pENTR™/SD/D-TOPO™ Cloning Kit, with One Shot™ TOP10 Chemically Competent E. coli
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Invitrogen™

pENTR™/SD/D-TOPO™ Cloning Kit, with One Shot™ TOP10 Chemically Competent E. coli

Los kits de clonación pENTR™/SD/D-TOPO™ emplean una estrategia de clonación extremadamente eficaz de 5 minutos (clonación TOPO™) para clonar deMás información
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K24202020 reacciones
Número de catálogo K242020
Precio (CLP)
-
Cantidad:
20 reacciones
Los kits de clonación pENTR™/SD/D-TOPO™ emplean una estrategia de clonación extremadamente eficaz de 5 minutos (clonación TOPO™) para clonar de forma direccional un producto de PCR de extremo romo en un vector para introducirlo en el sistema Gateway™ o el sistema MultiSite Gateway™. Los productos de PCR de extremo romo se clonan de forma direccional en el vector de entrada pENTR™/SD/D-TOPO™ con una eficacia superior al 90 % e incluyen una secuencia de Shine-Dalgarno de flujo ascendente para la expresión en procariotas.

El kit se suministra con todo lo necesario para clonar y seleccionar el gen de interés amplificado de PCR:

Sistema Gateway™ listo: transporte rápido de los genes clonados entre múltiples sistemas de vectores
Rápido y fácil: de PCR a Gateway™ en solo tres pasos y en tan solo ∼5 minutos de manipulación
Eficaz: logra más del 90 % de los clones con el inserto adecuado en la dirección correcta
Probado: rendimiento fiable durante más de una década

Descripción general de los kits de clonación pENTR™/SD/D-TOPO™

VECTOR

Vector pENTR™/SD/D-TOPO™ Vector de clonación direccional para la entrada al sistema Gateway™ y optimizado para expresión procariota

MÉTODO DE CLONACIÓN

Clonación TOPO™ direccional Ligación direccional basada en topoisomerasa I de ∼5 minutos entre productos de PCR de corrección con polimerasa amplificada con extremo romo y el vector

CÉLULAS COMPETENTES

Dos opciones Elija entre kits con células competentes de crecimiento rápido o alta eficacia
Acceso sencillo al sistema Gateway™
Para acceder al sistema Gateway™, amplifique mediante PCR el gen de interés y añada el producto directamente a la topoisomerasa suministrada y cargada en el vector pENTR™/SD/D-TOPO™, realice una incubación de 5 minutos y transforme las células competentes de E. coli suministradas. Los clones de entrada de Gateway™ que contienen attL están listos para someterse a una recombinación eficaz con los vectores de destino Gateway™ seleccionados.

Vector pENTR™/SD/D-TOPO™ optimizado
El vector pENTR™/SD/D-TOPO™ (Figura 1) incluye un potenciador traslacional del gen 10 de T7 y un emplazamiento de unión al ribosomas (RBS) para una expresión óptima de la proteína nativa después de la recombinación con vectores de destino Gateway™ procarióticos. También puede utilizar el vector para la expresión en otros sistemas huéspedes mediante la recombinación con diferentes vectores de destino El vector cuenta con emplazamientos de secuenciación de primers M13 y T7, así como emplazamientos de recombinación de attL que flanquean el emplazamiento del inserto del producto de PCR. Esto permite verificar fácilmente la secuencia de los clones y realizar la recombinación deseada de los vectores de destino Gateway™ que contienen attR. Se emplea un gen de resistencia a kanamicina y un origen de pUC para la selección y la propagación de número de copias alto en E. coli.

Clonación direccional simplificada
Gracias a la tecnología de clonación TOPO™, no hay necesidad de realizar acciones como limpieza de PCR, preparación de vectores u otros pasos de manipulación de ADN que consumen mucho tiempo. Solo tiene que añadir su reacción de PCR directamente al vector cargado con la topoisomerasa suministrado, incubar 5 minutos, transformar y obtener clones insertados de forma direccional en hasta un 90 %. Una protuberancia con cuatro bases de los pares del vector con una secuencia de cuatro bases diseñada en el primer directo empleado en la reacción de PCR para ofrecer direccionalidad a la reacción de ligación de la topoisomerasa (figura 2).

