Ion Torrent™

Ion Xpress™ RNA-Seq Barcode 1-16 Kit

The new Ion Xpress™ RNA-Seq Barcode 1-16 Kit provides a set of 16 unique barcode primers for sequencing RNA on the Ion Torrent PGM™ semiconductor sequencer.

카탈로그 번호	수량
4475485	160 Reactions

카탈로그 번호 4475485

제품 가격(KRW)

3,513,000

160 Reactions

제품 가격(KRW)

3,513,000

The new Ion Xpress™ RNA-Seq Barcode 1-16 Kit provides a set of 16 unique barcode primers for sequencing RNA on the Ion Torrent PGM™ semiconductor sequencer. When used in combination with the Ion Total RNA-Seq Kit v2 (Cat. No. 4475936), the Ion Xpress™ RNA-Seq Barcode 1-16 Kit enables users to pool up to 16 fragment libraries prior to template preparation and then conduct multiplexed sequencing analysis, simplifying the Ion semiconductor sequencing workflow for small and whole transcriptome RNA.

새로운 Ion Xpress™RNA-Seq Barcode 1-16 Kit는 Ion Torrent PGM™semiconductor sequencer에서 RNA를 sequencing하기 위한 16개 고유한 바코드 primer 세트를 제공합니다. Ion Xpress™RNA-Seq Barcode 1-16 Kit 를 Ion Total RNA-Seq Kit v2와 함께 사용하면 사용자가 template prep 과정 전에 최대 16개 fragment 라이브러리를 pooling하여 multiplexed sequencing 분석을 수행할 수 있어 small RNA 또는 전체 transcriptome RNA에 대한 Ion semiconductor sequencing 워크플로우를 간편하게 합니다.

특징 및 장점:
• 효율적인 multiplexing- 단일 sequencing chip에서 최대 16개 fragment 라이브러리를 multiplexing할 수 있습니다.
• 통합 pool 내 모든 바코드를 동일하게 제시할 수 있도록 sequence와 flow 둘 다에 최적화됩니다.
• Multiplexing으로 sequencing 비용과 template prep 관련 작업시간이 최소화됩니다.
• 확실한 샘플 확인 과정을 위한 design으로 강력한 오류 보정

바코드 Primer를 이용한 효율적인 multiplexing으로 Higher Throughput 샘플 Sequencing 가능
바코드 라이브러리로 Multiplexing하면 비용 효과적으로 한 번에 최대 16개 샘플을 처리할 수 있어 template prep과 sequencing 비용 등이 크게 감소합니다.

성능 및 효율성 증진을 위한 Sequence 및 Flow 최적화
바코드 primer에는 통합 pool 내 모든 바코드를 동일하게 제시하도록 최적화된 sequence가 들어있어 최소한의 flow 수만 조사할 수 있고 바코드와 adaptor sequencing의 20개 염기만 필요하여 보다 경제적인 multiplex sequencing이 가능합니다.

효율적인 설계로 인한 강력한 오류 보정
내제된 오류 보정으로 올바르지 않은 샘플 배정 가능성을 크게 최소화합니다.

Ion Xpress™ RNA-Seq Barcode 01-16 Kit는 바코드 당 multiplex 라이브러리 10개 또는 총 160개 multiplex 라이브러리를 생성할 수 있도록 고안되었습니다.

연구용으로만 사용할 수 있습니다. 치료 또는 진단 목적으로 동물이나 사람에게 사용할 수 없습니다.

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

용도(장비)Ion GeneStudio™ S5 Series Sequencer, Ion Chef™ System

반응 수160

수량160 Reactions

배송 조건Dry Ice

워크플로우 단계Library Barcoding

Unit SizeEach

구성 및 보관
• Ion Xpress™ RNA BC 01–BC 16, 16 x 12 μL tubes, store at 20°C
• Ion Xpress™ RNA 3' Barcode Primer, 1 x 192 μL, store at 20°C

자주 묻는 질문(FAQ)

Where can I find the sequences for the Ion Xpress RNA-Seq Barcodes 1-16 (Cat. No. 4475485)?

The Ion Xpress RNA-Seq Barcode 1-16 sequences are the same as the DNA library Ion Xpress Barcode Adapter 1-16 sequences and can be found under References in the Torrent Browser.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Next-Generation Sequencing Support Center.

Why does the Ion Total RNA-Seq Kit v2 (Cat. No. 4475936) specifically require the Ion Xpress RNA-Seq Barcodes 1-16 Kit (Cat. No. 4475485)? Why can't I use the DNA barcodes provided in the Ion Xpress Barcode Adaptors 1-96 Kit (Cat. No. 4474517)?

The Ion Total RNA-Seq Kit v2 workflow uses a different method for adding the barcode sequences to the library than the standard Ion DNA libraries. For standard DNA library construction, the barcoded adapters are directly ligated to the DNA inserts. For Ion Total RNA-Seq libraries, the barcode adapter sequence is added during the final library amplification.

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How many samples can I multiplex on a single chip for sequencing on the Ion PGM or Proton System?

The number of samples that can be multiplexed in a single sequencing run depends on the capacity of the chip, the size of the library, and the required coverage. A table of approximate capacities based on the size of the library and chip can be found in the Ion Ampliseq Preparation User Guide (https://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/MAN0006735_AmpliSeq_DNA_RNA_LibPrep_UG.pdf) within the section “Strategies for combining Ion Ampliseq libraries.”

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