Software ProSightPD

Realice un análisis completo de los datos de proteómica de arriba a abajo con el software Thermo Scientific™ ProSightPD™. ProSightPD cuenta con potentes motores de búsqueda de proteómica para la caracterización de proteoformas, incluidas las proteoformas con PTM o truncamientos desconocidos. El software ProSightPC admite datos proteómicos generados por técnicas de fragmentación presentes en cualquier espectrómetro de masas Thermo Scientific. El software ProSightPC es el único software de proteómica que permite al usuario buscar datos de MS/MS con facilidad en bibliotecas de proteómica que contienen la complejidad biológica presente en UniProt.

• Incluye cinco modos de búsqueda de bases de datos diferentes: etiqueta de secuencia, proteína única y restricción de genes para búsquedas restringidas Gene para una caracterización de proteínas intactas excepcional.
• Realiza cálculos de tasa de descubrimiento falsos a nivel de éxito de proteínas, isoformas, proteoforas y proteoforas.
• Procesa muchos tipos diferentes de datos de fragmentación, incluidos los datos generados mediante ETD, HCD, EThcD, UVPD, ECD, IRMPD o CID.
• Permite la combinación de mapas de fragmentos gráficos, incluidos los que presenten distintos tipos de iones.
• Incluye exclusivos ProSight que contienen todas las modificaciones postraduccionales (PTM) conocidas, eventos de empalmes alternativos y polimorfismos de un solo nucleótido (SNP).
• Ofrece un análisis de masas de precursor más potente, con datos FAIMS y PTR ahora listos para su análisis mediante el software ProSightPD. Los datos de alta y baja resolución se pueden procesar con los algoritmos Xtract y respetar incorporados en el software ProSightPD, lo que permite analizar masas de una amplia gama de masas (de ∼ 1 kDa a > 150 kDa).
• Importa bases de datos XML y FASTA y las anota de forma ultrarrápida con todas las modificaciones posibles.
• Permite a los usuarios experimentar una visualización versátil e incomparable para revisar los resultados de la búsqueda y personalizar las modificaciones para encontrar resultados más pertinentes.