La potencia de la tecnología de clonación de recombinación Gateway™
La tecnología de clonación de recombinación Gateway™ sortea las limitaciones de la clonación con restricciones, lo que le permite tener acceso a prácticamente cualquier sistema de expresión en tan solo una hora, con una reacción de recombinación Gateway™ reversible y eficaz al 99 %. La capacidad para mover la misma secuencia de ADN entre distintos vectores sin el uso de enzimas de restricción, ligasa, pasos de subclonación, detección de innumerables colonias o resecuenciación ayudará a ahorrar tiempo, dinero y esfuerzo.

Principales tecnologías de clonación
En el campo de la clonación, la tecnología de clonación TOPO™ y la tecnología de clonación de recombinación Gateway™ han sido unos socios fiables durante más de diez años para miles de científicos. La clonación TOPO™ y la recombinación Gateway™ resultan rápidas, fáciles de usar y eficaces; además, permiten agilizar la clonación y la posterior transferencia de genes entre una amplia variedad de vectores de expresión Gateway™.

Opciones del kit
El kit de clonación pENTR™/SD/D-TOPO™ se puede adquirir con células competentes TOP10 para una clonación estándar o bien con células competentes Mach1™-T1R para un crecimiento rápido.
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Método de clonaciónTOPO™ direccional
N.º de reacciones20 reactions
Línea de productosOne Shot
Tipo de productoKit de clonación TOPO
Cantidad20 reacciones
VectorpENTR
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
El kit de clonación pENTR™⁄SD⁄D-TOPO™ contiene un vector pENTR⁄SD⁄D-TOPO™, dNTP, solución salina, agua estéril, primers de secuenciación M13 universales, E. coli TOP10 químicamente OneShot™, medio SOC. y un plásmido de control de pUC19. Almacene la E. coli competente a -80 °C. Almacene todos los demás componentes a - 20 °C.

Preguntas frecuentes

Your Gateway-adapted TOPO vectors are supplied with a control template and control primers. Can I obtain the sequence of the control template?

The sequence of the control template is proprietary.

I am using a Directional TOPO Cloning vector for cloning my PCR product. I have screened a bunch of colonies but they all contain my insert cloned in the reverse direction. How can I solve this problem?

Here are possible causes and suggestions:

- Incorrect PCR primer design: Make sure that the forward PCR primer contains the sequence, CACC, at the 5' end. The 4 nucleotides, CACC, base pair with the overhang sequence, GTGG, in the Directional TOPO vector.
- Reverse PCR primer is complementary to the GTGG overhang at the 5' end: Make sure that the reverse PCR primer does not contain the sequence, CACC, at the 5' end.
- Use a thermostable, proofreading polymerase such as Accuprime Pfx DNA Polymerase (Cat. No. 12344024) to produce blunt-end PCR products.

What is the best molar ratio of PCR product:vector to use for TOPO TA cloning? Is there an equation to calculate the quantity to use?

We suggest starting with a molar ratio of 1:1 (insert:vector), with a range of 0.5:1 to 2:1. The quantity used in a TOPO cloning reaction is typically 5-10 ng of a 2 kb PCR product.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 (insert:vector ratio)

What is the best ratio of insert:vector to use for cloning? Is there an equation to calculate this?

The optimal ratio is 1:1 insert to vector. Optimization can be done using a ratio of 0.5-2 molecules of insert for every molecule of the vector.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 insert:vector ratio

I am cloning my gene of interest into the pENTR/SD/D-TOPO vector, but plan on expressing my gene in both E.coli and mammalian cells. Will the Shine-Dalgarno sequence interfere with mammalian expression?

No, the Shine-Dalgarno sequence does not adversely affect mammalian expression when used in an appropriate mammalian DEST vector.

Citations & References (1)

Citations & References
Abstract
Pseudomonas syringae type III secretion system targeting signals and novel effectors studied with a Cya translocation reporter.
Authors:Schechter LM, Roberts KA, Jamir Y, Alfano JR, Collmer A,
Journal:J Bacteriol
PubMed ID:14702323
Pseudomonas syringae pv. tomato strain DC3000 is a pathogen of tomato and Arabidopsis: The hrp-hrc-encoded type III secretion system (TTSS), which injects bacterial effector proteins (primarily called Hop or Avr proteins) into plant cells, is required for pathogenicity. In addition to being regulated by the HrpL alternative sigma factor, most ... More