TaqMan™ Fast Cells-to-CT™ Kit
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TaqMan™ Fast Cells-to-CT™ Kit

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Número de catálogoCantidad
4399003100 reactions
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El kit Fast Cells-to-CT™ TaqMan™ hace posible el uso de instrumentación y química de PCR en tiempo real de ciclo rápido para realizar análisis de expresión génica directamente a partir de células cultivadas sin purificación de ARN.

El kit Fast Cells-to-CT TaqMan™ es:

• El flujo de trabajo completamente optimizado incluye reactivos de lisis celular con eliminación de ADNg, una mezcla de enzimas de RT, un tampón y una mezcla maestra de expresión génica TaqMan™
• Preparación de muestras rápida en 7 minutos, incluido el tratamiento con ADNasa, a temperatura ambiente; la mezcla maestra para PCR universal TaqMan™ Fast proporciona resultados de PCR en tiempo real en ∼35 minutos
• Muestras fáciles de lisar en un tubo o directamente en placas de cultivo de 96 o 384 pocillos
• Análisis de expresión génica de ejecución sólida en 10-100 000 células por muestra, con resultados equivalentes a los del ARN purificado
• Eficaz: contiene reactivos suficientes para generar 500 resultados de PCR en tiempo real a partir de 100 muestras iniciales

Solución completa y validada
La tecnología Cells-to-CT™ TaqMan™ es un método único para lisar células cultivadas, a la vez que elimina el ADN genómico (ADNg) y preserva la integridad del ARN. Además, el kit contiene reactivos de transcripción inversa (RT) y la mezcla maestra para PCR universal rápida TaqMan™ para el análisis de PCR en tiempo real rápido, y se ha probado y validado ampliamente con los ensayos de expresión génica TaqMan™ de referencia, que se venden por separado. Todos los componentes del kit se han optimizado para funcionar juntos para un rendimiento consistente y fiable, lo que elimina las conjeturas que implica el montaje de kits independientes para la preparación de muestras, la transcripción inversa y la PCR rápida en tiempo real.

Flujo de trabajo rápido y cómodo
El kit Fast Cells-to-CT™ TaqMan™ incorpora un procedimiento de preparación de muestras de 7 minutos (ver figura) para usar con 10-100.000 células de cultivo en tubos directamente o en placas de cultivo de 96 o 384 pocillos. Las células se lavan en PBS, a continuación, se lisan durante 5 minutos a temperatura ambiente; el tratamiento de ADNasa opcional se puede realizar de forma simultánea. Para finalizar la lisis, las células se deben someter a un proceso de incubación de 2 minutos con solución de parada a temperatura ambiente. El kit simplifica en gran medida un proceso tradicionalmente laborioso y lo reduce a 7 minutos.

Los lisados ya están preparados para la transcripción inversa con el sistema de RT optimizado incluido en el kit, o pueden almacenarse a -20 °C durante un máximo de 5 meses, para análisis futuros. La mezcla maestra para PCR universal rápida TaqMan™ suministrada proporciona resultados sensibles y reproducibles aproximadamente 3 veces más rápidos que los reactivos e instrumentos de PCR estándar. La combinación de una preparación de muestras rápida y sencilla y los resultados de PCR en tiempo real de ciclo rápido (∼35 minutos) permite una cuantificación más rápida de objetivos genéticos que la disponible anteriormente. El flujo de trabajo del kit Fast Cells-to-CT™ TaqMan™ reduce el tiempo desde la muestra hasta el resultado un 40 % o más, en comparación con la purificación de ARN tradicional y la PCR en tiempo real estándar.

Resultados sólidos, sensibles y confiables
El análisis de expresión génica precisos en una amplia gama de entrada de muestras para genes con varios niveles de expresión ha sido tradicionalmente un desafío para los investigadores. Por lo tanto, una solución sólida es importante para generar perfiles de ARN de unas pocas o muchas células. Se muestra la demostración de la excelente linealidad de la señal (R2 = 0,997) observada usando lisados del kit Fast Cells-to-CT™ TaqMan™ en 5 registros de entrada celular (10–105 células por reacción de lisis; ver figura). Por lo tanto, se puede usar un solo kit para el análisis de la expresión génica de muestras limitadas o densas, sin comprometer la integridad de los datos causada por los inhibidores de la PCR.

