Custom TaqMan™ SNP Genotyping Assay, non-human
Custom TaqMan™ SNP Genotyping Assay, non-human
Applied Biosystems™

Custom TaqMan™ SNP Genotyping Assay, non-human

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Los ensayos de identificación de genotipos de SNP Applied Biosystems TaqMan utilizan la composición química de la 5´-nucleasa TaqMan paraMás información
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Número de catálogoCantidad
4332076L (2400 reacciones), bajo pedido
4332075M (1000 reacciones), bajo pedido
4332077S (300 reacciones), bajo pedido
Número de catálogo 4332076
Precio (CLP)
1.223.999
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Cantidad:
L (2400 reacciones), bajo pedido
Los ensayos de identificación de genotipos de SNP Applied Biosystems TaqMan utilizan la composición química de la 5´-nucleasa TaqMan para amplificar y detectar polimorfismos específicos en muestras de ADN genómico purificado.Cada ensayo permite el genotipado de individuos para un polimorfismo de nucleótido único (SNP) y consta de dos primers específicos de secuencia y dos sondas de ligante de ranura menor TaqMan (MGB) con supresores no fluorescentes (NFQ).La primera sonda está etiquetada con colorante VIC para detectar la secuencia de alelo 1; la segunda sonda está etiquetada con colorante FAM para detectar la secuencia de alelo 2.

Los ensayos de genotipado TaqMan SNP personalizados se pueden diseñar con facilidad y sin cargo adicional si se envían secuencias objetivo de forma confidencial a nuestra segura herramienta de diseño de ensayos personalizados.La herramienta genera diseños de ensayo dirigidos a cualquier polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) en cualquier organismo, lo que ofrece una flexibilidad máxima para satisfacer sus necesidades de investigación.

Ventajas:
Demostrados: los ensayos robustos y químicos TaqMan de referencia ofrecen resultados exactos, reproducibles y fiables
Fáciles: cómodo formato de un tubo y flujo de trabajo sencillo que proporcionan un proceso sencillo para obtener unos resultados de confianza; no se requiere optimización
Flexibles: obtenga diseños de ensayo para cualquier SNP en cualquier organismo mediante nuestra segura herramienta de diseño de ensayos personalizados, sin cargo adicional
Probados: todos los ensayos personalizados han superado pruebas de control de calidad de exactitud de síntesis y exhaustividad de formulación

Tiempo aproximado de envío
De 4 a 6 días en América del Norte y de 6 a 10 días en Europa

La herramienta de diseño de ensayos personalizados gratuita genera ensayos para la detección de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), polimorfismos de múltiples nucleótidos (MNP) e indeles de hasta seis bases.Estos ensayos personalizados se han diseñado, sintetizado, formulado y optimizado, además de comprobarse en términos de control de calidad.

Los ensayos de genotipado TaqMan SNP requieren solo tres componentes de reacción para PCR: el ADN genómico purificado (1–20 ng), la solución de ensayo y la mezcla maestra de genotipado TaqMan (u otra mezcla maestra compatible) (se vende por separado).

Todos los diseños de ensayos son producto de nuestro sistema de bioinformática líder del sector, optimizado durante más de una década, aprovechando los datos de rendimiento de fabricación y de los ensayos.Los ensayos de TaqMan se han citado en más de 40 000 publicaciones y están protegidos por más de 350 patentes.

Mezcla maestra recomendada (se vende por separado):Mezcla maestra de genotipado TaqMan

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Concentración80X
Para utilizar con (equipo)7500 System, 7500 Fast System, 7900HT System, StepOne™, StepOnePlus™, ViiA™ 7 System, QuantStudio™ Absolute Q Digital PCR System, QuantStudio™ 3, QuantStudio™ 5, QuantStudio™ 6 Flex, QuantStudio™ 7 Flex, QuantStudio 6 Pro, QuantStudio 7 Pro, QuantStudio™ 12k Flex ProFlex PCR System*, VeritiPro*, SimpliAmp*, MiniAmp*, Automated Thermal Cycler** If a thermal cycler is used for PCR amplification, the optional pre-read and the post-read must be performed separately on a real-time PCR system in order to detect and record fluorescent signals.
Características ecológicasEmbalaje sostenible
N.º de reacciones12,000 (384-well), 2400 (96-well)
Línea de productosTaqMan
CantidadL (2400 reacciones), bajo pedido
Condiciones de envíoTemperatura ambiente
Tipo de muestraNo humano
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
1 tubo que contiene una mezcla de 40x (tamaños S y M) u 80x (tamaño L) de ensayo preformulado (2 sondas y 2 cebadores).

Almacenar a entre -15 y -25 °C.

Preguntas frecuentes

How much gDNA should I use with my TaqMan SNP Genotyping Assay?

We recommend using ~1-20 ng of good-quality gDNA per well. The gDNA should have an A260/A280 ratio of ~1.7-1.9. It is also important to try to add the same amount of gDNA to every well.

How do I submit a sequence for a custom TaqMan SNP Genotyping Assay?

You can use our Custom Assay Design Tool (https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/real-time-pcr-assays/snp-genotyping-taqman-assays/custom-snp-assays.html?ICID=ta-lm-custom%20taqman%20snp%20assay-Single%20Tube%20Custom%20TaqMan%C2%AE%20SNP%20Genotyping%20Assays) to submit your SNP sequence for an assay design. Alternatively, you can also use Primer Express Software to design an assay. The DNA sequence needs to have at least 30 bases on each side of the SNP site. The more sequence you provide, the greater chance you have of the tool creating a passing design. The ideal sequence length is ~ 200 bases on either side of the SNP site. For the best-performing assay, we recommend prescreening the sequence for other SNPs, repeats, and regions of low complexity. These variations should be masked prior to submitting the sequence. This will prevent the design tool from designing the primers or probe over those regions, which could reduce the efficiency of the assay if they were used. For more details on how to screen and mask the sequence, please follow the guidelines here (https://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/cms_042307.pdf).

How should I dilute the TaqMan SNP Genotyping Assays?

We recommend diluting the 40X and 80X TaqMan SNP Genotyping Assays to a 20X working stock with 1X TE buffer. The 1X TE buffer should be 10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA, pH 8.0, and be made using DNase-free, sterile-filtered water.

What does the context sequence in the AIF for TaqMan Drug Metabolism Genotyping Assays indicate?

The context sequence indicates the nucleotide sequence surrounding the probe. The SNP is annotated in brackets as follows: [allele 1_VIC labeled/allele 2_FAM labeled]. As an example the context file may look like: CTCCTCTGACACTGTCGCTTCTCCA[T/C]GGCATTAGATTTTCAGTCCTGCTCA. Please note: 25 nucleotides on each side of the SNP site is included in the context sequence. In this example, the SNP [T/C] can be read as T = allele 1 and is VIC dye labeled, C = Allele 2 and is FAM dye labeled. The context sequence of the assay is always shown in the forward orientation, regardless of the strand on which the SNP is typically reported. It is important to compare the context sequence of the SNP assay to the SNP sequence in the NCBI’s dbSNP database to determine which dye is associated with the minor allele.

What do all of the columns mean in the Assay Index File (AIF) that comes with each TaqMan Drug Metabolism Assay?

A detailed description that highlights all columns relevant to the DMEs can be found in the "Understanding Your Shipment Reference Guide" (https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/MAN0017153_UnderstandYourShipment_RG.pdf).