Kit de purificación de ADN de microbioma PureLink™
Kit de purificación de ADN de microbioma PureLink™
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Kit de purificación de ADN de microbioma PureLink™

El kit de purificación de ADN de microbioma PureLink™ permite una purificación rápida de ADN microbiano y de huésped deMás información
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Número de catálogoCantidad
A297901 kit
Número de catálogo A29790
Precio (CLP)
396.040
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Cantidad:
1 kit
Precio (CLP)
396.040
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El kit de purificación de ADN de microbioma PureLink™ permite una purificación rápida de ADN microbiano y de huésped de alta calidad a partir de una amplia variedad de tipos de muestras, incluidas muestras complejas como de heces y suelos. El kit utiliza la probada tecnología de columnas de centrifugación PureLink para obtener sólidas producciones de ADN purificado listo para PCR, secuenciación u otras aplicaciones posteriores. El enfoque de triple lisis altamente eficaz, la eliminación rápida de inhibidores y su versatilidad hacen que sea el kit definitivo para proyectos de investigación de microbioma, así como para programas destinados a la detección rápida de bacterias patógenas en varias muestras.

Características del kit de purificación de ADN microbioma PureLink:

• Lisis eficiente de todos los microorganismos (incluyendo especies duraderas con paredes celulares más gruesas y complejas) por una combinación de calor, químicos, y la interrupción mecánica con microesferas especializadas
• Eliminación de compuestos inhibidores por precipitación utilizando un novedoso tampón de limpieza
• Protocolos optimizados para numerosas muestras biológicas
• Recuperación de ADN de alta pureza compatible con aplicaciones de flujo descendente comunes como qPCR y secuenciación de próxima generación

Un solo kit para aislar el ADN microbiano y huésped de un conjunto diverso de tipos de muestras
El kit de purificación de ADN microbioma PureLink minimiza la necesidad de solicitar kits individuales para tipos de muestras específicos, ya que se ha optimizado para su uso con una amplia gama de muestras biológicas.

El kit permite la purificación del ADN microbiano y, si procede, de ADN huésped a partir de las siguientes muestras:

• Heces
• Orina
• Saliva
• Hisopos (vaginal, bucal, de piel, rectal, ambiental)
• Medios de transporte
• Medios de crecimiento
• Suelo

Análisis del microbioma humano
El cuerpo humano está poblado por 100 trillones de bacterias, arqueas, hongos, protistas y virus, los cuales juegan un papel fundamental en nuestro bienestar. El término microbioma se refiere a los diferentes microbios de esas comunidades. Actualmente, sus genes son el método más directo para identificar estos organismos. Las desviaciones de las composiciones microbianas saludables se han relacionado con muchas enfermedades humanas, incluyendo la enfermedad inflamatoria intestinal, la obesidad, el cáncer, el asma, la diabetes y alergias.

La purificación del ADN microbiano agregado en una muestra biológica es un paso importante en la comprensión de cómo el microbioma influye en la salud humana. Es de suma importancia que el ADN recuperado refleje con precisión la representación de los diversos microbios en la muestra de la comunidad. El enfoque de disrupción mecánica y triple lisis utilizado en el kit de ADN microbioma PureLink ayuda a garantizar que el ADN microbiano de incluso las muestras más duras, como las bacterias grampositivas que se encuentran en las heces, pueda recuperarse e identificar todo el espectro de microbios presentes.
Para uso exclusivo en investigación.No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Tipo de columnaColumna de centrifugación
Volumen de elución50 to 200 μL
Tipo de producto finalMicrobial and host DNA
Para utilizar con (aplicación)Secuenciación de próxima generación, PCR en tiempo real, PCR
Compatibilidad de alto rendimientoNo compatible con alto rendimiento (manual)
Cantidad1 kit
Tipo de muestraBacteria, Muestras bucales, Células, Alimentos y medio ambiente, Host DNA from Stool, Swabs (Buccal, Vaginal, Skin, Rectal, or Environmental), Cells, Food and Environmental
BásculaMini
Condiciones de envíoTemperatura ambiente
Cantidad de material de partidaBuccal/Vaginal/Skin/Rectal/Environmental Swab: 1 swab
Microbial Culture: ≤5 mL
Saliva: ≤2 mL
Soil: ≤2 g
Stool: ≤2 g
Urine: ≤10 mL
Tiempo de pruebaUp to 55 min. (Including sample homogenization)
Producción≤25 μg
Isolation TechnologyColumna de centrifugación
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
• Tampón de lisis S1, 1 x 40 ml
• Potenciador de lisis S2, 1 x 5 ml
• Tampón de limpieza S3, 1 x 12,5 ml
• Tampón de unión S4, 1 x 45 ml
• Concentrado de tampón S5, 1 x 13 ml
• Tampón de elución S6, 1 x 5 ml
• Columnas de centrifugación PureLink con tubos de recogida, 50 columnas y tubos
• Tubos de recogida PureLink, 100 tubos
• Tubos de microesferas*, 50 tubos que contienen microesferas especializadas
* se envía en una caja separada.

