Converge™ Software Case Management and NGS Data Analysis License

Esta licencia combinada proporciona acceso a la aplicación Case Management y al módulo de análisis de datos NGS del software Converge v2.1 (se adquiere por separado). El software Converge es una plataforma empresarial modular todo en uno de Thermo Fisher Scientific que proporciona software integrado de análisis y gestión de datos de ADN para laboratorios forenses.

Ventajas y características principales:
• Analice los datos de NGS desde el panel Precision ID GlobalFiler NGS STR v2, los paneles de región de control o de genoma completo de ABDNmt Precision ID mtDNA, el panel de identidad Precision ID y el panel de ancestros Precision ID Ancestry
• El plugin HID Genotyper contiene bioinformática optimizada para el análisis del panel Precision ID GlobalFiler NGS STR Panel v2
• Realice comparaciones relevantes de perfiles de ADN (de CE a CE, de CE a NGS, de NGS a NGS)

Módulo de análisis de datos de NGS
El módulo de análisis de datos de NGS permite a los usuarios analizar los datos de STR, SNP o mtDNA de los flujos de trabajo de Precision ID y es necesario generar perfiles a partir del panel Precision ID GlobalFiler NGS STR v2 de Applied Biosystems. La funcionalidad del análisis de NGS incluye información sobre la llamada a alelos STR, motivos de secuencia de STR y SNP en regiones de flancos, así como la capacidad de distinguir heterocigotos isométricos (alelos de la misma longitud de fragmento, pero que contienen secuencias diferentes). Estas fuentes adicionales de diversidad alélica pueden ser útiles tanto en el análisis de mezcla como en la interpretación de parentesco. Con una interfaz similar a la del software GeneMapper ID-X de Applied Biosystems, los analistas forenses podrán evaluar rápidamente los datos de NGS utilizando valores de calidad de proceso (PQV) conocidos y marcadores como el número de alelo (AN), los alelos fuera de escalera (OL), la relación de altura máxima (PHR), valores inferiores al umbral estocástico (BST) y la concordancia del control (CC). El módulo de NGS ofrece ajustes de análisis preconfigurados que el laboratorio puede modificar según sea necesario. Además, se incluye toda la funcionalidad de auditoría en relación con los requisitos de la cadena de custodia. El uso del módulo de análisis de datos de NGS con la aplicación Case Management del software Converge permite una comparación simplificada de los perfiles de NGS y CE.

Para el análisis de ADNmt con el panel de genoma completo de ADNmt o el panel de regiones de control de ADNmt Precision ID, el módulo de análisis de datos de NGS Converge proporciona una llamada de variantes sencilla y precisa. El proceso de análisis automatizado de NGS de ADNmt integra diversas fuentes de conocimientos para la variación de ADNmt, incluidos los filoárboles y el EMPOP, con el objeto de ofrecer alineaciones ajustadas y llamadas a variantes para salvar las dificultades de los algoritmos estándar. Los laboratorios interesados en un análisis más avanzado y en la elaboración de informes de tipos de ADNmt pueden obtener información sobre haplotipos y haplogrupos, junto con evaluaciones cuantitativas de heteroplasmia de punto y longitud.

El módulo de NGS del software Converge contiene parámetros de análisis que generan informes desde el panel Precision ID Ancestry y el panel de identidad Precision ID. El análisis de SNP de Converge ofrece una variedad de valores de medición que permiten supervisar la calidad de la secuencia, incluida la cobertura de lecturas alineadas a un punto caliente, el sesgo de la cadena, el número de lecturas que contiene cada base en el punto caliente, la llamada de genotipos y la calidad. El análisis de ancestros terciarios consiste en la generación de una estimación de la predicción de mezclas a partir de siete regiones geográficas: África, América, Asia Oriental, Europa, Oceanía, Asia Meridional y Asia Sudoccidental, y otras verosimilitudes.

Aplicación Case Management
El software Converge está diseñado para aumentar la eficacia de los laboratorios de análisis de ADN forenses y parentescos mediante la centralización de la creación, el análisis y el almacenamiento de los datos en un único punto de acceso. La aplicación Case Management admite la gestión de datos de casos, sujetos, genotipos y laboratorio, además de permitir la transferencia de datos automatizada y la integración con diversos sistemas de laboratorio de ADN forense. El software es altamente configurable y puede adaptarse a flujos de trabajo de laboratorio específicos, no solo a parámetros de análisis, sino también a campos de datos según los procedimientos operativos estándar del laboratorio. Además, permite la configuración de la interfaz de usuario y de los informes de salida, al tiempo que brinda características que ayudan a garantizar la seguridad y la integridad de los datos. Estas funciones son fácilmente accesibles a través de una interfaz segura basada en navegador web bajo la protección del departamento de TI del laboratorio. En la plataforma Converge se puede crear fácilmente una gran variedad de módulos de software para admitir varias aplicaciones forenses.

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