Axiom™ Genome-Wide CHB 1 Array Plate

Las matrices humanas optimizadas para la población en todo el genoma Axiom son paneles de identificación de genotipos que ofrecen la mejor cobertura genética de variantes comunes y raras para estudios de asociación de enfermedades en todo el genoma.

La placa de matriz de CHB 1 de todo el genoma Axiom maximiza la cobertura genómica de alelos comunes (MAF >5 %) del genoma chino Han.

Ventajas de las matrices optimizadas para la población en todo el genoma Axiom
Cada placa de matriz se ha diseñado para lograr una cobertura genómica ˜ 90 % (r² >0,8) en cada población objetivo, al tiempo que cubre marcadores con MAF del 1 al 5 % en áreas como:
• Categorías biológicas críticas (p. ej., codificación de SNP)
• Procesos biológicos (p. ej., genes metabolizadores de fármacos)
• Categorías de enfermedades (p. ej., enfermedad cardiovascular, cáncer, inmunidad/inflamación, MHC y SNC)
• SNP comunes y raras e inserciones/eliminaciones (indels) del Proyecto Internacional HapMap, Proyecto 1000 Genomas y asociaciones de enfermedades publicadas
• Contenido genómico probado por genotipo que ha demostrado ofrecer resultados informativos y fiables
• Marcadores preseleccionados para cobertura en categorías biológicas críticas, como la codificación de SNP, y rutas biológicas, como genes metabolizadores de fármacos o cardiovasculares
• Alta frecuencia de paso de muestra, frecuencia de llamada y reproducibilidad
• Compatible con el kit de reactivos Axiom 2.0, el instrumento GeneTitan™ MC, el flujo de trabajo automático o manual y el software Genotyping Console™ Software

Otras matrices de cobertura máxima para todo el genoma
Estas placas de matriz están diseñadas para maximizar la cobertura del genoma completo de alelos comunes y raros, incluidos los SNP dentro de los 10 kb de genes.
• Placa de matriz Axiom Genome-Wide CEU 1: la primera matriz rentable para maximizar la cobertura de variantes raras (MAF >1 %) para poblaciones europeas
• Placa de matriz Axiom Genome-Wide ASI 1: la primera matriz diseñada para maximizar la cobertura genómica de alelos raros (MAF >1 %) de un genoma de consenso de Asia Oriental (JPT+CHB)
• Agrupación de conjuntos de matrices Axiom Genome-Wide CHB 1 y CHB 2 - Esta agrupación de conjuntos contiene la placa de matriz Axiom Genome-Wide CHB 1 y la placa de matriz Axiom Genome-Wide CHB 2. La placa de matriz Axiom Genome-Wide CHB 1 maximiza la cobertura genómica de alelos comunes (MAF >5 %) del genoma chino Han. La placa de matriz Axiom Genome-Wide CHB 2 está diseñada para dirigirse a variantes raras (MAF 2-5 %) como complemento de la placa de matriz Axiom Genome-Wide CHB 1
• La placa de matriz Axiom Genome-Wide CHB 2 - Esta matriz está diseñada para dirigirse a variantes raras (MAF 2-5 %) como complemento de la placa de matriz Axiom Genome-Wide CHB 1. El juego del conjunto de matrices de CHB 1 y CHB 2 en todo el genoma Axiom permite obtener la cobertura más completa de todo el genoma disponible en todo el mercado en poblaciones de CHB. Se puede acceder a la placa de matriz de CHB 2 en todo el genoma Axiom diseñada para seleccionar variantes raras (MAF del 2 al 5 %) a partir de 901842.
• El conjunto de placas de matriz de PanAFR en todo el genoma Axiom: la primera matriz que ofrece cobertura genómica panafricana, con ≥ 90 % de cobertura genética de variantes comunes y raras (MAF >2 %) del genoma Yoruba (África occidental) y > 85 % de cobertura de variantes comunes y raras (MAF >2 %) de los genomas Luhya y Maasi (África oriental). Este conjunto de matrices también ofrece una alta cobertura genómica (>85 %) en poblaciones mezcladas con ascendencia africana occidental.

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Productos necesarios
Axiom Analysis Suite
Software de Consola de Comandos GeneChip
Instrumento multicanal GeneTitan