Disociación por transferencia de electrones (ETD)

Logre un mejor análisis de proteínas y de sus modificaciones postraslacionales (PTM) con la opción de disociación por transferencia de electrones (ETD) Thermo Scientific™. A diferencia de CID, que fragmenta las modificaciones débilmente unidas de la cadena principal del péptido, ETD induce la fragmentación a lo largo de la cadena principal del péptido de forma independiente de la secuencia y deja las modificaciones lábiles unidas a la cadena de péptidos. Esto simplifica en gran medida la identificación de sitios de modificación. ETD produce principalmente iones fragmento del tipo c y z que complementan los iones de tipo b e y producidos por CID, lo que aumenta la cobertura de secuencias y las identificaciones (ID) de proteínas.

La disociación por transferencia de electrones es una herramienta muy útil para el análisis de las proteínas modificadas postranslacionalmente. La capacidad ETD se puede añadir a muchos espectrómetros de masas de Thermo Scientific™ de trampa iónica y Orbitrap™. El software Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ incluye capacidades únicas que ayudan a los usuarios a sacar el máximo partido de la información proporcionada por ETD.

• ETD preserva los PTM lábiles, lo que facilita la identificación de la secuencia de péptidos y el sitio de la modificación.
• Para el análisis top-down, ETD puede combinarse con reacción de transferencia de protones (PTR), lo que simplifica considerablemente los espectros de las proteínas intactas.
• Para los flujos de trabajo que incluyen etiquetas de masas isobáricas de baja masa, ETD se puede combinar con disociación de Q pulsada (PQD) que elimina el valor de corte de masa baja.
• ETD puede añadirse a la mayoría de espectrómetros de trampa iónica Thermo Scientific LTQ y sistemas híbridos de trampa iónica-Orbitrap.
• El software Proteome Discoverer incluye el algoritmo de búsqueda de bases de datos Z-Core exclusivo específicamente optimizado para el espectro de ETD.
• El software Proteome Discoverer puede combinar fácilmente de forma complementaria los resultados de CID y ETD para maximizar la cobertura de la secuencia de proteínas.