Proteome Discoverer Software

Identifizieren und quantifizieren Sie Peptide und Proteine in komplexen biologischen Proben mit der Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ Software. Die Proteome Discoverer Software vereinfacht verschiedenste Proteomik-Arbeitsabläufe von der Protein- und Peptididentifikation über die PTM-Analyse und die isobare Massenmarkierung bis hin zu SILAC und zur markierungsfreien Quantifizierung. Mehrere Datenbanksuchalgorithmen und verschiedene Dissoziationsverfahren werden unterstützt. Mit dem intelligenten INFERYS™ Rescoring und dem intelligenten Suchalgorithmus CHIMERYS™ von MSAID erhöhen Sie die Anzahl der eindeutigen Peptididentifizierungen erheblich und gehen so über das Suchen hinaus zum Entdecken.

Die Proteome Discoverer Software unterstützt verschiedene Dissoziations- und Quantifizierungsverfahren sowie Algorithmen für die Suche in Datenbanken zur umfangreichen Identifizierung, Charakterisierung und Quantifizierung von Proteinen.

 

Umfassend

• Optimiert die Verarbeitung Ihrer Proteinforschungsdaten durch flexible, integrierte oder anpassbare Arbeitsabläufe
• Entdecken Sie mehr mit den intelligenten Algorithmen INFERYS Rescoring und CHIMERYS
• Unterstützt mehrere Dissoziationsverfahren (HCD, CID, ETD und UVPD) für eine bessere Abdeckung und für eine zuverlässige Identifizierung von PTMs
• Unterstützt die isobare Massenmarkierung (TMT, iTRAQ), Isotopenmarkierung (SILAC) und markierungsfreie Quantifizierung
• Validiert Peptid- und Protein-IDs mit Falscherkennungsrate (FDR)
• Unterstützt Knoten für Top-down (ProsightPD), strukturelle Biologie und Crosslinking-Analysen (XL-MS)

Produktiv und erweiterbar

• Automatisiert die Datenanalyse und vereinfacht die MSⁿ-Datenanalyse durch vorgefertigte und anpassbare Arbeitsabläufe
• Beinhaltet Studienmanagement für die Zuordnung der Quantifizierung zu biologischen Informationen über die Probe
• Verwenden Sie die Ergebnisse, um die Datenerfassung zu verfeinern, z. B. durch Exportieren von Ein- und Ausschlusslisten für den direkten Import in Gerätemethoden
• Veranschaulicht den biologischen Kontext durch automatische Annotation von identifizierten Proteinen mit GO-Klassifizierungen, PTM-Stellen und Literaturverweisen aus öffentlich zugänglichen Datenbanken
• Erleichtert das Vergleichen, Austauschen und Verifizieren von Daten mit Unterstützung für Datenstandards der HUPO Proteomics Standards Initiative (PSI)
• Unterstützt Knoten von Drittanbietern für die Datenverarbeitung und ermöglicht die Verarbeitung großer Datensätze
• Schnelle, robuste Algorithmen mit künstlicher Intelligenz für die Peakauswahl und Peptidquantifizierung zur Gewinnung weiterer Informationen
• Erhalten Sie zuverlässige Statistiken und validieren Sie Quantifizierungsergebnisse visuell