Software LipidSearch™

La lipidómica es fundamental para comprender la fisiología y patología celular. Por su parte, los perfiles de lípidos para los análisis fenotípicos de enfermedades son un campo en rápido crecimiento en la investigación médica traslacional. LC/MS es una técnica eficaz para la identificación y cuantificación de lípidos celulares. El software Thermo Scientific™ LipidSearch™ procesa datos de LC-MS, incluidos los datos de masa exacta de alta resolución que generan los espectrómetros de masas basados en la tecnología Thermo Scientific™ Orbitrap™, para permitir una identificación de lípidos precisa, una cuantificación relativa y la visualización de resultados. Integra automáticamente datos complejos en informes y reduce drásticamente el tiempo de análisis de datos.

El software Thermo Scientific™ LipidSearch™, desarrollado conjuntamente por el Profesor Ryo Taguchi y Mitsui Knowledge Industry Co. (Tokio, Japón), es una herramienta eficaz para la identificación automática y la cualificación relativa de lípidos celulares a partir de datos de LC-MS. El software LipidSearch incluye lo siguiente:

• Compatibilidad con los sistemas de LC-MS de trampa iónica y triple cuadrupolo Orbitrap Thermo Scientific
• Base de datos de lípidos con > 1,5 millones iones de lípidos y sus iones fragmento previstos
• Alineación de datos de lípidos obtenidos a partir de varios experimentos de LC-MS y LC-MSⁿ
• Cuantificación relativa de precursores de lípidos identificados en experimentos de LC-MS o infusión

Detección de picos inteligente para una identificación y cuantificación más precisas

El motor de detección de picos implantado en el software LipidSearch puede incorporar datos procedentes de varios tipos de espectrómetros de masas y varios tipos de experimentos de MS. La combinación de algoritmos de detección de picos exclusivos, adaptados para cada experimento y tipo de instrumento, y funciones de procesamiento espectral de masas garantiza una detección de picos precisa para una mejor identificación y cuantificación.

Extensa base de datos de lípidos para una identificación más completa

La base de datos contiene estructuras definidas e incluye más de 1,5 millones de iones de lípidos y sus iones fragmento previstos. Los patrones de fragmentación se calculan y mejoran aplicando conocimientos expertos y resultados de experimentos. También se incluyen iones aductos de lípidos y huellas de MSⁿ. Los datos se guardan en archivos XML y se personalizan fácilmente.

Algoritmos de identificación doble para incorporar distintos tipos de datos

El software LipidSearch incluye un algoritmo de identificación específico de grupo optimizado para una identificación específica y un algoritmo de identificación general optimizado para una identificación no específica. El algoritmo específico de grupo utiliza barridos iónicos de precursores y barridos de pérdidas neutras para identificar lípidos basados en grupos de cabeza polar y ácidos grasos. El algoritmo de identificación general emplea una combinación de barridos iónicos de productos y comprobación en base de datos para identificar lípidos. El software LipidSearch también incluye algoritmos de clasificación para filtrar los resultados con una probabilidad más baja.

Alineación de picos para una mejor cuantificación

Antes de la cuantificación, los picos cromatográficos extraídos de cada muestra se alinean en un periodo de tiempo de retención, lo que garantiza una cuantificación más exacta.