El rendimiento de la PCR de los lisados celulares con el kit Fast Cells-to-CT™ TaqMan™ fue equivalente al del ARN purificado, con la mezcla maestra para PCR universal rápida TaqMan™ suministrada (consulte la figura). Tanto los lisados del kit TaqMan™ Cells-to-CT™ como el ARN purificado mostraron una detección lineal en un rango de cinco logaritmos de equivalentes de entrada de células. La sensibilidad mejorada en la entrada de diez células con los lisados del kit TaqMan™ Fast Cells-to-CT™ en comparación con el ARN purificado, utilizando los mismos reactivos RT y PCR, resulta de una retención más eficaz de moléculas objetivo durante la preparación, es decir, sin pérdida de ARN normalmente asociada con la transferencia o el calentamiento de muestras.

El kit TaqMan™ Fast Cells-to-CT™ también demostró un rendimiento superior en comparación con el ARN transcrito de forma inversa y amplificado por PCR con el RT y la fórmula maestra rápida de Competitor Q’s. El rango dinámico observado utilizando los reactivos de Competitor Q’s con ciclado rápido fue de 102 a 105 equivalentes celulares, es decir, 1 logaritmo menos que los lisados del kit TaqMan™ Cells-to-CT™ o el ARN purificado amplificado con la fórmula maestra rápida de PCR universal TaqMan™ (véase la figura). La mezcla maestra rápida de PCR universal TaqMan™ está formulada para ofrecer resultados sensibles y reproducibles más rápido de lo posible con reactivos e instrumentos estándar, y es sólida en una amplia gama de genes y concentraciones objetivo.
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Para utilizar con (equipo)Sistema 7500 Fast, Sistema 7900HT, StepOne™, Fast Mode, StepOnePlus™, Fast Mode
FormatoTubo
Características ecológicasMenos recursos utilizados y menos residuos, menos peligroso
N.º de reacciones100 reacciones
Colorante de referencia pasivaROX (premezclado)
PolimerasaADN polimerasa
Línea de productosAmbion, Cells-to-CT, TaqMan
Tipo de productoKit Fast Cells-to-C
Cantidad100 reactions
Transcriptasa inversaM-MLV
Tipo de muestraCelda
Condiciones de envíoHielo seco
Suficiente para100 reacciones
Método de detecciónSonda de cebado
Para utilizar con (aplicación)Expresión génica
GC-Rich PCR PerformanceBajo
Método de PCRRT-qPCR de 2 paso
Velocidad de reacciónFast
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
Contiene:
• Solución de parada: Tubo de 500 µl
• ADNasa I: tubo de 55 µl
• Mezcla de enzimas 20X RT: Tubo de solución de lisis de 275 µl
•: Frasco de 5,5 ml
• Tampón de RT 2X: Frasco de 5,5 ml
• Mezcla maestra para PCR universal rápida TaqMan™: 4 × frasco de 1,25 ml

Almacenar la solución de parada, la ADNasa I y la mezcla de enzimas de RT 20X a -20 °C.
Almacenar la solución de lisis, el tampón de RT 2X y la mezcla maestra de expresión génica TaqMan™ a 4 °C.

Preguntas frecuentes

I'm seeing PCR products in the minus-RT control after performing my Cells-to-CT experiment. What does this mean?

If PCR products are seen in the minus-RT control reaction, but not in the no-template control, it indicates that genomic DNA remains in the sample and that genomic DNA was amplified in real-time PCR. Please follow the suggestions below:

- Ensure the DNase I is mixed thoroughly into the Lysis Solution.
- Use fewer cells per lysis reaction.
- Lyse cells using Lysis Solution that is at room temperature, and make sure that the lysis reaction occurs at room temperature.
You can also try increasing the incubation time of the lysis reaction to 8 minutes and/or using Lysis Solution that has been warmed up to 25 degrees C for cell lysis.

