Ion Reporter™ Server System
Ion Torrent™

Ion Reporter™ Server System

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Le serveur Ion Reporter héberge une instance déployée localement du logiciel Ion Reporter, combinant une suite optimisée d’outils d’analyse de données simples avec le contrôle et l’accès d’un serveur informatique puissant dans votre propre bâtiment. Le logiciel Ion Reporter prend en charge l’analyse des données des systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS) Ion Torrent, couvrant un nombre croissant d’applications de recherche, de la détection des variantes humaines à la diversité microbienne.

Le flux de travaux informatiques Ion garantit des données de haute qualité, donne la priorité aux variantes pilotes et les annote, et fournit un rapport pour simplifier votre voie vers la découverte bio-informatique en vous permettant de vous concentrer sur la signification biologique de vos données.

Flux de travaux automatisés pour l’efficacité
Le logiciel Ion Reporter prend en charge les flux de travaux préconfigurés pour de nombreuses applications de recherche, notamment le cancer, les maladies héréditaires, la santé reproductive et la recherche sur les maladies infectieuses.

Le serveur Ion Reporter est conçu pour automatiser le flux de travaux de l’échantillon au rapport. Lorsqu’un cycle de séquençage est lancé sur un séquenceur Ion Torrent, un flux de travaux Ion Reporter peut être sélectionné dans le cadre du plan de séquençage afin que le transfert et l’analyse des données soient automatisés, du début du séquençage à l’examen des variantes annotées. Cela vous permet de gagner du temps et d’obtenir des réponses plus rapidement grâce à un transfert et une analyse des données rationalisés et automatisés. Améliorez l’intégration du logiciel Ion Reporter dans votre environnement de laboratoire de recherche avec les API fournies, y compris celles pour l’extraction automatisée des données.

Avantages du serveur Ion Reporter
• Situé dans votre environnement de laboratoire sécurisé
• Configuré spécifiquement pour gérer l’annotation et l’analyse avancée des flux de travaux Ion Reporter
• Entretien, assistance et logiciel fournis pendant un an

Bio-informatique conçue pour la précision
La gestion et, à terme, l’interprétation des quantités importantes des données sur les variantes produites par NGS représentent un défi considérable. Le flux de travaux informatique Ion Reporter vous permet d’obtenir des données de haute qualité en annotant les variantes pilotes et en leur donnant la priorité. Il termine avec un rapport qui simplifie votre parcours de découverte en bio-informatique en vous permettant de vous concentrer sur la signification biologique de vos données.

Par exemple, pour la charge mutationnelle tumorale (TMB), un algorithme personnalisé de classification de variantes et de filtrage des variantes germinales est utilisé pour estimer avec précision les variantes somatiques dans l’échantillon de recherche sur le cancer. La détection de SNP, d’indels, de CNV, de fusions de gènes et d’aneuploïdies dans un seul flux de travaux automatisé est possible grâce à nos algorithmes germinal et somatique personnalisés. La régularité entre les versions du logiciel est établie en vérifiant chaque version avec un ensemble d’échantillons de contrôle et de recherche clinique, en mesurant les variantes pertinentes qui ont déjà été détectées avec une autre technologie. Ces flux de travaux peuvent être utilisés pour analyser une variété d’échantillons de recherche, tels que des échantillons uniques, des échantillons de tumeurs appariées ou normaux et des trios familiaux. Les flux de travaux sont flexibles pour permettre une optimisation personnalisée, et peuvent également être verrouillés pour permettre une utilisation contrôlée sans dépendre des compétences avancées d’un bio-informaticien.

Avantages du logiciel Ion Reporter
• Flux de travaux automatisés avec cartographie de lecture, classification de variantes et annotation complète à partir de plus de 25 bases de données publiques et exclusives
• Flexibilité des flux de travaux préconfigurés et personnalisables, dont la précision et la cohérence ont été testées
• Accès contrôlé avec des logins selon les rôles, des flux de travaux verrouillés, et des journaux de connexion pour maintenir un environnement traçable et sécurisé

Entretien et assistance
Programme d’entretien et assistance—programmes complets pour optimiser les performances des instruments et garantir la disponibilité des systèmes essentiels
Formation—cours pour la conception expérimentale, l’analyse des données, le dépannage, les applications et le fonctionnement des instruments
Bio-informatique—assistance personnalisée concernant l’exécution informatique du NGS, l’utilisation des logiciels, l’analyse des données et les applications en aval
Solution DataSafe—stratégie de stockage et de sauvegarde, conception, matériel, et assistance pour toutes les données de laboratoire

Pour plus d’informations sur le système serveur Ion Reporter et sur les produits associés, veuillez télécharger la brochure relative au système serveur Ion Reporter ci-dessous.

Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.

Spécifications
DescriptionIon Reporter Server
• Latest release version: 5.20
• Server shipping version: 5.16
À utiliser avec (équipement)Ion GeneStudio S5 System, Ion PGM™ System, Ion Proton™ System, Ion S5™ XL System
Système d’exploitationUbuntu
Quantité1 de chaque
Catégorie de logicielAnalysis
Gamme de produitsIon Reporter Software
Software TypeInformatics Tools
Unit SizeEach
Contenu et stockage
• Ion Reporter Software, includes first year software license
• 1 Dell T440 computer server
• Field installation of computer server and software

Foire aux questions (FAQ)

Analyses on my local Ion Reporter server are running slow. What can I do to improve the speed?

While launching too many analyses at the same time can cause slowness, server resources are split between running analyses and visualization of data. You can choose to optimize these resources to run more concurrent analyses and have them complete faster, if desired. Or you can choose to optimize these resources to run fewer concurrent analysis and dedicate more resources to visualization, if that is a priority. This balance can be adjusted at any time by your Ion Reporter organization administrator.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Next-Generation Sequencing Support Center.