Logiciel Proteome Discoverer

Identifiez et quantifiez les peptides et les protéines dans des échantillons biologiques complexes à l’aide du logiciel Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™. Le logiciel Proteome Discoverer simplifie une large gamme de flux de travaux en protéomique, depuis l’identification des protéines et des peptides en passant par l’analyse des modifications post-traductionnelles jusqu’aux techniques de marquage de masse isobare avec l’analyse quantitative SILAC et sans marquage. Il prend en charge plusieurs algorithmes de recherche de bases de données et plusieurs techniques de dissociation. Allez au-delà de la recherche et de la découverte grâce aux algorithmes de recherche intelligents INFERYS™ Rescoring et à l’algorithme de recherche intelligent CHIMERYS™ de MSAID pour augmenter considérablement le nombre d’identifications de peptides uniques.

Le logiciel Proteome Discoverer prend en charge les multiples techniques de dissociation, les technologies d’analyse quantitative et les algorithmes de recherche dans les bases de données pour l’identification, la caractérisation et l’analyse quantitative des protéines.

 

Solution complète

• Rationalise le traitement de vos données de recherche sur les protéines grâce à des flux de travaux flexibles, intégrés ou personnalisables
• Découvrez davantage d’informations au sujet des algorithmes intelligents INFERYS Rescoring et CHIMERYS
• Prend en charge les multiples techniques de dissociation (HCD, CID, ETD et UVPD) pour une couverture plus complète et l’identification fiable des PTM
• Prend en charge le marquage de masse isobare (TMT, iTRAQ), le marquage isotopique (SILAC) et la quantification sans marquage
• Valide l’identification des peptides et des protéines à l’aide de la détermination du taux de fausses découvertes (FDR)
• Accueille les nœuds pour la biologie descendante (ProSightPD) et structurelle et l’analyse de réticulation (XL-MS)

Productif et extensible

• Automatise l’analyse des données et simplifie l’analyse des données MS grâce à des flux de travaux prédéfinis et personnalisables
• De la gestion d’études pour la cartographie des analyses quantitatives à l’information biologique sur les échantillons
• Utilisez les résultats pour affiner la collecte de données, comme l’exportation de listes d’inclusion et d’exclusion pour l’importation directe dans les méthodes d’instruments
• Illustre le contexte biologique en annotant automatiquement les protéines identifiées avec les classifications GO (Gene Ontology), les sites de modification post-translationnelle (PTM) et les références bibliographiques des bases de données publiques
• Facilite la comparaison, l’échange et la vérification des données grâce à la prise en charge des normes relatives aux données développées par l’HUPO Proteomics Standards Initiative (PSI)
• Prend en charge les nœuds tiers pour le traitement des données et permet le traitement des ensembles de données volumineux
• Algorithmes rapides et robustes, dotés d’une intelligence artificielle pour la sélection des pics et la quantification des peptides, afin d’extraire plus d’informations
• Obtenez des statistiques fiables et validez visuellement les résultats de la quantification