I'm getting PCR products in the no-template PCR control when performing a Cells-to-CT experiment. What could cause this?

PCR products in the no-template PCR control indicate that the sample is contaminated with DNA. More stringent steps need to be taken to control contamination.

I'm getting no PCR product or unexpected PCR products after performing a Cells-to-CT experiment. What could be the cause of this?

Please review the following possibilities and suggestions:

- A problem with adding or mixing the Stop Solution: ensure that the Stop Solution was added directly to the lysate, as components of the Lysis Solution may inhibit RT-PCR if not fully inactivated.
- The RNA was degraded: keep cells in PBS on ice before starting the cell lysis procedure.
- RNase in the sample was not completely inactivated: Too many cells could have been used or too much PBS left on the cells, diluting the lysis solution.
- The lysates sat too long before going to room temperature: Do not allow lysates to sit longer than 20 minutes at room temperature once the Stop Solution has been added.
- The sample does not contain the target RNA: Verify that the procedure is working by using the XenoRNA Control in the sample. Also check that your PCR primers can amplify your target under the PCR conditions you are using.

I ran out of stop solution for my Cells-to-CT experiment. Can I purchase it separately?

Yes, it is available in 1 mL aliquots (Cat. No. 4402960).

I have genomic DNA contamination in my Cells-to-CT reaction. How do I get rid of it?

1. Ensure that all medium is removed from the wells.
2. Wash with an equal volume of room temperature 1X PBS after the medium is removed.
3. Ensure that the reaction happens at room temperature (the lysis reaction may not reach room temperature if the plate is on ice, if the plate was quickly moved to the bench, or if a cold lysis solution was added).
4. Warm lysis solution to room temperature before adding to cells.
5. Allow the lysis reaction to proceed for 8 minutes at 25 degrees C.

Citations & References (3)

Citations & References
Abstract
Human cardiac tissue induces transdifferentiation of adult stem cells towards cardiomyocytes.
Authors:Perán M, Marchal JA, López E, Jiménez-Navarro M, Boulaiz H, Rodríguez-Serrano F, Carrillo E, Sánchez-Espin G, de Teresa E, Tosh D, Aranega A,
Journal:Cytotherapy
PubMed ID:20230311
'The goal was to induce the transdifferentiation (or conversion) of human adipose-derived stem cells to cardiomyocytes using an intracellular extract obtained from adult human heart tissue. Human adult stem cells from lipoaspirates were transiently permeabilized, exposed to human atrial extracts and allowed to recover in culture. After 21 days, the ... More
Impairment of peripheral circadian clocks precedes metabolic abnormalities in ob/ob mice.
Authors:Ando H, Kumazaki M, Motosugi Y, Ushijima K, Maekawa T, Ishikawa E, Fujimura A,
Journal:Endocrinology
PubMed ID:21285316
'Recent studies have demonstrated relationships between the dysfunction of circadian clocks and the development of metabolic abnormalities, but the chicken-and-egg question remains unresolved. To address this issue, we investigated the cause-effect relationship in obese, diabetic ob/ob mice. Compared with control C57BL/6J mice, the daily mRNA expression profiles of the clock ... More
Using osteoclast differentiation as a model for gene discovery in an undergraduate cell biology laboratory.
Authors:Birnbaum MJ, Picco J, Clements M, Witwicka H, Yang M, Hoey MT, Odgren PR,
Journal:Biochem Mol Biol Educ
PubMed ID:21567867
A key goal of molecular/cell biology/biotechnology is to identify essential genes in virtually every physiological process to uncover basic mechanisms of cell function and to establish potential targets of drug therapy combating human disease. This article describes a semester-long, project-oriented molecular/cellular/biotechnology laboratory providing students, within a framework of bone cell ... More