Almacenar a temperatura ambiente.

Preguntas frecuentes

I am using the PureLink Microbiome DNA Purification Kit (Cat. No. A29790). When should I remove the swab?

The swab should be removed after incubation, prior to bead beating.

Does the elution buffer in the PureLink Microbiome DNA Purification Kit (Cat. No. A29790) contain EDTA?

Yes, the elution buffer in the PureLink Microbiome DNA Purification Kit contains EDTA. An alternative that does not contain EDTA is Tris Buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0-9.0). Eluting in water is possible, but the low pH of water could lead to reduced stability and less accurate OD readings.

When using the PureLink Microbiome DNA Purification Kit with soil samples, I am getting less than 400 µL supernatant after lysis. Can you provide me with any suggestions?

For some samples, including soil and stool samples, it can be difficult to withdraw 400 µL supernatant while avoiding debris. If less than 250 µL of supernatant is transferred, add S1-Lysis buffer to bring the volume to 400 µL, before adding S3-Cleanup Buffer.

I am getting low yield using PureLink Microbiome DNA Purification Kit. How can I improve the yield?

Low yield could be caused by inefficient lysis and/or low levels of DNA in the sample. Please try heating samples at 95 degrees C for 5-10 minutes instead of 65 degrees C for 10 minutes after adding S2-Lysis Enhancer. Bead beat for a longer time or at a higher power setting. You can also try to perform the experiment with more starting material, but do not exceed what we specify in the protocol. However for some challenging samples, too much starting material can also result in low yield. In this case, please try less starting material and/or increase the volume of S1-Lysis Buffer.

There are inhibitors in the isolated DNA from environmental samples using PureLink Microbiome DNA Purification Kit. Is there a way to rescue it and obtain good PCR results?

There are several options to rescue your DNA obtain good PCR results including diluting your DNA sample, using specific enzymes, and/or using an additive. The methods are described below:

- Dilute your DNA sample 10-100 times prior to PCR which will dilute out the contaminants while the PCR signal in many cases will remain strong.
- Use “tough” enzymes that were specifically designed and optimized to be effective in harsh environments, and work in the presence of high levels of inhibitors, for instance, TaqPath qPCR Master Mix, CG Reagent.
- Use a BSA additive for the PCR reaction. In most cases, if used at appropriate concentration, BSA can rescue your sample.

You can also try repeating the purification with less starting material or increased volume of S1-Lysis buffer. Additionally, after the addition of the S3- Cleanup buffer, you can try incubating the sample for 10 minutes on ice before centrifugation.

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Citations & References (1)

Citations & References
Abstract
Evaluation of a Highly Efficient DNA Extraction Method for Bacillus anthracis Endospores.
Authors:Knüpfer M,Braun P,Baumann K,Rehn A,Antwerpen M,Grass G,Wölfel AR
Journal:Microorganisms
PubMed ID:32443768
A variety of methods have been established in order to optimize the accessibility of DNA originating from Bacillus anthracis cells and endospores to facilitate highly sensitive molecular diagnostics. However, most endospore lysis techniques have not been evaluated in respect to their quantitative proficiencies. Here, we started by systematically assessing the ... More