GeneChip™ Mouse Exon 1.0 ST Array

La matriz GeneChip ™ Mouse Exon 1.0 ST ofrece una nueva visión y una potente información clave para los investigadores.

Con aproximadamente cuatro sondas por exón y aproximadamente 40 sondas por gen, la matriz GeneChip™ Mouse Exon 1.0 ST permite dos niveles complementarios de expresión génica de análisis y empalme alternativo.

Varias sondas por exón permiten el análisis a «nivel exón» y permiten distinguir entre diferentes isoformas de un gen. Este análisis a nivel exón en una escala de genoma completo abre la puerta a la detección de alteraciones específicas en el uso de exones que pueden desempeñar un papel central en el mecanismo y la etiología de la enfermedad.

El segundo nivel es el análisis de expresión a «nivel gen», en el que se resumen varias sondas en diferentes exones en un valor de expresión de todas las transcripciones del mismo gen.

Las matrices de exones proporcionan la cobertura más completa del genoma, incluidas las secuencias transcritas, respaldadas empíricamente y predichas, lo que permite el descubrimiento de eventos novedosos no identificados anteriormente.

Características de la matriz
•Análisis de expresión de resolución más alta, interrogando más de 1 millón de clústeres de exones dentro de las regiones transcritas conocidas y previstas del genoma completo.

•Ensayo y reactivos GeneChip™ Whole Transcript (WT) personalizados que utilizan un método de cebado aleatorio para generar objetivos de detección en toda la longitud de las transcripciones.

•Soluciones de análisis de datos flexibles y anotaciones completas que le ofrecen la oportunidad de explorar y diseccionar los datos en varios flujos de trabajo definidos por el usuario.

Juegos de sondas: 1,2 millones
Clústeres de exones: ∼1 millón
Compatibles con ARNm de longitud completa putativo: 266 220 juegos de sondas
Compatibles con Ensembl Transcripts: 266 791 juegos de sondas
Compatibles con EST: 554 003 juegos de sondas
Compatibles con ARNm humano o de rata: 214 763 juegos de sondas
Compatibles con Gene Prediction: 835 897 juegos de sondas
Región de selección de sondas: en toda la longitud de las transcripciones
Región de sondas/selección de sondas: 4¹
Estrategia de sustracción de fondo: intensidad media de hasta 1000 sondas de fondo con el mismo contenido de GC
Total de características por matriz: >4 500 000
Cadena interrogada: Sense<sup>2

1</sup>Aproximadamente el 10 por ciento de los conjuntos de sondas de exones tienen menos de cuatro sondas debido a la longitud de la región de selección de sondas y a las limitaciones de la secuencia. ² Las sondas con mosaico en la matriz están diseñadas en orientación antisentido, lo que requiere que se hibriden objetivos etiquetados con cadena de sentido en la matriz. Por convención, la matriz se denomina matriz ST que representa la necesidad de utilizar objetivos de sentido (las muestras etiquetadas que se van a hibridar en la matriz).

Pack Básico

Para garantizar unos resultados óptimos con el sistema de matriz de exones GeneChip™, es muy recomendable que los nuevos usuarios empiecen con el Pack Básico.

Cada pack básico contiene:

•Matriz GeneChip™ Mouse Exon 1.0 ST, 30 matrices
•Reactivos de control y etiquetado de objetivo de sentido GeneChip™ WT, 30 reacciones
•Formación in situ, incluidos las siguientes matrices y reactivos para la formación:
•Matriz GeneChip™ Mouse Exon 1.0 ST, 10 matrices
•Kit de amplificación y síntesis de ADNc GeneChip™ WT, 10 reacciones
•Kit de etiquetado terminal GeneChip™ WT, 10 reacciones
•Módulo de limpieza de muestras GeneChip™, 30 reacciones
•Kit de control de ARN poli-A eucariótico GeneChip™, 100 reacciones
•Kit de control de hibridación GeneChip™, 30 reacciones

Nuevas demostraciones de XRAY para el análisis de expresión de exones

•Vea una demostración de dos minutos sobre un flujo de trabajo típico con XRAY de Biotique para el análisis de matrices de exones GeneChip™
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•Vea una demostración de dos minutos sobre la interpretación de los datos de la matriz de exones GeneChip™ de XRAY de Biotique
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