El panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2 consta de un solo par de cebadores y se utiliza para realizar la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) multiplex para la preparación de bibliotecas de amplicones a partir de «hotspots» genómicos que mutan con frecuencia en genes cancerígenos humanos (descargue la lista de mutaciones y genes diana del panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2). Basado en las mutaciones incluidas en nuestro panel de cáncer Ion AmpliSeq™ original, el último panel listo para su uso Ion AmpliSeq™proporciona:
• Compatibilidad mantenida con las muestras FFPE mientras se amplía el contenido mutacional para una mayor cobertura de genes adicionales y mutaciones «hotspot»
• Cobertura extremadamente uniforme para una secuenciación más eficaz y ahorrar costes
• Diseño mejorado de cebadores con optimización de nuevos conjuntos de cebadores e incluso un menor sesgo de cadena para una mayor confianza en la llamada de variantes exacta
• Detección de variantes mejorada con Torrent Suite Software v3.0 y el complemento Variant Caller en la detección de variantes de alelos bajos junto con una sensibilidad de indeles mejorada

Contenido mutacional adicional para estudios de investigación avanzada del cáncer
El panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2 está diseñado para amplificar 207 amplicones que abarcan aproximadamente 2800 mutaciones COSMIC de 50 oncogenes y genes supresores de tumores. Esto incluye las 739 mutaciones en COSMIC de 46 genes incluidas en el primer panel de cáncer Ion AmpliSeq™, junto con mutaciones hotspot añadidas de genes cancerígenos relevantes. A la vez que mantenemos la compatibilidad con muestras de FFPE y cubrimos los mismos objetivos incluidos en el primer panel de cáncer Ion AmpliSeq™, hemos incluido mutaciones adicionales mediante la adición de varios amplicones para hotspots en EZH2, GNA11, GNAQ e IDH2, así como de amplicones ligeramente más largos para otros genes. De esta forma, le ayudaremos a que avance en su investigación sobre el cáncer. El panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2 debe utilizarse con el ™Kit de bibliotecas Ion AmpliSeq 2.0.

Secuenciación más eficaz y rentable con cobertura extremadamente uniforme
El diseño de cebadores mejorado en el panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2 mejora con la uniformidad de cobertura de la tecnología Ion AmpliSeq™. Con una cobertura más uniforme, se puede conseguir una profundidad mínima en todos los amplicones utilizando mucha menos capacidad de procesamiento de secuenciación. En consecuencia, las muestras adicionales se pueden multiplexar con cualquiera de los chips Ion. Esto se traduce en unos menores costes, una secuenciación más eficaz y una mayor confianza en las nomenclaturas de variaciones. Además, el sesgo de cadena baja en los conjuntos de cebadores del panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2 proporciona mayor confianza en las llamadas de variantes exactas.

Sencillez, velocidad y capacidad de ampliación de la tecnología Ion AmpliSeq™
Con la sencillez de la tecnología Ion AmpliSeq™,el panel de puntos hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2 permite realizar estudios genéticos de cáncer desde tejidos FFPE con tan solo 10 ng de ADN de entrada para la construcción de bibliotecas dirigidas. El panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2 también mantiene el revolucionario flujo de trabajo utilizando equipos de PCR estándar y una reacción de PCR simple para una selección de secuencias objetivo basada en PCR multiplex, sin necesidad de una gran inversión de capital. Además, el panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2 también le permite crear bibliotecas selectivas rápidamente, en aproximadamente 3,5 horas. La capacidad de ampliación y flexibilidad también se conservan con el panel de hotspots de cáncer Ion AmpliSeq™ v2, lo que permite secuenciar una muestra o muestras de códigos de barras de multiplexing mediante cualquiera de los chips Ion.

Detección de variantes mejorada con el software Torrent Suite v3.0
El intuitivo software Torrent Suite y el complemento Variant Caller le permiten pasar del ADN extraído a las llamadas de variantes en tan solo 10 horas. Con las mejoras de los algoritmos, observará una detección de indeles más sensible, junto con una detección SNP más sensible con alelos de frecuencia más baja. A continuación, puede utilizar Ion Reporter™ Software para la anotación de variantes en ensayos de ADN rutinarios para el avance en investigaciones clínicas.