Ion 540 Kit - Chef, which only yields 200 bp reads.