Kit multiplex SNaPshot™

El kit multiplex SNaPshot™ forma parte del sistemas de multiplexado SNaPshot™.El método basado en la extensión de cebadores del sistema de multiplexado SNaPshot™ permite multiplexar hasta 10 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP).Utilice este sistema para cribar y confirmar SNP, detectar variaciones de secuencias menores, evaluar la metilación del ADN, identificar cromosomas artificiales bacterianos (BAC) o el etiquetado general de fragmentos de restricción.

• Analice hasta 10 SNP de diferentes ampliconos en una reacción de extensión de base única.
• Separe los loci de SNP que difieran en un solo par de bases
• El aumento de la sensibilidad en comparación con la secuenciación estándar permite la detección de variantes menores (por ejemplo, mutaciones somáticas) en una muestra de prueba.
• Reduzca la complejidad de sus experimentos con este sistema de identificación de genotipos fácil de usa y rentable.
• Una gran cantidad de literatura científica demuestra la utilidad de la identificación de genotipos, la detección de mutaciones y el mapeo.

El kit SNaPshot™ Multiplex forma parte del sistema SNaPshot™ Multiplex:
1) Kit SNaPshot™ Multiplex (100, 1000, 5000 tamaños de reacción)
2) patrón de tamaño GeneScan™-120 LIZ™
3) Conjunto de patrones de matriz DS-02 para conjunto de tinción E5 adecuado para su instrumento

Cada uno de los tres componentes mencionados es necesario para ejecutar el kit SNaPshot™ Multiplex.Sin embargo, el conjunto de patrones de matriz solo se necesita en una configuración inicial única para calibrar el instrumento para el conjunto de tinción E5 específico de SNaPshot.

4) El software GeneMapper™ v.4.0 (o una versión superior) es el recomendado para en análisis de datos secundarios, ya que habilita la configuración de paneles definidos por el usuario y cubos para el análisis de datos automatizado.

Como alternativa, es posible realizar un análisis de picos manual y sencillo con el software PeakScanner™ 1.0 (descarga gratuita desde el sitio web) para los sistemas 310, 3100.Instrumentos 3130 y 3730 (PeakScanner™ no es compatible con los datos de instrumentos 3500).Para los instrumentos 3500, el software de análisis de datos principal del instrumento permite un dimensionamiento de fragmentos y una separación cromática similares a PeakScanner™.

5) El kit de enfoque de cebador SNaPshot (4329538) es un práctico kit de accesorios para un solo experimento o diseño de ensayo (panel):Analice los cebadores individuales para su ubicación aproximada de dimensionamiento.Esto determinará si dos oligonucleótidos producirán o no señales superpuestas cuando se ejecuten simultáneamente y permitirán la configuración de ventanas loci (cubos) adecuadas para el software de análisis GeneMapper.

Cribaje y confirmación de SNP
El sistema SNaPshot™ Multiplex es la herramienta perfecta para el cribaje y la validación de SNP.El kit ofrece un reactivo de extensión⁄terminación de base única de un tubo para el etiquetado de fragmentos de ADN.Se deben procesar los fragmentos de ADN en cualquier instrumento de electroforesis capilar Applied Biosystems™ con el patrón de tamaño GeneScan™-120 LIZ™ para determinar el tamaño de los fragmentos etiquetados.A continuación, se usa el software GeneMapper™ para analizar los datos y generar la nomenclatura alélica.El kit multiplex SNaPshot™ permite el multiplexing durante una extensión de una sola base de hasta 10 combinaciones de plantilla de cebador en un formato de un solo capilar y un solo tubo.

Evaluación de la metilación de ADN
El estudio de la metilación⁄epigenética se está alzando como un componente importante de la investigación del cáncer.En un ensayo típico para detectar metilación, el tratamiento con bisulfito del ADN desamina la citosina no metilada y la convierte en uracilo, mientras que la citosina metilada permanece no reactiva.El siguiente paso de amplificación por PCR convierte las bases de uracilo en timina.El uso de SNaPshot™ permite detectar las diferencias de las bases de las muestras tratadas y sin tratar para conocer el estado de metilación de las muestras.

Huella de BAC
Las bibliotecas de BAC nuevas requieren un método rápido y eficaz para la caracterización (también llamada «obtención de huellas») y el montaje de clones solapados (secuencias consensuadas contiguas), que después se agrupan en mapas físicos del cromosoma.Utilice el kit multiplex SNaPshot™ para obtener la huella de clones etiquetando fragmentos de BAC después de la digestión con endonucleasas de restricción.Los fragmentos etiquetados se pueden separar y detectar en cualquier instrumento de electroforesis capilar Applied Biosystems™.La información de tamaño del software GeneMapper™ v4.0 o superior se importa en programas posteriores de edición y montaje de clones solapados.

De forma similar, cualquier fragmento de restricción con una protuberancia de 13 cm (5') se puede marcar con un colorante fluorescente utilizando el reactivo SNaPshot™.

Solo para uso en investigación.No apto para uso en procedimientos diagnósticos.