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Kit de aislamiento de transcriptomas RiboMinus™ Bacteria 2.0
Agotamiento altamente eficaz de 16S, 23S, y 5S ARNr de una variedad de especies El kit de aislamiento de transcriptomaMás información
| Número de catálogo | Cantidad |
|---|---|
| A47335 | 12 reacciones |
Número de catálogo A47335
Precio (USD)
-
Cantidad:
12 reacciones
Agotamiento altamente eficaz de 16S, 23S, y 5S ARNr de una variedad de especies
El kit de aislamiento de transcriptoma RiboMinus Bacteria 2.0 es un kit completo y automatizado que permite la eliminación eficaz y selectiva de ARN ribosomal bacteriano y arquebacteriano (ARNr) del ARN total intacto (100 ng a 5 μg) en menos de dos horas.
Características clave del kit RiboMinus Bacteria 2.0:
• Eficaz: la mezcla de sonda pan-procariota RiboMinus incluida ha mostrado con uniformidad menos del 10 % de las lecturas que corresponden a las lecturas de ARNr 16S y 23S
• Amplia gama de objetivos: diseñados con > 150 diseños de sondas dirigidos a objetivos de ARNr 16S, 23S y 5S de > 76 especies representativas de bacterias y arquebacterias de filos y subfilos comunes
• Cómodo: se incluyen los gránulos magnéticos Dynabeads MyOne Streptavidin C1, además del módulo y los protocolos de limpieza de los gránulos para los instrumentos Kingfisher
• Flexible: acomoda entradas de masa de 100 ng a 5 µg de ARN total; funciona con una amplia gama de muestras de ARN total con valores de RIN de 5,0 a 10,0
• Alta sensibilidad de detección: aumenta el número de lecturas de secuencia que se corresponden con transcripciones de codificación de proteínas en comparación con la versión anterior
• Adecuado para metatranscriptómicos: agote el ARNr de muchas especies microbianas en muestras metatranscriptómicas
Objetivo de ARNr del panorama de bacterias y arquebacterias
El kit RiboMinus Bacteria 2.0 se basa en la tecnología de captura de hibridación e incluye una nueva mezcla de sonda pan-procariota RiboMinus, que resulta en una disminución de 4 veces las lecturas ribosómicas restantes y muestra una mejora significativa con respecto a la mezcla de sonda bacteriana anterior. Esta nueva mezcla de sonda consta de más de 150 diseños de oligonucleótidos de ADNcs etiquetados con 3’-biotina. Estos diseños se crearon utilizando regiones altamente conservadas de ARN en 76 especies de pan-procariota (ver tabla a continuación) y se probaron con varias especies (ver lista de compatibilidad a continuación).
Se incluye el kit de limpieza Dynabeads MyOne Streptavidin C1
Una vez que la mezcla de sondas se ha hibridado selectivamente a las transcripciones de ARNr objetivo, la eliminación del complejo sonda-ARNr se completa mediante la captura en gránulos magnéticos Dynabeads MyOne Streptavidin C1, dejando el ARNr agotado. El kit RiboMinus Bacteria 2.0 incluye un módulo de limpieza basado en gránulos magnéticos para la concentración del ARNr agotado, lo que permite un manejo, capacidad de ampliación y automatización más sencillos en instrumentos KingFisher. El ARNr agotado resultante (ARN RiboMinus) es adecuado para el análisis de transcriptoma total por RNA-Seq u otras aplicaciones posteriores.
Compatibilidad
Se ha demostrado que la mezcla de sonda pan-procariota RiboMinus es compatible con las siguientes especies probadas:
Acinetobacter baumannii
Bacteroides thetaiotaomicron
Bifidobacterium longum subsp. infantis.
Campylobacter jejuni
Clostridioides difficile
Escherichia coli
Fusobacterium nucleatum
Helicobacter pylori
Janthinobacterium sp.
Moorella thermoacetica
Pseudomonas putida
Rickettsia rickettsia
Salmonella typhimurium
Pseudomonas aeruginosa
Salmonella enterica
Staphylococcus aureus
Thermoanaerobacter kivui
Vibrio cholerae
Vibrio fisheri
Se ha demostrado que la mezcla de sonda pan-procariota RiboMinus es compatible con las siguientes especies en función de la homología de secuencia:
Corynebacterium
Enterococcus faecalis
Gluconobacter
Myxococcus xanthus
Streptomyces coelicoflavus
El kit de aislamiento de transcriptoma RiboMinus Bacteria 2.0 es un kit completo y automatizado que permite la eliminación eficaz y selectiva de ARN ribosomal bacteriano y arquebacteriano (ARNr) del ARN total intacto (100 ng a 5 μg) en menos de dos horas.
