Ion Reporter™ Server System
Ion Torrent™

Ion Reporter™ Server System

Der Ion Reporter Server hostet eine lokal bereitgestellte Instanz der Ion Reporter Software, die eine optimierte Suite einfacher Datenanalyse-Tools mitWeitere Informationen
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KatalognummerMenge
4487118jeweils 1
Katalognummer 4487118
Preis (EUR)
-
Menge:
jeweils 1
Der Ion Reporter Server hostet eine lokal bereitgestellte Instanz der Ion Reporter Software, die eine optimierte Suite einfacher Datenanalyse-Tools mit der Kontrolle und dem Zugriff auf einen leistungsstarken Computerserver in Ihrem eigenen Gebäude kombiniert. Die Ion Reporter Software unterstützt die Analyse von Daten aus Ion Torrent Next-Generation-Sequenzierungssystemen (NGS), die eine wachsende Anzahl von Forschungsanwendungen abdecken, von der Erkennung menschlicher Varianten bis hin zur mikrobiellen Vielfalt.

Der Arbeitsablauf der Ioneninformatik gewährleistet qualitativ hochwertige Daten, priorisiert und kommentiert Treibervarianten und ergänzt mit einem Bericht, der Ihren Bioinformatik-Weg zur Entdeckung vereinfacht, indem Sie sich auf das Finden der biologischen Bedeutung Ihrer Daten konzentrieren können.

Automatisierte Arbeitsabläufe für Effizienz
Die Ion Reporter Software unterstützt vorkonfigurierte Arbeitsabläufe für viele Forschungsanwendungen, einschließlich Krebs, Erbkrankheiten, reproduktiver Gesundheit und Forschung an Infektionskrankheiten.

Der Ion Reporter Server ist so konzipiert, dass er den Arbeitsablauf von der Probe bis zum Bericht automatisiert. Wenn ein Sequenzierungslauf auf einem Ion Torrent Sequenzer gestartet wird, kann ein Ion Reporter-Arbeitsablauf als Teil des Sequenzierungslaufplans ausgewählt werden, sodass die Datenübertragung und -analyse von der Ausführungsinitiierung bis zur Überprüfung kommentierter Varianten automatisiert werden. Dies spart Zeit und ermöglicht Ihnen schnellere Antworten mit einer optimierten, automatisierten Datenübertragung und -analyse. Integrieren Sie die Ion Reporter Software in Ihre Forschungslaborumgebung mit den bereitgestellten APIs, einschließlich der APIs für die automatisierte Datenextraktion.

Vorteile des Ion Reporter-Servers
• Standort in Ihrer sicheren Laborumgebung
• Speziell konfiguriert für die erweiterte Analyse und Beschriftung von Ion Reporter-Arbeitsabläufen
• Service, Support und Software für ein Jahr

Für Genauigkeit konzipierte Bioinformatik
Die Handhabung, und letztendlich die Interpretation der beträchtlichen Mengen an Variantendaten, die von NGS produziert werden, stellt eine gewaltige Herausforderung dar. Der Ion Reporter Informatik-Arbeitsablauf sorgt dafür, dass Sie qualitativ hochwertige Daten erhalten, indem Sie Treibervarianten priorisieren und mit Anmerkungen versehen. Er wird mit einem Bericht ergänzt, der Ihren Bioinformatik-Weg zum Entdecken vereinfacht, indem Sie sich auf das Finden der biologischen Bedeutung Ihrer Daten konzentrieren können.

So wird beispielsweise für die Tumorveränderungslast (TMB) ein benutzerdefinierter Variantenaufruf und ein Keimbahn-Variantenfilteralgorithmus verwendet, um somatische Varianten in der Krebsforschungsprobe genau zu einzuschätzen. Der Nachweis von SNPs, Indels, CNVs, Genfusionen und Aneuploidien in einem einzigen automatisierten Arbeitsablauf wird durch die Verwendung unserer individuellen Keimbahn-Algorithmen und somatischen Algorithmen ermöglicht. Die Konsistenz zwischen den verschiedenen Versionen der Software wird durch die Überprüfung jeder Version mit einer Mischung aus Kontrollproben und klinischen Forschungsproben hergestellt, wobei relevante Varianten gemessen werden, die zuvor mit einer anderen Technologie erkannt wurden. Diese Arbeitsabläufe können zur Analyse einer Vielzahl von Forschungsproben verwendet werden, z. B. Einzelproben, gepaarte Tumor-/Normalproben und Familientrios. Die Arbeitsabläufe sind flexibel, um eine individuelle Optimierung zu ermöglichen, und können auch gesperrt werden, um eine kontrollierte Verwendung zu ermöglichen, ohne auf die fortgeschrittenen Fähigkeiten eines Bioinformatikers zu verzichten.

Vorteile der Ion Reporter-Software
• Automatisierte Abläufe mit Lesezuordnung, Variantenaufruf und vollständiger Beschriftung aus über 25 öffentlichen und firmeneigenen Datenbanken
• Flexibilität vorkonfigurierter und anpassbarer Abläufe, die auf Genauigkeit und Konsistenz getestet wurden
• Kontrollierter Zugriff mit rollenbasierten Anmeldungen, gesperrte Abläufe und Prüfprotokolle zur Pflege einer rückverfolgbaren und sicheren Umgebung

Services und Support
Service- und Supportpläne—umfassende Pläne zur Maximierung der Geräteleistung und zur Sicherstellung der Verfügbarkeit wichtiger Systeme
Schulung—Kurse für Versuchsaufbau, Datenanalyse, Fehlerbehebung, Anwendungen und Gerätebetrieb
Bioinformatik—Maßgeschneiderte Unterstützung für NGS-Informatikausführung, Softwarenverwendung, Datenanalyse und nachgelagerte Anwendungen
DataSafe Solution—Speicher- und Backup-Strategie, Design, Hardware und Support für alle Labordaten

Weitere Informationen über das Ion Reporter Server System und zugehörige Produkte finden Sie im nachstehenden Flyer zum Ion Reporter Server System.

Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.

Specifications
BeschreibungIon Reporter Server
• Latest release version: 5.20
• Server shipping version: 5.16
Zur Verwendung mit (Geräte)Ion GeneStudio S5 System, Ion PGM™ System, Ion Proton™ System, Ion S5™ XL System
BetriebssystemUbuntu
Mengejeweils 1
SoftwarekategorieAnalysis
ProduktlinieIon Reporter Software
Software TypeInformatics Tools
Unit SizeEach
Inhalt und Lagerung
• Ion Reporter Software, includes first year software license
• 1 Dell T440 computer server
• Field installation of computer server and software

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

Analyses on my local Ion Reporter server are running slow. What can I do to improve the speed?

While launching too many analyses at the same time can cause slowness, server resources are split between running analyses and visualization of data. You can choose to optimize these resources to run more concurrent analyses and have them complete faster, if desired. Or you can choose to optimize these resources to run fewer concurrent analysis and dedicate more resources to visualization, if that is a priority. This balance can be adjusted at any time by your Ion Reporter organization administrator.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Next-Generation Sequencing Support Center.