Software Proteome Discoverer

Identify and quantify peptides and proteins in complex biological samples using Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ software. Proteome Discoverer software simplifies a wide range of proteomics workflows, from protein and peptide identification to PTM analysis to isobaric mass tagging and both SILAC and label-free quantitation. It supports multiple database search algorithms and multiple dissociation techniques. Go beyond searching to discovering with intelligent INFERYS™ Rescoring and the CHIMERYS™ intelligent search algorithm by MSAID to substantially increase the number of unique peptide identifications.

El software Proteome Discoverer es compatible con varias técnicas de disociación, tecnologías de cuantificación y algoritmos de búsqueda en bases de datos para una completa cuantificación, caracterización e identificación de proteínas.

 

Completo

• Optimiza el procesamiento de datos de investigación de proteínas con flujos de trabajo flexibles, predefinidos o personalizables
• Obtenga más información con los algoritmos inteligentes INFERYS Rescoring y CHIMERYS
• Es compatible con varias técnicas de disociación (HCD, CID, ETD y UVPD) para una cobertura más completa e identificación fiable de PTM
• Admite etiquetado isobárico de masas (TMT, iTRAQ), etiquetado isotópico (SILAC) y cuantificación sin etiquetas
• Valida las identificaciones de péptidos y proteínas mediante la tasa de falsos positivos (FDR)
• Admite nodos para análisis top-down (ProsightPD) y biología estructural y entrecruzamiento (XL-MS)

Productivo y extensible

• Automatiza el análisis de datos y simplifica el análisis de datos de MSⁿ mediante flujos de trabajo predefinidos y personalizables
• Incluye la gestión del estudio para la asignación de la cuantificación a la información biológica sobre la muestra
• Utilice los resultados para afinar la recopilación de datos, como exportar listas de inclusión y exclusión para su importación directamente en métodos de instrumento
• Ilustra el contexto biológico mediante la anotación automática de proteínas identificadas con clasificaciones del Gene Ontology Consortium (GO), sitios web de PTM y referencias bibliográficas de las bases de datos públicos
• Facilita la comparación, el intercambio y la verificación de datos y es compatible con los estándares de datos desarrollados por la iniciativa Proteomics Standards Initiative (PSI) de la HUPO (Human Proteome Organization)
• Admite nodos de terceros para el procesamiento de datos y permite el procesamiento de grandes conjuntos de datos
• Algoritmos rápidos y sólidos potenciados por la inteligencia artificial para la selección de picos y la cuantificación de péptidos para extraer más información
• Obtenga estadísticas fiables y valide visualmente los resultados de cuantificación