Template Generation System II Kit
Template Generation System II Kit
Thermo Scientific™

Template Generation System II Kit

La tecnología de transposón Thermo Scientific es la primera tecnología que permite a los científicos insertar fragmentos de ADN linealMás información
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Número de catálogoCantidad
F70220 reactions
Número de catálogo F702
Precio (USD)
-
Cantidad:
20 reactions
Pedido a granel o personalizado
La tecnología de transposón Thermo Scientific es la primera tecnología que permite a los científicos insertar fragmentos de ADN lineal construidos en un blanco de ADN circular o lineal de forma aleatoria y muy eficiente. El kit Sistema de generación de moldes Thermo Scientific II (kit TGS II) se basa en la reacción de transposición del bacteriófago Mu. Este sistema se ha simplificado para trabajar in vitro, y se ha construido un transposon Mu artificial, denominado Entranceposon. La reacción es catalizada por una sola enzima, la transposasa MuA.

El kit TGS II proporciona las herramientas para insertar el Entranceposon en ADN extraño en lugares aleatorios. La inserción de un Entranceposon en ADN objetivo desconocido proporciona sitios de unión de primer para diferentes aplicaciones. En un único tubo de reacción tiene lugar un reacción de transposición in vitro simple y rápida.

Características:

• Proporciona moldes para la secuenciación de ADN de forma más sencilla y con menos tiempo de manipulación que cualquier otro método
• Miles de moldes listos para secuenciar a partir de una única reacción de transposición: Suficiente para secuenciar incluso grandes clones de ADN (por ejemplo, clones de BAC) sin fragmentación o subclonación
• El mapeo simple de las inserciones de Entranceposon por PCR de colonias o digestión de enzimas de restricción permite la secuenciación dirigida. Se necesitan menos reacciones de secuenciación para completar una secuencia que la secuenciación shotgun
• Primers universales: El kit incluye primers de secuenciación y mapeo, no se requieres primers personalizados.
• Secuencia bidireccional: Se puede utilizar un solo clon de molde para secuenciar el ADN flanqueante en ambos lados de la inserción de Entranceposon
• Hay tres genes de resistencia antibiótica diferentes disponibles en cada kit TGS II
• Todos los componentes necesarios, así como el manual de instrucciones detallado para realizar las reacciones, vienen incluidos en el kit. TGS II Kit es una versión actualizada del TGS I Kit.

Aplicaciones
el kit Template Generation System II está diseñado para insertar un Mou transposon artificial en ADN objetivo desconocido para proporcionar sitios de unión de primer para:

• Secuenciación rápida de moldes sin cebador walking ni cebadores personalizados
• Secuenciación de grandes clones de ADN directamente sin la engorrosa fragmentación en una biblioteca
• Inserción de sitios de cebado de PCR en el ADN objetivo con una secuencia desconocida
• Mutagénesis de inserción aleatoria de ADN clonado; amplificación directa, mapeo o secuenciación utilizando cebadores en el sitio de inserción
• Secuenciación con transposones frente a secuenciación tradicional
• Aplicaciones especiales:
• Secuenciación de BAC
• Reacción de transposición en ADN objetivo lineal
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
FormatoTubo
N.º de reacciones20 reacciones
Tipo de productoKit Template Generation System II
Cantidad20 reactions
Material de partidaADN
Suficiente para20 reacciones
Para utilizar con (aplicación)Preamplificación, Pre-amplification
FormularioSolución
Velocidad de reacciónFast
Unit SizeEach

Preguntas frecuentes

I performed colony-PCR mapping reactions to localize the Entranceposon insertions generated using the TGS Kit and analyzed the amplification products using agarose gel electrophoresis. The PCR product seemed to be a smear rather than an intact band. How do I avoid this problem?

Make sure not to use too much bacteria as a reaction template. Dilute the colony in 50-100 µL water or 0.9% saline and use 1 µL of the dilution per 20 µL PCR reaction. The excess of the E. coli genomic DNA in the PCR reaction typically results in a smeared amplification product. If you use a DNA polymerase from another manufacturer it is likely that the reaction conditions given in the TGS Kit Instruction Manual for the DyNAzyme EXT DNA Polymerase have to be modified.

Are there any stability problems arising from the fact that the whole Entranceposon is inserted into the target plasmid? Is the Entranceposon capable of further transposition inside host cells? How stable are the target plasmids that carry the Entranceposon?

The Entranceposonshave been designed so that the presence of the MuA Transposase enzyme is an absolute requirement for any transposition activity. The Entranceposons do not contain any genes from the bacteriophage Mu; only the DNA sequences from the right end of the Mu genome that are responsible for the transposase binding. However, the Entranceposons contain >50 bp inverted terminal repeats. To avoid instability resulting from homologous recombination between the repeats, the use of a recA mutant E. coli strain is recommended.

Is there any background problem in the bacteriophage Mu transposition system that is used in your Transposon Products?

No. The Entranceposons that come with the TGS and MGS Kits are non-replicating linear DNA molecules that are not maintained inside E. coli cells.

Is it possible to insert two copies of the Entranceposon in a single target plasmid when using TGS and MGS kits? How can I avoid such double insertions?

By using the optimized in vitro reaction conditions described in the system protocol, the frequency of double insertions is approximately 1% of all the insertion clones.

Is the insertion site selection of the Entranceposon in TGS and MGS kits based on consensus sequence recognition?

Under the optimized reaction conditions of the kits, the naturally occurring consensus sequence preference of the bacteriophage Mu transposition has been minimized. Therefore, the in vitro transposition reaction leads to essentially random insertions of the Entranceposon throughout the target DNA. The plasmid clones in which the Entranceposon insertion destroys either the marker gene conferring resistance to the selective agent or the DNA sequences responsible for the plasmid replication are incapable of amplifying under selective conditions and therefore cannot be isolated from bacterial colonies.

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