Características clave del kit RiboMinus Bacteria 2.0:
• Eficaz: la mezcla de sonda pan-procariota RiboMinus incluida ha mostrado con uniformidad menos del 10 % de las lecturas que corresponden a las lecturas de ARNr 16S y 23S
• Amplia gama de objetivos: diseñados con > 150 diseños de sondas dirigidos a objetivos de ARNr 16S, 23S y 5S de > 76 especies representativas de bacterias y arquebacterias de filos y subfilos comunes
• Cómodo: se incluyen los gránulos magnéticos Dynabeads MyOne Streptavidin C1, además del módulo y los protocolos de limpieza de los gránulos para los instrumentos Kingfisher
• Flexible: acomoda entradas de masa de 100 ng a 5 µg de ARN total; funciona con una amplia gama de muestras de ARN total con valores de RIN de 5,0 a 10,0
• Alta sensibilidad de detección: aumenta el número de lecturas de secuencia que se corresponden con transcripciones de codificación de proteínas en comparación con la versión anterior
• Adecuado para metatranscriptómicos: agote el ARNr de muchas especies microbianas en muestras metatranscriptómicas
Objetivo de ARNr del panorama de bacterias y arquebacterias
El kit RiboMinus Bacteria 2.0 se basa en la tecnología de captura de hibridación e incluye una nueva mezcla de sonda pan-procariota RiboMinus, que resulta en una disminución de 4 veces las lecturas ribosómicas restantes y muestra una mejora significativa con respecto a la mezcla de sonda bacteriana anterior. Esta nueva mezcla de sonda consta de más de 150 diseños de oligonucleótidos de ADNcs etiquetados con 3’-biotina. Estos diseños se crearon utilizando regiones altamente conservadas de ARN en 76 especies de pan-procariota (ver tabla a continuación) y se probaron con varias especies (ver lista de compatibilidad a continuación).
Se incluye el kit de limpieza Dynabeads MyOne Streptavidin C1
Una vez que la mezcla de sondas se ha hibridado selectivamente a las transcripciones de ARNr objetivo, la eliminación del complejo sonda-ARNr se completa mediante la captura en gránulos magnéticos Dynabeads MyOne Streptavidin C1, dejando el ARNr agotado. El kit RiboMinus Bacteria 2.0 incluye un módulo de limpieza basado en gránulos magnéticos para la concentración del ARNr agotado, lo que permite un manejo, capacidad de ampliación y automatización más sencillos en instrumentos KingFisher. El ARNr agotado resultante (ARN RiboMinus) es adecuado para el análisis de transcriptoma total por RNA-Seq u otras aplicaciones posteriores.
Compatibilidad
Se ha demostrado que la mezcla de sonda pan-procariota RiboMinus es compatible con las siguientes especies probadas:
Acinetobacter baumannii
Bacteroides thetaiotaomicron
Bifidobacterium longum subsp. infantis.
Campylobacter jejuni
Clostridioides difficile
Escherichia coli
Fusobacterium nucleatum
Helicobacter pylori
Janthinobacterium sp.
Moorella thermoacetica
Pseudomonas putida
Rickettsia rickettsia
Salmonella typhimurium
Pseudomonas aeruginosa
Salmonella enterica
Staphylococcus aureus
Thermoanaerobacter kivui
Vibrio cholerae
Vibrio fisheri
Se ha demostrado que la mezcla de sonda pan-procariota RiboMinus es compatible con las siguientes especies en función de la homología de secuencia:
Corynebacterium
Enterococcus faecalis
Gluconobacter
Myxococcus xanthus
Streptomyces coelicoflavus
Para uso exclusivo en investigación.No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Tipo de producto finalARN de transcriptoma
Para utilizar con (aplicación)Secuenciación de última generación, análisis de micromatrices, PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR), PCR de transcriptasa inversa (RT-PCR), construcción de bibliotecas de ADNc
FormularioGránulo magnético
Compatibilidad de alto rendimientoNo compatible con alto rendimiento (manual)
N.º de reacciones12 reactions
Línea de productosRiboMinus
Cantidad12 reacciones
Cantidad de material de partidaDe 100 ng a 5 ug de ARN total
Tipo de sistemaRiboMinus
Isolation TechnologyGránulo magnético
Tipo de muestraARN total (bacteriano)
TargetARN de transcriptoma
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
Los kits de aislamiento RiboMinus incluyen gránulos magnéticos RiboMinus, sondas de bacterias o levaduras de humano/ratón RiboMinus y tampón de hibridación. El módulo opcional de concentración RiboMinus contiene cartuchos de centrifugado, tubos de lavado, tubos de recuperación, tampón de unión, tampón de lavado y agua sin ARNasa (tratada con DEPC). Almacene los módulos de aislamiento a +4 °C y el módulo de concentración a temperatura ambiente. Se garantiza la estabilidad de todos los reactivos durante 6 meses si se almacenan correctamente.